-
PacBio-పూర్తి-నిడివి 16S/18S/ITS యాంప్లికాన్ సీక్వెన్సింగ్
యాంప్లికాన్ (16S/18S/ITS) ప్లాట్‌ఫారమ్ మైక్రోబియల్ డైవర్సిటీ ప్రాజెక్ట్ విశ్లేషణలో సంవత్సరాల అనుభవంతో అభివృద్ధి చేయబడింది, ఇందులో ప్రామాణిక ప్రాథమిక విశ్లేషణ మరియు వ్యక్తిగతీకరించిన విశ్లేషణ ఉన్నాయి: ప్రాథమిక విశ్లేషణ ప్రస్తుత సూక్ష్మజీవుల పరిశోధన యొక్క ప్రధాన స్రవంతి విశ్లేషణ కంటెంట్‌ను కవర్ చేస్తుంది, విశ్లేషణ కంటెంట్ గొప్పది మరియు సమగ్రమైనది, మరియు విశ్లేషణ ఫలితాలు ప్రాజెక్ట్ నివేదికల రూపంలో ప్రదర్శించబడతాయి;వ్యక్తిగతీకరించిన విశ్లేషణ యొక్క కంటెంట్ వైవిధ్యమైనది.వ్యక్తిగతీకరించిన అవసరాలను గ్రహించడానికి ప్రాథమిక విశ్లేషణ నివేదిక మరియు పరిశోధన ప్రయోజనం ప్రకారం నమూనాలను ఎంపిక చేసుకోవచ్చు మరియు పారామితులను సరళంగా సెట్ చేయవచ్చు.Windows ఆపరేటింగ్ సిస్టమ్, సాధారణ మరియు వేగవంతమైనది.
-
PacBio-పూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్క్రిప్ట్ (నాన్-రిఫరెన్స్)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform సీక్వెన్సింగ్ డేటాను ఇన్‌పుట్‌గా తీసుకుంటే, ఈ యాప్ పూర్తి-నిడివి గల ట్రాన్స్క్రిప్ట్ సీక్వెన్స్‌లను (అసెంబ్లీ లేకుండా) గుర్తించగలదు.రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌కు వ్యతిరేకంగా పూర్తి-నిడివి సీక్వెన్స్‌లను మ్యాప్ చేయడం ద్వారా, తెలిసిన జన్యువులు, ట్రాన్స్క్రిప్ట్లు, కోడింగ్ ప్రాంతాలు మొదలైన వాటి ద్వారా ట్రాన్స్క్రిప్ట్లను ఆప్టిమైజ్ చేయవచ్చు. ఈ సందర్భంలో, ప్రత్యామ్నాయ స్ప్లికింగ్ వంటి mRNA నిర్మాణాల యొక్క మరింత ఖచ్చితమైన గుర్తింపును సాధించవచ్చు.NGS ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ డేటాతో ఉమ్మడి విశ్లేషణ మరింత సమగ్రమైన ఉల్లేఖనాన్ని మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్ స్థాయిలో వ్యక్తీకరణలో మరింత ఖచ్చితమైన పరిమాణాన్ని అనుమతిస్తుంది, ఇది దిగువ అవకలన వ్యక్తీకరణ మరియు క్రియాత్మక విశ్లేషణకు ఎక్కువగా ప్రయోజనం చేకూరుస్తుంది.
-
టూల్‌కిట్‌లు
BMKCloud అనేది జెనోమిక్ ప్రోగ్రామ్‌ల కోసం వన్-స్టాప్ సొల్యూషన్‌ను అందించే ఒక ప్రముఖ ప్లాట్‌ఫారమ్, ఇది వైద్య, వ్యవసాయ, పర్యావరణ మొదలైన వివిధ రంగాలలోని పరిశోధకులచే విస్తృతంగా విశ్వసించబడింది. BMKCloud బయోఇన్ఫర్మేటిక్ అనాలిసిస్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లు మరియు సాధనాలతో సహా సమీకృత, విశ్వసనీయ మరియు సమర్థవంతమైన సేవలను అందించడానికి కట్టుబడి ఉంది. , కంప్యూటింగ్ వనరులు, పబ్లిక్ డేటాబేస్, బయోఇన్ఫర్టిక్ ఆన్‌లైన్ కోర్సులు మొదలైనవి. BMKCloudలో జన్యు ఉల్లేఖన, పరిణామాత్మక జన్యు సాధనాలు, ncRNA, డేటా నాణ్యత నియంత్రణ, అసెంబ్లీ, అమరిక, డేటా వెలికితీత, ఉత్పరివర్తనలు, గణాంకాలు, ఫిగర్ జనరేటర్, సీక్వెన్స్‌తో సహా తరచుగా ఉపయోగించే బయోఇన్ఫర్మేటిక్ సాధనాలు ఉన్నాయి. విశ్లేషణ, మొదలైనవి
-
చిన్న RNA
చిన్న RNAలు miRNA, siRNA మరియు piRNAలతో సహా సగటు పొడవు 18-30 ntతో కూడిన చిన్న నాన్-కోడింగ్ RNA రకం.ఈ చిన్న RNAలు mRNA క్షీణత, అనువాద నిరోధం, హెటెరోక్రోమాటిన్ నిర్మాణం మొదలైన వివిధ జీవ ప్రక్రియలలో పాలుపంచుకున్నట్లు నివేదించబడ్డాయి. జంతు/వృక్ష అభివృద్ధి, వ్యాధి, వైరస్ మొదలైన వాటిపై అధ్యయనాలలో చిన్న RNA సీక్వెన్సింగ్ విశ్లేషణ విస్తృతంగా వర్తించబడుతుంది. సీక్వెన్సింగ్ విశ్లేషణ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లో ప్రామాణిక విశ్లేషణ మరియు అధునాతన డేటా మైనింగ్ ఉంటాయి.RNA-seq డేటా ఆధారంగా, ప్రామాణిక విశ్లేషణ miRNA గుర్తింపు మరియు అంచనా, miRNA లక్ష్య జన్యు అంచనా, ఉల్లేఖన మరియు వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణలను సాధించగలదు.అధునాతన విశ్లేషణ అనుకూలీకరించిన miRNA శోధన మరియు వెలికితీత, వెన్ రేఖాచిత్రం ఉత్పత్తి, miRNA మరియు లక్ష్య జన్యు నెట్‌వర్క్ నిర్మాణాన్ని ప్రారంభిస్తుంది.
-
NGS-WGS (ఇల్యూమినా/BGI)
NGS-WGS అనేది పూర్తి జీనోమ్ రీ-సీక్వెన్సింగ్ అనాలిసిస్ ప్లాట్‌ఫారమ్, ఇది బయోమార్కర్ టెక్నాలజీస్‌లో గొప్ప అనుభవం ఆధారంగా అభివృద్ధి చేయబడింది.ఇల్యూమినా ప్లాట్‌ఫారమ్ మరియు BGI సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్ రెండింటి నుండి రూపొందించబడిన DNA సీక్వెన్సింగ్ డేటాకు సరిపోయే కొన్ని ప్రాథమిక పారామీటర్‌లను సెట్ చేయడం ద్వారా ఈ సులభమైన-ఉపయోగ ప్లాట్‌ఫారమ్ ఇంటిగ్రేటెడ్ అనాలిసిస్ వర్క్‌ఫ్లోను త్వరగా సమర్పించడానికి అనుమతిస్తుంది.ఈ ప్లాట్‌ఫారమ్ అధిక పనితీరు గల కంప్యూటింగ్ సర్వర్‌లో అమలు చేయబడింది, ఇది చాలా పరిమిత సమయంలో అత్యంత సమర్థవంతమైన డేటా విశ్లేషణకు శక్తినిస్తుంది.పరివర్తన చెందిన జన్యు ప్రశ్న, PCR ప్రైమర్ డిజైన్ మొదలైన వాటితో సహా ప్రామాణిక విశ్లేషణ ఆధారంగా వ్యక్తిగతీకరించిన డేటా మైనింగ్ అందుబాటులో ఉంది.
-
mRNA(సూచన)
ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ అనేది జెనోమిక్ జెనెటిక్ ఇన్ఫర్మేషన్ మరియు బయోలాజికల్ ఫంక్షన్ యొక్క ప్రోటీమ్ మధ్య లింక్.లిప్యంతరీకరణ స్థాయి నియంత్రణ అనేది జీవుల యొక్క అత్యంత ముఖ్యమైన మరియు అత్యంత విస్తృతంగా అధ్యయనం చేయబడిన నియంత్రణ విధానం.ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ అనేది ఒక న్యూక్లియోటైడ్‌కు ఖచ్చితమైన రిజల్యూషన్‌తో ఏ సమయంలోనైనా లేదా ఏ పరిస్థితిలోనైనా ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్‌ను క్రమం చేయగలదు. ఇది జన్యు లిప్యంతరీకరణ స్థాయిని డైనమిక్‌గా ప్రతిబింబిస్తుంది, అరుదైన మరియు సాధారణ ట్రాన్స్క్రిప్ట్లను ఏకకాలంలో గుర్తించి మరియు లెక్కించవచ్చు మరియు నిర్మాణాత్మక సమాచారాన్ని అందిస్తుంది. నమూనా నిర్దిష్ట ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్.
ప్రస్తుతం, జంతు మరియు మొక్కల అభివృద్ధి నియంత్రణ, పర్యావరణ అనుసరణ, రోగనిరోధక పరస్పర చర్య, జన్యు స్థానికీకరణ, జాతుల జన్యు పరిణామం మరియు కణితి మరియు జన్యు వ్యాధుల గుర్తింపుతో సహా వ్యవసాయ శాస్త్రం, ఔషధం మరియు ఇతర పరిశోధన రంగాలలో ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ సీక్వెన్సింగ్ సాంకేతికత విస్తృతంగా ఉపయోగించబడుతోంది.
-
మెటాజెనోమిక్స్ (NGS)
ఈ విశ్లేషణ ప్లాట్‌ఫారమ్ సంవత్సరాల అనుభవం ఆధారంగా షాట్‌గన్ మెటాజెనోమిక్ డేటా విశ్లేషణ కోసం రూపొందించబడింది.ఇది డేటా ప్రాసెసింగ్, జాతుల-స్థాయి అధ్యయనాలు, జన్యు పనితీరు-స్థాయి అధ్యయనాలు, మెటాజెనోమ్ బిన్నింగ్ మొదలైన వాటితో సహా సాధారణంగా అవసరమైన వివిధ మెటాజెనోమిక్స్ విశ్లేషణలను కలిగి ఉన్న సమీకృత వర్క్‌ఫ్లోను కలిగి ఉంటుంది. అదనంగా, జన్యు మరియు జాతుల ప్రశ్నతో సహా ప్రామాణిక విశ్లేషణ వర్క్‌ఫ్లోపై అనుకూలీకరించిన డేటా మైనింగ్ సాధనాలు అందుబాటులో ఉన్నాయి. , పారామీటర్ సెట్టింగ్, వ్యక్తిగతీకరించిన ఫిగర్ జనరేటింగ్ మొదలైనవి.
-
LncRNA
లాంగ్ నాన్-కోడింగ్ ఆర్‌ఎన్‌ఏలు (lncRNA) 200 nt కంటే ఎక్కువ పొడవు కలిగిన ఒక రకమైన ట్రాన్స్క్రిప్ట్లు, ఇవి ప్రోటీన్‌లను కోడ్ చేయలేవు.చాలా వరకు lncRNAలు క్రియాత్మకంగా ఉండే అవకాశం ఉందని సంచిత ఆధారాలు సూచిస్తున్నాయి.హై-త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్ టెక్నాలజీలు మరియు బయోఇన్ఫర్మేటిక్ అనలైజింగ్ టూల్స్ lncRNA సీక్వెన్స్‌లను మరియు పొజిషనింగ్ సమాచారాన్ని మరింత సమర్థవంతంగా బహిర్గతం చేయడానికి మరియు కీలకమైన రెగ్యులేటరీ ఫంక్షన్‌లతో lncRNAలను కనుగొనేలా మాకు శక్తిని అందిస్తాయి.BMKCloud వేగవంతమైన, నమ్మదగిన మరియు సౌకర్యవంతమైన lncRNA విశ్లేషణను సాధించడానికి మా వినియోగదారులకు lncRNA సీక్వెన్సింగ్ విశ్లేషణ ప్లాట్‌ఫారమ్‌ను అందించడం గర్వంగా ఉంది.
-
GWAS
జీనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ స్టడీ (GWAS) నిర్దిష్ట లక్షణాలతో (ఫినోటైప్) అనుబంధించబడిన జన్యు వైవిధ్యాలను (జెనోటైప్) గుర్తించడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది.GWA అధ్యయనాలు పెద్ద సంఖ్యలో వ్యక్తుల యొక్క జన్యు గుర్తులను క్రాస్ మొత్తం జన్యువును పరిశోధిస్తాయి మరియు జనాభా స్థాయిలో గణాంక విశ్లేషణ ద్వారా జన్యురూపం-సమలక్షణ అనుబంధాలను అంచనా వేస్తుంది.పూర్తి-జన్యు సారూప్యత అన్ని జన్యు వైవిధ్యాలను సమర్థవంతంగా కనుగొనగలదు.సమలక్షణ డేటాతో కలపడం, GWAS సమలక్షణ సంబంధిత SNPలు, QTLలు మరియు అభ్యర్థి జన్యువులను గుర్తించడానికి ప్రాసెస్ చేయవచ్చు, ఇది ఆధునిక జంతు/మొక్కల పెంపకాన్ని బలంగా బ్యాకప్ చేస్తుంది.SLAF అనేది స్వీయ-అభివృద్ధి చెందిన సరళీకృత జీనోమ్ సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం, ఇది జీనోమ్-వైడ్ డిస్ట్రిబ్యూటెడ్ మార్కర్స్, SNP.ఈ SNPలు, పరమాణు జన్యు మార్కర్‌లుగా, లక్ష్య లక్షణాలతో అనుబంధ అధ్యయనాల కోసం ప్రాసెస్ చేయబడతాయి.సంక్లిష్ట లక్షణాల అనుబంధిత జన్యు వైవిధ్యాలను గుర్తించడంలో ఇది ఖర్చుతో కూడుకున్న వ్యూహం.
-
నానోపోర్ పూర్తి-నిడివి ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్స్
జీవులలో సంక్లిష్టమైన మరియు వేరియబుల్ ప్రత్యామ్నాయ ఐసోఫాంలు జన్యు వ్యక్తీకరణ మరియు ప్రోటీన్ వైవిధ్యాన్ని నియంత్రించడానికి ముఖ్యమైన జన్యు విధానాలు.ట్రాన్స్క్రిప్ట్ నిర్మాణాల యొక్క ఖచ్చితమైన గుర్తింపు జన్యు వ్యక్తీకరణ నియంత్రణ నమూనాల యొక్క లోతైన అధ్యయనానికి ఆధారం.నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్ ప్లాట్‌ఫారమ్ విజయవంతంగా ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్ అధ్యయనాన్ని ఐసోఫార్మ్-స్థాయికి తీసుకువచ్చింది.ఈ విశ్లేషణ ప్లాట్‌ఫారమ్ నానోపోర్ ప్లాట్‌ఫారమ్‌లో ఉత్పత్తి చేయబడిన RNA-Seq డేటాను రిఫరెన్స్ జీనోమ్ ఆధారంగా విశ్లేషించడానికి రూపొందించబడింది, ఇది జన్యు స్థాయి మరియు ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్ స్థాయి రెండింటిలోనూ గుణాత్మక మరియు పరిమాణాత్మక విశ్లేషణలను సాధిస్తుంది.
-
సర్క్-RNA
వృత్తాకార RNA(circRNA) అనేది ఒక రకమైన నాన్-కోడింగ్ RNA, ఇది అభివృద్ధి, పర్యావరణ ప్రతిఘటన మొదలైన వాటిలో నియంత్రిత నెట్‌వర్క్‌లలో కీలక పాత్ర పోషిస్తుందని ఇటీవల కనుగొనబడింది. సరళ RNA అణువుల నుండి భిన్నంగా ఉంటుంది, ఉదా mRNA, lncRNA, 3′ మరియు 5′ సర్క్‌ఆర్‌ఎన్‌ఎ చివరలు ఒక వృత్తాకార నిర్మాణాన్ని ఏర్పరుస్తాయి, ఇవి వాటిని ఎక్సోన్యూకలీస్ జీర్ణక్రియ నుండి రక్షిస్తాయి మరియు చాలా సరళ ఆర్‌ఎన్‌ఏ కంటే స్థిరంగా ఉంటాయి.జన్యు వ్యక్తీకరణను నియంత్రించడంలో CircRNA విభిన్న విధులను కలిగి ఉన్నట్లు కనుగొనబడింది.CircRNA ceRNA వలె పని చేయగలదు, ఇది miRNAని పోటీగా బంధిస్తుంది, దీనిని miRNA స్పాంజ్ అని పిలుస్తారు.CircRNA సీక్వెన్సింగ్ విశ్లేషణ వేదిక circRNA నిర్మాణం మరియు వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ, లక్ష్య అంచనా మరియు ఇతర రకాల RNA అణువులతో ఉమ్మడి విశ్లేషణను శక్తివంతం చేస్తుంది
-
BSA
బల్క్డ్ సెగ్రెగెంట్ అనాలిసిస్ ప్లాట్‌ఫారమ్ ఒక-దశ ప్రామాణిక విశ్లేషణ మరియు అనుకూలీకరించిన పారామీటర్ సెట్టింగ్‌తో అధునాతన విశ్లేషణను కలిగి ఉంటుంది.BSA అనేది ఫినోటైప్ సంబంధిత జన్యు గుర్తులను త్వరగా గుర్తించడానికి ఉపయోగించే ఒక సాంకేతికత.BSA యొక్క ప్రధాన వర్క్‌ఫ్లో వీటిని కలిగి ఉంటుంది: 1. చాలా వ్యతిరేక సమలక్షణాలతో వ్యక్తుల యొక్క రెండు సమూహాలను ఎంచుకోవడం;2. DNA, RNA లేదా SLAF-seq (బయోమార్కర్‌చే అభివృద్ధి చేయబడింది) వ్యక్తులందరినీ కలిపి రెండు భారీ DNAలను ఏర్పరచడం;3. రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌కి వ్యతిరేకంగా లేదా మధ్యలో ఉన్న అవకలన శ్రేణులను గుర్తించడం, 4. ED మరియు SNP-ఇండెక్స్ అల్గారిథమ్ ద్వారా అభ్యర్థి అనుసంధానిత ప్రాంతాలను అంచనా వేయడం;5. అభ్యర్థి ప్రాంతాలలో జన్యువులపై ఫంక్షనల్ విశ్లేషణ మరియు సుసంపన్నత మొదలైనవి. జన్యు మార్కర్ స్క్రీనింగ్ మరియు ప్రైమర్ డిజైన్‌తో సహా డేటాలో మరింత అధునాతన మైనింగ్ కూడా అందుబాటులో ఉన్నాయి.
