మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ -NGS
మెటాజినోమ్ అనేది పర్యావరణ మరియు మానవ మెటాజినోమ్‌ల వంటి జీవుల మిశ్రమ సంఘం యొక్క మొత్తం జన్యు పదార్ధాల సమాహారం. ఇది సాగు చేయదగిన మరియు సాగు చేయలేని సూక్ష్మజీవుల జన్యువులను కలిగి ఉంటుంది. NGSతో కూడిన షాట్‌గన్ మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ వర్గీకరణ ప్రొఫైలింగ్ కంటే ఎక్కువ అందించడం ద్వారా పర్యావరణ నమూనాలలో పొందుపరిచిన ఈ క్లిష్టమైన జన్యు ప్రకృతి దృశ్యాలను అధ్యయనం చేస్తుంది, జాతుల వైవిధ్యం, సమృద్ధి డైనమిక్స్ మరియు సంక్లిష్ట జనాభా నిర్మాణాలపై కణిక అంతర్దృష్టులను కూడా అందిస్తుంది. వర్గీకరణ అధ్యయనాలకు అతీతంగా, షాట్‌గన్ మెటాజెనోమిక్స్ ఫంక్షనల్ జెనోమిక్స్ దృక్పథాన్ని కూడా అందిస్తుంది, ఎన్‌కోడ్ చేయబడిన జన్యువుల అన్వేషణను మరియు పర్యావరణ ప్రక్రియలలో వాటి పుటేటివ్ పాత్రలను అనుమతిస్తుంది. చివరగా, జన్యు మూలకాలు మరియు పర్యావరణ కారకాల మధ్య సహసంబంధ నెట్‌వర్క్‌ల స్థాపన సూక్ష్మజీవుల సంఘాలు మరియు వాటి పర్యావరణ నేపథ్యం మధ్య సంక్లిష్టమైన పరస్పర చర్య యొక్క సంపూర్ణ అవగాహనకు దోహదం చేస్తుంది. ముగింపులో, ఈ సంక్లిష్ట పర్యావరణ వ్యవస్థల్లో జన్యుశాస్త్రం మరియు జీవావరణ శాస్త్రం మధ్య బహుముఖ సంబంధాలను ప్రకాశింపజేసేందుకు, విభిన్న సూక్ష్మజీవుల సంఘాల జన్యుపరమైన చిక్కులను విప్పడానికి మెటాజెనోమిక్ సీక్వెన్సింగ్ కీలకమైన సాధనంగా నిలుస్తుంది.
ప్లాట్‌ఫారమ్‌లు: Illumina NovaSeq మరియు DNBSEQ-T7
సేవా ప్రయోజనాలు
●మైక్రోబియల్ కమ్యూనిటీ ప్రొఫైలింగ్ కోసం ఐసోలేషన్ మరియు కల్టివేషన్-ఫ్రీ మెథడ్: సాగు చేయలేని జీవుల నుండి జన్యు పదార్ధాల క్రమాన్ని ప్రారంభించడం.
●అధిక రిజల్యూషన్: పర్యావరణ నమూనాలలో తక్కువ సమృద్ధిగా ఉన్న జాతులను గుర్తించండి.
●సమగ్ర బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణ:వర్గీకరణ వైవిధ్యంపై మాత్రమే కాకుండా సంఘం యొక్క క్రియాత్మక వైవిధ్యంపై కూడా దృష్టి సారించింది.
●విస్తృతమైన అనుభవం:వివిధ పరిశోధన డొమైన్‌లలో బహుళ మెటాజెనోమిక్స్ ప్రాజెక్ట్‌లను విజయవంతంగా మూసివేసిన ట్రాక్ రికార్డ్‌తో మరియు 200,000 నమూనాలను ప్రాసెస్ చేయడం ద్వారా, మా బృందం ప్రతి ప్రాజెక్ట్‌కి అనుభవ సంపదను అందిస్తుంది.
సర్వీస్ స్పెసిఫికేషన్స్
| సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ | డేటా సిఫార్సు చేయబడింది | నాణ్యత నియంత్రణ |
| Illumina NovaSeq లేదా DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20Gb | Q30≥85% |
సేవా అవసరాలు
| ఏకాగ్రత (ng/µL) | మొత్తం మొత్తం (ng) | వాల్యూమ్ (µL) |
| ≥1 | ≥30 | ≥20 |
● నేల/బురద: 2-3గ్రా
● ప్రేగు సంబంధిత కంటెంట్-జంతువు: 0.5-2గ్రా
● ప్రేగు సంబంధిత విషయాలు-కీటకాలు: 0.1-0.25గ్రా
● మొక్కల ఉపరితలం (సుసంపన్నమైన అవక్షేపం): 0.5-1గ్రా
● కిణ్వ ప్రక్రియ ఉడకబెట్టిన పులుసు సుసంపన్నమైన అవక్షేపం): 0.2-0.5గ్రా
● మలం (పెద్ద జంతువులు): 0.5-2గ్రా
● మలం (మౌస్): 3-5 గింజలు
● పల్మనరీ అల్వియోలార్ లావేజ్ ఫ్లూయిడ్: ఫిల్టర్ పేపర్
● యోని శుభ్రముపరచు: 5-6 శుభ్రముపరచు
● చర్మం/జననేంద్రియ శుభ్రముపరచు/లాలాజలం/ఓరల్ మృదు కణజాలం/ఫరీంజియల్ శుభ్రముపరచు/మల శుభ్రముపరచు: 2-3 శుభ్రముపరచు
● ఉపరితల సూక్ష్మజీవులు: 5-6 శుభ్రముపరచు
● వాటర్‌బాడీ/ఎయిర్/బయోఫిల్మ్: ఫిల్టర్ పేపర్
● ఎండోఫైట్స్: 2-3గ్రా
● డెంటల్ ప్లేక్: 0.5-1గ్రా
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
నమూనా డెలివరీ
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకం తర్వాత సేవలు
కింది విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది:
● సీక్వెన్సింగ్ డేటా నాణ్యత నియంత్రణ
● మెటాజినోమ్ అసెంబ్లీ మరియు జీన్ ప్రిడిక్షన్
● జన్యు ఉల్లేఖనం
● వర్గీకరణ ఆల్ఫా వైవిధ్య విశ్లేషణ
● సంఘం యొక్క క్రియాత్మక విశ్లేషణ: జీవసంబంధమైన పనితీరు, జీవక్రియ, యాంటీబయాటిక్ నిరోధకత
● క్రియాత్మక మరియు వర్గీకరణ వైవిధ్యం రెండింటిపై విశ్లేషణ:
బీటా వైవిధ్య విశ్లేషణ
ఇంటర్-గ్రూప్ విశ్లేషణ
సహసంబంధ విశ్లేషణ: పర్యావరణ కారకాలు మరియు OUT కూర్పు మరియు వైవిధ్యం మధ్య
ఫంక్షనల్ విశ్లేషణ: CARD యాంటీబయాటిక్ నిరోధకత
KEGG జీవక్రియ మార్గాల అవకలన విశ్లేషణ: ముఖ్యమైన మార్గాల హీట్‌మ్యాప్
వర్గీకరణ పంపిణీ యొక్క ఆల్ఫా వైవిధ్యం: ACE సూచిక
వర్గీకరణ పంపిణీ యొక్క బీటా వైవిధ్యం: PcoA
ఇల్యూమినాతో BMKGene యొక్క మెటాజినోమ్ సీక్వెన్సింగ్ సేవల ద్వారా అందించబడిన పురోగతిని క్యూరేటెడ్ ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా అన్వేషించండి.
హై, Q. మరియు ఇతరులు. (2023) 'వివిధ సంస్కృతి నీటి ఉష్ణోగ్రతల వద్ద ఇన్ఫెక్షియస్ హెమటోపోయిటిక్ నెక్రోసిస్ వైరస్ సోకిన రెయిన్‌బో ట్రౌట్ (ఆంకోరిన్‌చస్ మైకిస్) పేగు విషయాలలో మార్పుల యొక్క మెటాజెనోమిక్ మరియు జీవక్రియ విశ్లేషణ',మైక్రోబయాలజీలో సరిహద్దులు, 14, p. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
మావో, సి. మరియు ఇతరులు. (2023) 'వివిధ ట్రోఫిక్ రాష్ట్రాల పట్టణ సరస్సులలో సూక్ష్మజీవుల సంఘాలు, నిరోధక జన్యువులు మరియు రెసిస్టమ్ ప్రమాదాలు: అంతర్గత లింకులు మరియు బాహ్య ప్రభావాలు',జర్నల్ ఆఫ్ హాజర్డస్ మెటీరియల్స్ అడ్వాన్సెస్, 9, p. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
సు, M. మరియు ఇతరులు. (2022) 'షీప్ రుమెన్ యొక్క ద్రవ-సంబంధిత మరియు ఘన-సంబంధిత సూక్ష్మజీవుల మధ్య కంపోజిషన్ మరియు ఫంక్షన్‌లో మెటాజెనోమిక్ విశ్లేషణ వెల్లడించింది',మైక్రోబయాలజీలో సరిహద్దులు, 13, p. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
యిన్, J. మరియు ఇతరులు. (2023) 'ఒబేసిడ్ నింగ్‌క్సియాంగ్ పిగ్-డెరైవ్డ్ మైక్రోబయోటా లీన్ DLY పందులలో కండరాల కొవ్వు ఆమ్లం నిక్షేపణను ప్రోత్సహించడానికి కార్నిటైన్ జీవక్రియను తిరిగి చేస్తుంది',ది ఇన్నోవేషన్, 4(5), p. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
జావో, X. మరియు ఇతరులు. (2023) 'చైనాలోని హైహే ఈస్ట్యూరీ ఎగువ మరియు దిగువ ప్రాంతాల్లోని ప్రతినిధి బయో/అధోకరణం చెందని ప్లాస్టిక్ మరియు నాన్-ప్లాస్టిక్ శిధిలాల సంభావ్య ప్రమాదాలపై మెటాజెనోమిక్ అంతర్దృష్టులు',సైన్స్ ఆఫ్ ది టోటల్ ఎన్విరాన్‌మెంట్, 887, p. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.
