முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை - இல்லுமினா
அம்சங்கள்
● முழுமையான டிரான்ஸ்கிரிப்டோமை வரிசைப்படுத்த இரட்டை நூலகம்: ஆர்ஆர்என்ஏ குறைப்பு, அதைத் தொடர்ந்து PE150 லைப்ரரி தயாரித்தல் மற்றும் அளவைத் தேர்ந்தெடுப்பது, அதைத் தொடர்ந்து SE50 நூலகத் தயாரிப்பு
● தனித்தனி உயிர் தகவலியல் அறிக்கைகளில் mRNA, lncRNA, circRNA மற்றும் miRNA ஆகியவற்றின் முழுமையான உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு
● ceRNA நெட்வொர்க்குகள் பகுப்பாய்வு உட்பட, ஒருங்கிணைந்த அறிக்கையில் அனைத்து RNA வெளிப்பாடுகளின் கூட்டு பகுப்பாய்வு.
சேவை நன்மைகள்
●ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளின் ஆழமான பகுப்பாய்வு: ceRNA நெட்வொர்க் பகுப்பாய்வு mRNA, lncRNA, circRNA மற்றும் miRNA ஆகியவற்றின் கூட்டு வரிசைமுறை மற்றும் ஒரு முழுமையான உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வு மூலம் செயல்படுத்தப்படுகிறது.
●விரிவான சிறுகுறிப்பு: டிஃபரன்ஷியலி எக்ஸ்பிரஸ்டு ஜீன்களை (DEGs) செயல்பாட்டு ரீதியாக சிறுகுறிப்பு செய்ய பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம் மற்றும் தொடர்புடைய செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வைச் செய்கிறோம்.
●விரிவான நிபுணத்துவம்: பல்வேறு ஆராய்ச்சிக் களங்களில் 2000 முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் திட்டங்களை வெற்றிகரமாக முடித்ததன் சாதனைப் பதிவுடன், எங்கள் குழு ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் அனுபவச் செல்வத்தைக் கொண்டுவருகிறது.
●கடுமையான தரக் கட்டுப்பாடு: மாதிரி மற்றும் நூலக தயாரிப்பு முதல் வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் உயிர் தகவலியல் வரை அனைத்து நிலைகளிலும் முக்கிய கட்டுப்பாட்டு புள்ளிகளை நாங்கள் செயல்படுத்துகிறோம்.இந்த உன்னிப்பான கண்காணிப்பு நிலையான உயர்தர முடிவுகளை வழங்குவதை உறுதி செய்கிறது.
● விரிவான சிறுகுறிப்பு: டிஃபரன்ஷியலி எக்ஸ்பிரஸ்டு ஜீன்களை (DEGs) செயல்பாட்டு ரீதியாக சிறுகுறிப்பு செய்ய பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம் மற்றும் தொடர்புடைய செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வைச் செய்கிறோம்.
●விற்பனைக்கு பிந்தைய ஆதரவு: எங்கள் அர்ப்பணிப்பு 3 மாத விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைக் காலத்துடன் திட்ட நிறைவுக்கு அப்பால் நீண்டுள்ளது.இந்த நேரத்தில், நாங்கள் திட்டப் பின்தொடர்தல், சரிசெய்தல் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான ஏதேனும் கேள்விகளுக்கு தீர்வு காண கேள்வி பதில் அமர்வுகளை வழங்குகிறோம்.
மாதிரி தேவைகள் மற்றும் விநியோகம்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி | தரவு பரிந்துரைக்கப்படுகிறது | தர கட்டுப்பாடு |
| rRNA குறைக்கப்பட்டது | இல்லுமினா PE150 | 16 ஜிபி | Q30≥85% |
| அளவு தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டது | இல்லுமினா SE50 | 10-20M படிக்கிறது |
மாதிரி தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
| Conc.(ng/μl) | தொகை (μg) | தூய்மை | நேர்மை |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 வரையறுக்கப்பட்ட அல்லது புரதம் அல்லது டிஎன்ஏ மாசுபாடு ஜெல் மீது காட்டப்படவில்லை. | தாவரங்கள்: RIN≥6.5 விலங்கு: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; வரையறுக்கப்பட்ட அல்லது அடிப்படை உயரம் இல்லை |
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
கொள்கலன்:
2 மில்லி மையவிலக்கு குழாய் (தகரம் படலம் பரிந்துரைக்கப்படவில்லை)
மாதிரி லேபிளிங்: குழு+பிரதி எ.கா. A1, A2, A3;பி1, பி2, பி3......
ஏற்றுமதி:
1.உலர் பனி: மாதிரிகளை பைகளில் அடைத்து உலர்-பனியில் புதைக்க வேண்டும்.
2.ஆர்என்ஏ ஸ்டேபிள் குழாய்கள்: ஆர்என்ஏ ஸ்டேபிலைசேஷன் குழாயில் ஆர்என்ஏ மாதிரிகள் உலர்த்தப்பட்டு அறை வெப்பநிலையில் அனுப்பப்படும்.
சேவை வேலை ஓட்டம்
சோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்என்ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
உயிர் தகவலியல்
RNA வெளிப்பாடு மேலோட்டம்
வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள்
ceRNA பகுப்பாய்வு
வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மைஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் தொடர்புடைய ஆர்என்ஏக்கள்
BMKGene' முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங் சேவைகள் மூலம் எளிதாக்கப்பட்ட ஆராய்ச்சி முன்னேற்றங்களை, பிரசுரங்களின் தொகுப்பின் மூலம் ஆராயுங்கள்.
டேய், ஒய். மற்றும் பலர்.(2022) 'ஆர்என்ஏ-சீக்வென்சிங் மூலம் அடையாளம் காணப்பட்ட காஷின்-பெக் நோயில் எம்ஆர்என்ஏக்கள், எல்என்சிஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் மைஆர்என்ஏக்களின் விரிவான வெளிப்பாடு சுயவிவரங்கள்', மூலக்கூறு ஓமிக்ஸ், 18(2), பக். 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
லியு, என். நன் மற்றும் பலர்.(2022) 'சங்பாய் மலையில் உள்ள அபிஸ் செரானாவின் குளிர்-எதிர்ப்பின் முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு.', ஜீன், 830, பக். 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
வாங், எக்ஸ்ஜே மற்றும் பலர்.(2022) 'சிறு செல் நுரையீரல் புற்றுநோயில் போட்டியிடும் எண்டோஜெனஸ் ஆர்என்ஏ ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளின் மல்டி-ஓமிக்ஸ் ஒருங்கிணைப்பு அடிப்படையிலான முன்னுரிமை: மூலக்கூறு பண்புகள் மற்றும் மருந்து வேட்பாளர்கள்', ஆன்காலஜியின் எல்லைகள், 12, ப.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
சூ, பி. மற்றும் பலர்.(2022) 'எல்என்சிஆர்என்ஏ/சர்க்ஆர்என்ஏ-மைஆர்என்ஏ-எம்ஆர்என்ஏ வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களின் ஒருங்கிணைந்த பகுப்பாய்வு வேர்க்கடலையில் வேர்-முடிச்சு நூற்புழுக்களுக்கு பதிலளிக்கும் வகையில் சாத்தியமான வழிமுறைகள் பற்றிய புதிய நுண்ணறிவுகளை வெளிப்படுத்துகிறது', பிஎம்சி ஜெனோமிக்ஸ், 23(1), பக். 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
யான், Z. மற்றும் பலர்.(2022) 'முழு-டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது, சிவப்பு எல்இடி கதிர்வீச்சு மூலம் ப்ரோக்கோலியில் அறுவடைக்குப் பிந்தைய தரத்தைப் பராமரிப்பதோடு தொடர்புடைய மூலக்கூறு வழிமுறைகளை எடுத்துக்காட்டுகிறது', போஸ்ட்ஹார்வெஸ்ட் பயாலஜி அண்ட் டெக்னாலஜி, 188, ப.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
