DNA/RNA సీక్వెన్సింగ్ - నానోపోర్ సీక్వెన్సర్
సర్వీస్ వివరాలు ఫీచర్లు
| వేదిక | లైబ్రరీ పరిమాణం | సైద్ధాంతిక డేటా దిగుబడి (ప్రతి సెల్) | సింగిల్-బేస్ ఖచ్చితత్వం | అప్లికేషన్లు |
| నానోపోర్ | 8Kb, 10kb, 20kb, అల్ట్రాలాంగ్, cDNA-PCR | 70-90Gb/సెల్ | 85-92% | SV కాలింగ్, డి నోవో, ఫుల్-లెంగ్త్ సీక్వెన్సింగ్, Iso-Seq, జీన్ ఉల్లేఖన, DNA మిథైలేషన్ గుర్తింపు |
సేవా ప్రయోజనాలు
● వివిధ జాతులతో వేలకొద్దీ క్లోజ్డ్ ప్రాజెక్ట్‌లతో PacBio సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌పై 5 సంవత్సరాల అనుభవం.
● BMKGENE అనేది డ్యూయల్ ప్లాట్‌ఫారమ్ RNA/DNA ధృవీకరణతో ఆక్స్‌ఫర్డ్ నానోపోర్ యొక్క అధికారిక భాగస్వామి.
● పూర్తి పరికరాలు మరియు తగినంత సీక్వెన్సింగ్ నిర్గమాంశతో సీక్వెన్సర్‌ల యొక్క ప్రధాన స్రవంతి నమూనాలు ఉన్నాయి.
● నానోపోర్ ప్లాట్‌ఫారమ్ ఆధారంగా, 10 కంటే ఎక్కువ జంతువులు మరియు మొక్కల డెనోవో పరిశోధనలు అంతర్జాతీయంగా ప్రసిద్ధి చెందిన జర్నల్‌లలో ప్రచురించబడ్డాయి.
నమూనా అవసరాలు
| నమూనా రకం | మొత్తం | ఏకాగ్రత(క్విట్ ®) | వాల్యూమ్ | స్వచ్ఛత | ఇతరులు |
| జన్యుసంబంధమైన DNA | డేటా ఆవశ్యకతపై ఆధారపడి ఉంటుంది | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; 260 nm వద్ద గరిష్ట స్థాయిని క్లియర్ చేయండి, కాలుష్యాలు లేవు | ఏకాగ్రతను Qubit మరియు Qubit/Nanopore ≤ 2 ద్వారా కొలవాలి |
| మొత్తం RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5;కాలుష్యాలు లేవు | RIN విలువ ≥7.5 |
సర్వీస్ వర్క్‌ఫ్లో
నమూనా తయారీ
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
ప్రాజెక్ట్ డెలివరీ
DNA నమూనా యొక్క డేటా నాణ్యత అంచనా
టేబుల్ 1. క్లీన్ డేటాపై గణాంకాలు.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | క్లీన్‌సెక్‌నమ్ | క్లీన్‌సమ్‌బేస్ | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | క్లీన్ మీన్ క్వాల్ |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
RNA నమూనా యొక్క డేటా నాణ్యత అంచనా
టేబుల్ 1. క్లీన్ డేటాపై గణాంకాలు.
| ఫైల్ పేరు | క్లయింట్ ID | ReadNum | ఆధార సంఖ్య | N50 | మీన్ లెంగ్త్ | గరిష్ట పొడవు | మీన్ స్కోర్ |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
మూర్తి 1. రీడ్ పొడవు పంపిణీ
మూర్తి 2. శుభ్రమైన డేటా యొక్క నాణ్యత స్కోర్ పంపిణీ
మూర్తి 3. క్లీన్ డేటా యొక్క పొడవు మరియు నాణ్యత స్కోర్ పంపిణీ
