పూర్తి-పొడవు mRNA సీక్వెన్సింగ్-నానోపోర్
లక్షణాలు
● పాలీ-ఎ mRNA సంగ్రహణ, ఆ తరువాత cDNA సంశ్లేషణ మరియు లైబ్రరీ తయారీ.
● పూర్తి-నిడివి గల ట్రాన్స్క్రిప్ట్ల క్రమం
● రిఫరెన్స్ జీనోమ్కు అమరిక ఆధారంగా బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణ
● బయోఇన్ఫర్మేటిక్ విశ్లేషణలో జన్యువు మరియు ఐసోఫామ్ స్థాయిలో వ్యక్తీకరణ మాత్రమే కాకుండా lncRNA, జన్యు సంలీనాలు, పాలీ-అడెనిలేషన్ మరియు జన్యు నిర్మాణం యొక్క విశ్లేషణ కూడా ఉంటుంది.
సేవా ప్రయోజనాలు
●ఐసోఫార్మ్ స్థాయిలో వ్యక్తీకరణ యొక్క పరిమాణీకరణ: వివరణాత్మక మరియు ఖచ్చితమైన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణను ప్రారంభించడం, మొత్తం జన్యు వ్యక్తీకరణను విశ్లేషించేటప్పుడు ముసుగు చేయబడే మార్పును ఆవిష్కరించడం.
●తగ్గిన డేటా డిమాండ్లు:నెక్స్ట్-జనరేషన్ సీక్వెన్సింగ్ (NGS) తో పోలిస్తే, నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్ తక్కువ డేటా అవసరాలను ప్రదర్శిస్తుంది, చిన్న డేటాతో సమానమైన స్థాయి జన్యు వ్యక్తీకరణ పరిమాణ సంతృప్తిని అనుమతిస్తుంది.
●వ్యక్తీకరణ పరిమాణీకరణ యొక్క అధిక ఖచ్చితత్వం: జన్యు మరియు ఐసోఫామ్ స్థాయిలో రెండూ
●అదనపు ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్ సమాచారం యొక్క గుర్తింపు: ప్రత్యామ్నాయ పాలిడెనిలేషన్, ఫ్యూజన్ జన్యువులు మరియు lcnRNA మరియు వాటి లక్ష్య జన్యువులు
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం: మా బృందం 850 కి పైగా నానోపోర్ పూర్తి-నిడివి గల ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ ప్రాజెక్టులను పూర్తి చేసి, 8,000 నమూనాలను ప్రాసెస్ చేసి, ప్రతి ప్రాజెక్టుకు అనుభవ సంపదను తెస్తుంది.
●అమ్మకాల తర్వాత మద్దతు: మా నిబద్ధత 3 నెలల అమ్మకాల తర్వాత సేవా వ్యవధితో ప్రాజెక్ట్ పూర్తి కాకుండా విస్తరించింది. ఈ సమయంలో, ఫలితాలకు సంబంధించిన ఏవైనా ప్రశ్నలను పరిష్కరించడానికి మేము ప్రాజెక్ట్ ఫాలో-అప్, ట్రబుల్షూటింగ్ సహాయం మరియు ప్రశ్నోత్తరాల సెషన్లను అందిస్తున్నాము.
నమూనా అవసరాలు మరియు డెలివరీ
| లైబ్రరీ | సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం | సిఫార్సు చేయబడిన డేటా | నాణ్యత నియంత్రణ |
| పాలీ ఎ సుసంపన్నం చేయబడింది | నానోపోర్ ప్రోమెథియాన్ 48 | 6/12 జిబి | సగటు నాణ్యత స్కోరు: Q10 |
నమూనా అవసరాలు:
న్యూక్లియోటైడ్లు:
| కాంక్రీట్ (ng/μl) | మొత్తం (μg) | స్వచ్ఛత | సమగ్రత |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 జెల్ పై చూపబడిన ప్రోటీన్ లేదా DNA కాలుష్యం పరిమితంగా లేదా అస్సలు లేకపోవడం. | మొక్కలకు: RIN≥7.0; జంతువులకు: RIN≥7.5; 5.0≥28ఎస్/18ఎస్≥1.0; బేస్లైన్ ఎత్తు పరిమితం లేదా లేకపోవడం |
● మొక్కలు:
వేరు, కాండం లేదా రేక: 450 మి.గ్రా.
ఆకు లేదా విత్తనం: 300 మి.గ్రా.
పండు: 1.2 గ్రా
● జంతువు:
గుండె లేదా ప్రేగు: 300 మి.గ్రా.
విసెరా లేదా బ్రెయిన్: 240 మి.గ్రా.
కండరాలు: 450 మి.గ్రా.
ఎముకలు, జుట్టు లేదా చర్మం: 1 గ్రా
● ఆర్థ్రోపోడ్స్:
కీటకాలు: 6 గ్రా
క్రస్టేసియా: 300 మి.గ్రా.
● మొత్తం రక్తం: 1 ట్యూబ్
● కణాలు: 106 కణాలు
సిఫార్సు చేయబడిన నమూనా డెలివరీ
కంటైనర్: 2 మి.లీ సెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ (టిన్ ఫాయిల్ సిఫార్సు చేయబడలేదు)
నమూనా లేబులింగ్: సమూహం+ప్రతిరూపం ఉదా. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
రవాణా:
1. డ్రై-ఐస్: నమూనాలను సంచులలో ప్యాక్ చేసి డ్రై-ఐస్లో పాతిపెట్టాలి.
2. RNAstable గొట్టాలు: RNA నమూనాలను RNA స్టెబిలైజేషన్ ట్యూబ్ (ఉదా. RNAstable®) లో ఎండబెట్టి గది ఉష్ణోగ్రతలో రవాణా చేయవచ్చు.
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
న్యూక్లియోటైడ్లు:
నమూనా డెలివరీ
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకాల తర్వాత సేవలు
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
కణజాలం:
ప్రయోగ రూపకల్పన
నమూనా డెలివరీ
RNA వెలికితీత
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకాల తర్వాత సేవలు
● ముడి డేటా ప్రాసెసింగ్
● ట్రాన్స్క్రిప్ట్ గుర్తింపు
● ప్రత్యామ్నాయ స్ప్లైసింగ్
● జన్యు స్థాయి మరియు ఐసోఫామ్ స్థాయిలో వ్యక్తీకరణ పరిమాణీకరణ
● అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ
● ఫంక్షన్ ఉల్లేఖనం మరియు సుసంపన్నం (DEGలు మరియు DETలు)
ప్రత్యామ్నాయ స్ప్లైసింగ్ విశ్లేషణ
ఆల్టర్నేటివ్ పాలిడెనిలేషన్ అనాలిసిస్ (APA)
lncRNA అంచనా
నవల జన్యువుల వ్యాఖ్యానం
DET ల క్లస్టరింగ్
DEGలలో ప్రోటీన్-ప్రోటీన్ నెట్వర్క్లు
BMKGene యొక్క నానోపోర్ పూర్తి-నిడివి mRNA సీక్వెన్సింగ్ సేవల ద్వారా సులభతరం చేయబడిన పురోగతులను ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా అన్వేషించండి.
గాంగ్, బి. మరియు ఇతరులు (2023) 'గ్లియోమాలో ఆంకోజీన్గా సెక్రటరీ కినేస్ FAM20C యొక్క ఎపిజెనెటిక్ మరియు ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ యాక్టివేషన్', జర్నల్ ఆఫ్ జెనెటిక్స్ అండ్ జెనోమిక్స్, 50(6), పేజీలు 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
అతను, Z. మరియు ఇతరులు (2023) 'IFN-γ కి ప్రతిస్పందించే లింఫోసైట్ల పూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ ఫ్లౌండర్ (పారాలిచ్తిస్ ఆలివేసియస్)లో Th1-వక్రీకృత రోగనిరోధక ప్రతిస్పందనను వెల్లడిస్తుంది', ఫిష్ & షెల్ఫిష్ ఇమ్యునాలజీ, 134, పేజీ 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
మా, వై. మరియు ఇతరులు (2023) 'నెమోపిలెమా నోమురై విష గుర్తింపు కోసం ప్యాక్బయో మరియు ONT RNA శ్రేణి పద్ధతుల తులనాత్మక విశ్లేషణ', జెనోమిక్స్, 115(6), పేజీ 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
యు, డి. మరియు ఇతరులు (2023) 'నానో-సెక్ విశ్లేషణ hUMSC నుండి తీసుకోబడిన ఎక్సోసోమ్లు మరియు మైక్రోవేసికల్ల మధ్య విభిన్న క్రియాత్మక ధోరణిని వెల్లడిస్తుంది', స్టెమ్ సెల్ రీసెర్చ్ అండ్ థెరపీ, 14(1), పేజీలు 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/టేబుల్స్/6.
