முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைப்படுத்தல் – இல்லுமினா
அம்சங்கள்
● முழுமையான டிரான்ஸ்கிரிப்டோமை வரிசைப்படுத்துவதற்கான இரட்டை லைப்ரரி உருவாக்கம்: rRNA நீக்க லைப்ரரி மற்றும் சிறிய RNA லைப்ரரி தயாரிப்பு.
● mRNA, lncRNA, circRNA மற்றும் miRNA ஆகியவற்றின் முழுமையான உயிரித் தகவல் பகுப்பாய்வு தனித்தனி உயிரித் தகவல் அறிக்கைகளில் அளிக்கப்படும், மேலும் ceRNA வலையமைப்புப் பகுப்பாய்வு உட்பட, அனைத்து RNA வெளிப்பாடுகளையும் இணைத்த ஒரு கூட்டுப் பகுப்பாய்வும் அடங்கும்.
சேவை நன்மைகள்
●விரிவான நிபுணத்துவம்நாங்கள் பல்வேறு மாதிரி வகைகளை உள்ளடக்கிய 2100-க்கும் மேற்பட்ட முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் திட்டங்களைச் செயல்படுத்தியுள்ளோம். ஒவ்வொரு திட்டத்திற்கும் எங்களின் பரந்த நிபுணத்துவத்தை நாங்கள் கொண்டு வருகிறோம்.
●கடுமையான தரக் கட்டுப்பாடுமாதிரித் தயாரிப்பு முதல் லைப்ரரி தயாரிப்பு, வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் பயோஇன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் வரையிலான அனைத்து நிலைகளிலும் நாங்கள் முக்கிய கட்டுப்பாட்டுப் புள்ளிகளைச் செயல்படுத்துகிறோம். எங்களின் நுணுக்கமான கண்காணிப்பு, தொடர்ச்சியாக உயர்தரமான முடிவுகள் வழங்கப்படுவதை உறுதி செய்கிறது.
●விரிவான குறிப்புரைவேறுபட்ட வெளிப்பாட்டு மரபணுக்களை (DEGs) செயல்பாட்டு ரீதியாகக் குறிப்பதற்கும், அதற்கேற்ற செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வுகளை மேற்கொள்வதற்கும் நாங்கள் பல தரவுத்தளங்களைப் பயன்படுத்துகிறோம். இந்த விரிவான அணுகுமுறை, டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பதிலுக்கு அடிப்படையாக உள்ள செல்லுலார் மற்றும் மூலக்கூறு செயல்முறைகள் குறித்த நுண்ணறிவுகளை வழங்குகிறது, இதன் மூலம் உங்கள் பரிசோதனையின் தரவுகள் பற்றிய சாத்தியமான அனைத்து தகவல்களையும் நீங்கள் பெறுவதை உறுதி செய்கிறது.
●ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளின் ஆழமான பகுப்பாய்வுmRNA, lncRNA, circRNA மற்றும் miRNA ஆகியவற்றின் கூட்டு வரிசைப்படுத்தல் மற்றும் ஒரு முழுமையான உயிரித் தகவல் பணிப்பாய்வு ஆகியவற்றின் மூலம் ceRNA வலையமைப்புப் பகுப்பாய்வு சாத்தியமாக்கப்படுகிறது.
●விற்பனைக்குப் பிந்தைய ஆதரவுஉடன் இருப்பது எவ்வளவு முக்கியம் என்பதை நாங்கள் புரிந்துகொள்கிறோம், அதனால்தான் திட்டப் பணி நிறைவடைந்த பிறகும், 3 மாத கால விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவையை நாங்கள் வழங்குகிறோம். இந்தக் காலகட்டத்தில், திட்டப் பின்தொடர்தல், சிக்கல் தீர்க்கும் உதவி மற்றும் முடிவுகள் தொடர்பான கேள்விகளுக்குப் பதிலளிக்கும் கேள்வி-பதில் அமர்வுகளை நாங்கள் வழங்குகிறோம்.
மாதிரி தேவை மற்றும் விநியோகம்
| நூலகம் | வரிசைப்படுத்தும் உத்தி | பரிந்துரைக்கப்பட்ட தரவு | தரக் கட்டுப்பாடு |
| ஆர்ஆர்என்ஏ குறைக்கப்பட்டது | இல்லுமினா PE150 | 16 ஜிபி | Q30≥85% |
| அளவு தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டது | இல்லுமினா SE50 | 10-20 மில்லியன் வாசிப்புகள் |
மாதிரித் தேவைகள்:
நியூக்ளியோடைடுகள்:
| செறிவு (ng/μl) | அளவு (மைக்ரோகிராம்) | தூய்மை | நேர்மை |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ஜெல் மீது புரதம் அல்லது டிஎன்ஏ கலப்படம் குறைவாகவோ அல்லது இல்லாமலோ இருப்பது தெரிகிறது. | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; குறைந்த அல்லது அடிப்படை உயர்வு இல்லை |
பரிந்துரைக்கப்பட்ட மாதிரி விநியோகம்
கலன்: 2 மில்லி சென்ட்ரிஃபியூஜ் குழாய் (தகரத் தகடு பரிந்துரைக்கப்படவில்லை)
மாதிரி குறியிடல்: குழு+பிரதி, எ.கா. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
சரக்கு அனுப்புதல்:
1. உலர் பனிக்கட்டி: மாதிரிகளைப் பைகளில் அடைத்து, உலர் பனிக்கட்டியில் புதைக்க வேண்டும்.
2. ஆர்.என்.ஏ ஸ்டேபிள் குழாய்கள்: ஆர்.என்.ஏ மாதிரிகளை, ஆர்.என்.ஏ நிலைப்படுத்தும் குழாயில் (எ.கா. ஆர்.என்.ஏ ஸ்டேபிள்®) உலர்த்தி, அறை வெப்பநிலையில் அனுப்பலாம்.
சேவை பணிப்பாய்வு
பரிசோதனை வடிவமைப்பு
மாதிரி விநியோகம்
ஆர்.என்.ஏ பிரித்தெடுத்தல்
நூலக கட்டுமானம்
வரிசைப்படுத்துதல்
தரவு பகுப்பாய்வு
விற்பனைக்குப் பிந்தைய சேவைகள்
உயிரித் தகவல் அறிவியல்
ஒவ்வொன்றின் மீதான அனைத்துப் பகுப்பாய்வுகளுக்கும் மேலாக, 4 வகையான ஆர்.என்.ஏ-க்களும் நமது கூட்டுப் பகுப்பாய்வில் இணைக்கப்பட்டுள்ளன:
- அனைத்து விதமான ஆர்.என்.ஏ தரவுகளுக்கும் இடையேயான இணை வெளிப்பாட்டுப் பகுப்பாய்வு
- ஆர்.என்.ஏ வெளிப்பாட்டு வழிகாட்டி
- வேறுபட்ட வெளிப்பாடு கண்ணோட்டம்
- CeRNA நெட்வொர்க்
- வழித்தடத்தில் ஒருங்கிணைக்கப்பட்ட முக்கிய மரபணுக்கள்
- பாதுகாப்பு பகுப்பாய்வு
- இலக்கு உறவுகள்
ஆர்.என்.ஏ வெளிப்பாட்டு வழிகாட்டி
வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள்
ceRNA பகுப்பாய்வு
வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்பட்ட miRNAக்கள் மற்றும் தொடர்புடைய RNAக்கள்
BMKGene-இன் முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைப்படுத்தல் சேவைகளால் சாத்தியமாக்கப்பட்ட ஆராய்ச்சி முன்னேற்றங்களை, கவனமாகத் தொகுக்கப்பட்ட வெளியீடுகளின் தொகுப்பின் மூலம் அறிந்துகொள்ளுங்கள்.
டாய், ஒய். மற்றும் பலர். (2022) 'ஆர்என்ஏ-வரிசைப்படுத்தல் மூலம் அடையாளம் காணப்பட்ட காஷின்-பெக் நோயில் உள்ள எம்ஆர்என்ஏக்கள், எல்என்சிஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் எம்ஐஆர்என்ஏக்களின் விரிவான வெளிப்பாட்டு விவரங்கள்',மூலக்கூறு ஓமிக்ஸ், 18(2), பக். 154–166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
லியு, என். நான் மற்றும் பலர் (2022) 'சாங்பாய் மலையில் குளிர்காலத் தங்குதலின் போது ஏபிஸ் செரானாவின் குளிர் எதிர்ப்பின் முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு.',மரபணு, 830, பக். 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
வாங், எக்ஸ்.ஜே. மற்றும் பலர் (2022) 'சிறுசெல் நுரையீரல் புற்றுநோயில் போட்டியிடும் அக ஆர்.என்.ஏ. ஒழுங்குமுறை வலைப்பின்னல்களுக்கு பல்-ஓமிக்ஸ் ஒருங்கிணைப்பின் அடிப்படையிலான முன்னுரிமையளித்தல்: மூலக்கூறு பண்புகள் மற்றும் மருந்து வேட்பாளர்கள்',புற்றுநோயியல் துறையில் எல்லைகள், 12, பக். 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
சூ, பி. மற்றும் பலர். (2022) 'நிலக்கடலையில் வேர் முடிச்சு நூற்புழுக்களுக்கு எதிரான சாத்தியமான பதிலளிப்பு வழிமுறைகள் குறித்த புதிய நுண்ணறிவுகளை lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA வெளிப்பாட்டு விவரங்களின் ஒருங்கிணைந்த பகுப்பாய்வு வெளிப்படுத்துகிறது',பிஎம்சி மரபணுவியல், 23(1), பக். 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
யான், இசட். மற்றும் பலர் (2022) 'சிவப்பு எல்.ஈ.டி கதிர்வீச்சின் மூலம் பிரக்கோலியில் அறுவடைக்குப் பிந்தைய தரத்தைப் பராமரிப்பதோடு தொடர்புடைய மூலக்கூறு வழிமுறைகளை முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் ஆர்.என்.ஏ வரிசைமுறை எடுத்துக்காட்டுகிறது',அறுவடைக்குப் பிந்தைய உயிரியல் மற்றும் தொழில்நுட்பம், 188, ப. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
