-
ప్లాంట్/యానిమల్ డి నోవో జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్
డి నోవోసీక్వెన్సింగ్ అనేది రిఫరెన్స్ జీనోమ్ లేనప్పుడు, సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీలను ఉపయోగించి ఒక జాతి మొత్తం జీనోమ్‌ను నిర్మించడాన్ని సూచిస్తుంది, ఉదా. ప్యాక్‌బయో, నానోపోర్, NGS, మొదలైనవి.మూడవ తరం సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీల రీడ్ లెంగ్త్‌లో చెప్పుకోదగ్గ మెరుగుదల సంక్లిష్ట జన్యువులను సమీకరించడంలో కొత్త అవకాశాలను తెచ్చిపెట్టింది, అధిక హెటెరోజైగోసిటీ, రిపీటీటివ్ రీజియన్‌ల అధిక నిష్పత్తి, పాలీప్లాయిడ్‌లు మొదలైనవి. పదుల కిలోబేస్‌ల స్థాయిలో రీడ్ లెంగ్త్‌తో, ఈ సీక్వెన్సింగ్ రీడ్‌లు ప్రారంభమవుతాయి. పునరావృత మూలకాలు, అసాధారణ GC కంటెంట్‌లు మరియు ఇతర అత్యంత సంక్లిష్టమైన ప్రాంతాలతో కూడిన ప్రాంతాలను పరిష్కరించడం.
ప్లాట్‌ఫారమ్: ప్యాక్‌బయో సీక్వెల్ II / నానోపోర్ ప్రోమెథియాన్ P48/ ఇల్యూమినా నోవాసెక్6000
-
హై-సి ఆధారిత జీనోమ్ అసెంబ్లీ
Hi-C అనేది ప్రోబింగ్ ప్రాక్సిమిటీ-బేస్డ్ ఇంటరాక్షన్‌లు మరియు హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్‌ని కలపడం ద్వారా క్రోమోజోమ్ కాన్ఫిగరేషన్‌ను క్యాప్చర్ చేయడానికి రూపొందించబడిన పద్ధతి.ఈ పరస్పర చర్యల తీవ్రత క్రోమోజోమ్‌లపై భౌతిక దూరంతో ప్రతికూలంగా సంబంధం కలిగి ఉంటుందని నమ్ముతారు.అందువల్ల, హై-సి డేటా డ్రాఫ్ట్ జీనోమ్‌లో అసెంబుల్డ్ సీక్వెన్స్‌ల క్లస్టరింగ్, ఆర్డర్ మరియు ఓరియంటింగ్ మరియు వాటిని నిర్దిష్ట సంఖ్యలో క్రోమోజోమ్‌లపై ఎంకరేజ్ చేస్తుంది.ఈ సాంకేతికత జనాభా-ఆధారిత జన్యు పటం లేనప్పుడు క్రోమోజోమ్-స్థాయి జీనోమ్ అసెంబ్లీకి శక్తినిస్తుంది.ప్రతి ఒక్క జన్యువుకు హై-సి అవసరం.
ప్లాట్‌ఫారమ్: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
ఎవల్యూషనరీ జెనెటిక్స్
ఎవల్యూషనరీ జెనెటిక్స్ అనేది SNPలు, InDels, SVలు మరియు CNVలతో సహా జన్యు వైవిధ్యాల ఆధారంగా ఇచ్చిన పదార్థాల యొక్క పరిణామాత్మక సమాచారంపై సమగ్ర వివరణను అందించడానికి రూపొందించబడిన ప్యాక్డ్ సీక్వెన్సింగ్ సేవ.ఇది జనాభా నిర్మాణం, జన్యు వైవిధ్యం, ఫైలోజెని సంబంధాలు మొదలైన పరిణామాత్మక మార్పులు మరియు జనాభా యొక్క జన్యు లక్షణాలను వివరించడానికి అవసరమైన అన్ని ప్రాథమిక విశ్లేషణలను అందిస్తుంది. ఇది జన్యు ప్రవాహంపై అధ్యయనాలను కూడా కలిగి ఉంది, ఇది సమర్థవంతమైన జనాభా పరిమాణం, వైవిధ్య సమయాన్ని అంచనా వేయడానికి అధికారం ఇస్తుంది.
-
కంపారిటివ్ జెనోమిక్స్
కంపారిటివ్ జెనోమిక్స్ అంటే వివిధ జాతుల పూర్తి జన్యు శ్రేణులు మరియు నిర్మాణాలను పోల్చడం.ఈ క్రమశిక్షణ వివిధ జాతులలో సంరక్షించబడిన లేదా వేరు చేయబడిన క్రమ నిర్మాణాలు మరియు మూలకాలను గుర్తించడం ద్వారా జన్యు స్థాయిలో జాతుల పరిణామం, జన్యు పనితీరు, జన్యు నియంత్రణ యంత్రాంగాన్ని బహిర్గతం చేయడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది.సాధారణ తులనాత్మక జన్యుశాస్త్ర అధ్యయనంలో జన్యు కుటుంబం, పరిణామాత్మక అభివృద్ధి, మొత్తం జీనోమ్ డూప్లికేషన్, సెలెక్టివ్ ప్రెజర్ మొదలైన విశ్లేషణలు ఉంటాయి.
-
బల్క్డ్ సెగ్రెగెంట్ విశ్లేషణ
బల్క్డ్ సెగ్రెగెంట్ అనాలిసిస్ (BSA) అనేది ఫినోటైప్ అనుబంధిత జన్యు గుర్తులను త్వరగా గుర్తించడానికి ఉపయోగించే ఒక సాంకేతికత.BSA యొక్క ప్రధాన వర్క్‌ఫ్లో చాలా వ్యతిరేక సమలక్షణాలను కలిగి ఉన్న వ్యక్తుల యొక్క రెండు సమూహాలను ఎంపిక చేస్తుంది, అన్ని వ్యక్తుల DNAని రెండు బల్క్ DNAను ఏర్పరుస్తుంది, రెండు పూల్స్ మధ్య అవకలన క్రమాలను గుర్తించడం.మొక్క/జంతువుల జన్యువులలోని లక్ష్య జన్యువుల ద్వారా బలంగా అనుబంధించబడిన జన్యు గుర్తులను గుర్తించడంలో ఈ సాంకేతికత విస్తృతంగా ఉపయోగించబడింది.
