10x జెనోమిక్స్ విజియం స్పేషియల్ ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్
సాంకేతిక పథకం
లక్షణాలు
● రిజల్యూషన్: 100 µM
● స్పాట్ వ్యాసం: 55 µM
● స్థానాల సంఖ్య: 4992
● సంగ్రహణ ప్రాంతం: 6.5 x 6.5 మిమీ
● ప్రతి బార్కోడ్ స్పాట్ 4 విభాగాలతో కూడిన ప్రైమర్లతో లోడ్ చేయబడింది:
- mRNA ప్రైమింగ్ మరియు cDNA సంశ్లేషణ కోసం పాలీ(dT) తోక
- యాంప్లిఫికేషన్ బయాస్ను సరిచేయడానికి ప్రత్యేకమైన మాలిక్యులర్ ఐడెంటిఫైయర్ (UMI).
- ప్రాదేశిక బార్కోడ్
- పాక్షిక రీడ్ 1 సీక్వెన్సింగ్ ప్రైమర్ యొక్క బైండింగ్ సీక్వెన్స్
● విభాగాల H&E మరకలు
ప్రయోజనాలు
●వన్-స్టాప్ సర్వీస్: క్రయో-సెక్షనింగ్, స్టెయినింగ్, టిష్యూ ఆప్టిమైజేషన్, స్పేషియల్ బార్కోడింగ్, లైబ్రరీ తయారీ, సీక్వెన్సింగ్ మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్తో సహా అన్ని అనుభవం మరియు నైపుణ్య-ఆధారిత దశలను ఏకీకృతం చేస్తుంది.
● అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన సాంకేతిక బృందం: 250 కి పైగా కణజాల రకాలు మరియు మానవ, ఎలుక, క్షీరదం, చేపలు మరియు మొక్కలతో సహా 100+ జాతులలో అనుభవంతో.
●మొత్తం ప్రాజెక్ట్ పై రియల్-టైమ్ అప్డేట్: ప్రయోగాత్మక పురోగతిపై పూర్తి నియంత్రణతో.
●సమగ్ర ప్రామాణిక బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్:ప్యాకేజీలో 29 విశ్లేషణలు మరియు 100+ అధిక-నాణ్యత గణాంకాలు ఉన్నాయి.
●అనుకూలీకరించిన డేటా విశ్లేషణ మరియు విజువలైజేషన్: వివిధ పరిశోధన అభ్యర్థనలకు అందుబాటులో ఉంది.
●సింగిల్-సెల్ mRNA సీక్వెన్సింగ్తో ఐచ్ఛిక ఉమ్మడి విశ్లేషణ
లక్షణాలు
| నమూనా అవసరాలు | లైబ్రరీ | సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం | సిఫార్సు చేయబడిన డేటా | నాణ్యత నియంత్రణ |
| OCT-ఎంబెడెడ్ క్రయో నమూనాలు (సరైన వ్యాసం: సుమారు 6x6x6 mm³) ప్రతి నమూనాకు 2 బ్లాక్లు | 10X విజియం cDNA లైబ్రరీ | ఇల్యూమినా PE150 | ఒక్కో స్థానానికి 50K PE రీడ్లు (60 జిబి) | RIN > 7 |
నమూనా తయారీ మార్గదర్శకత్వం మరియు సేవా వర్క్ఫ్లో గురించి మరిన్ని వివరాల కోసం, దయచేసి సంకోచించకండి aBMKGENE నిపుణుడు
సర్వీస్ వర్క్ఫ్లో
నమూనా తయారీ దశలో, అధిక-నాణ్యత గల RNA పొందగలరని నిర్ధారించుకోవడానికి ప్రారంభ బల్క్ RNA వెలికితీత ట్రయల్ నిర్వహిస్తారు. కణజాల ఆప్టిమైజేషన్ దశలో విభాగాలను మరక చేసి దృశ్యమానం చేస్తారు మరియు కణజాలం నుండి mRNA విడుదలకు పారగమ్యత పరిస్థితులు ఆప్టిమైజ్ చేయబడతాయి. లైబ్రరీ నిర్మాణ సమయంలో ఆప్టిమైజ్ చేయబడిన ప్రోటోకాల్ వర్తించబడుతుంది, తరువాత సీక్వెన్సింగ్ మరియు డేటా విశ్లేషణ జరుగుతుంది.
పూర్తి సేవా వర్క్ఫ్లోలో రియల్-టైమ్ అప్డేట్లు మరియు క్లయింట్ నిర్ధారణలు ఉంటాయి, ఇవి ప్రతిస్పందించే ఫీడ్బ్యాక్ లూప్ను నిర్వహించడానికి, ప్రాజెక్ట్ అమలును సజావుగా జరిగేలా చూస్తాయి.
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
డేటా నాణ్యత నియంత్రణ:
o డేటా అవుట్పుట్ మరియు నాణ్యత స్కోర్ పంపిణీ
o ప్రతి ప్రదేశానికి జన్యు గుర్తింపు
కణజాల కవరేజ్
అంతర్గత నమూనా విశ్లేషణ:
o జన్యు సమృద్ధి
o స్పాట్ క్లస్టరింగ్, తగ్గిన పరిమాణ విశ్లేషణతో సహా
o సమూహాల మధ్య అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ: మార్కర్ జన్యువుల గుర్తింపు
o మార్కర్ జన్యువుల క్రియాత్మక ఉల్లేఖనం మరియు సుసంపన్నం
ఇంటర్-గ్రూప్ విశ్లేషణ
o రెండు నమూనాల నుండి మచ్చల పునఃకలయిక (ఉదా. వ్యాధిగ్రస్తులు మరియు నియంత్రణ) మరియు పునఃసమూహం
ప్రతి క్లస్టర్కు మార్కర్ జన్యువుల గుర్తింపు
o మార్కర్ జన్యువుల క్రియాత్మక ఉల్లేఖనం మరియు సుసంపన్నం
సమూహాల మధ్య ఒకే క్లస్టర్ యొక్క అవకలన వ్యక్తీకరణ
అంతర్గత నమూనా విశ్లేషణ
స్పాట్ క్లస్టరింగ్
మార్కర్ జన్యువుల గుర్తింపు మరియు ప్రాదేశిక పంపిణీ
ఇంటర్-గ్రూప్ విశ్లేషణ
రెండు గ్రూపుల నుండి డేటా కలయిక మరియు తిరిగి క్లస్టర్
కొత్త సమూహాల మార్కర్ జన్యువులు
10X విసియం ద్వారా BMKGene యొక్క స్పేషియల్ ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్స్ సర్వీస్ ద్వారా సులభతరం చేయబడిన పురోగతులను అన్వేషించండి ఈ ఫీచర్ చేయబడిన ప్రచురణలలో:
చెన్, డి. మరియు ఇతరులు (2023) 'క్షీరద సంశ్లేషణ GPCRల యొక్క సంభావ్య డ్రోసోఫిలా హోమోలాగ్ అయిన mthl1, ఈగలలోని ఇంజెక్ట్ చేయబడిన ఆంకోజెనిక్ కణాలకు యాంటీట్యూమర్ ప్రతిచర్యలలో పాల్గొంటుంది',అమెరికా సంయుక్త రాష్ట్రాల జాతీయ శాస్త్రాల అకాడమీ యొక్క ప్రొసీడింగ్స్, 120(30), పేజీ e2303462120. doi: /10.1073/pnas.2303462120
చెన్, వై. మరియు ఇతరులు (2023) 'స్టీల్ స్పాటియోటెంపోరల్ ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్ డేటా యొక్క అధిక-రిజల్యూషన్ వర్ణనను అనుమతిస్తుంది',బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్లో బ్రీఫింగ్లు, 24(2), పేజీలు 1–10. doi: 10.1093/BIB/BBAD068.
లియు, సి. మరియు ఇతరులు (2022) 'ఆర్కిడ్ పువ్వుల అభివృద్ధిలో ఆర్గానోజెనిసిస్ యొక్క స్పాటియోటెంపోరల్ అట్లాస్',న్యూక్లియిక్ ఆమ్లాల పరిశోధన, 50(17), పేజీలు. 9724–9737. doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
వాంగ్, జె. మరియు ఇతరులు (2023) 'స్పేషియల్ ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్స్ మరియు సింగిల్-న్యూక్లియస్ RNA సీక్వెన్సింగ్ను సమగ్రపరచడం వల్ల గర్భాశయ లియోయోమాకు సంభావ్య చికిత్సా వ్యూహాలు తెలుస్తాయి',ఇంటర్నేషనల్ జర్నల్ ఆఫ్ బయోలాజికల్ సైన్సెస్, 19(8), పేజీలు. 2515–2530. doi: 10.7150/IJBS.83510.
