తగ్గిన ప్రాతినిధ్య బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (RRBS)
తగ్గిన ప్రాతినిధ్య బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (RRBS) అనేది CpG ద్వీపం అధికంగా ఉండే ప్రాంతాలను MspI క్లీవేజ్ ద్వారా సుసంపన్నం చేయడంపై ఆధారపడి ఉంటుంది, ఆ తర్వాత 200-500/600 bps భాగాల పరిమాణ ఎంపిక జరుగుతుంది. పర్యవసానంగా, CpG దీవులకు దగ్గరగా ఉన్న ప్రాంతాలు మాత్రమే క్రమం చేయబడతాయి, అయితే సుదూర CpG దీవులు ఉన్నవి విశ్లేషణ నుండి మినహాయించబడతాయి. ఈ ప్రక్రియ, బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్తో కలిపి, DNA మిథైలేషన్ యొక్క అధిక-రిజల్యూషన్ గుర్తింపును అనుమతిస్తుంది మరియు సీక్వెన్సింగ్ విధానం, PE150, మధ్యలో కాకుండా ఇన్సర్ట్ల చివరలపై ప్రత్యేకంగా దృష్టి పెడుతుంది, మిథైలేషన్ ప్రొఫైలింగ్ సామర్థ్యాన్ని పెంచుతుంది.
DNA మిథైలేషన్ పరిశోధనలో హోల్ జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ (WGBS) కు ఖర్చుతో కూడుకున్న మరియు సమర్థవంతమైన ప్రత్యామ్నాయంగా ఈ సాంకేతికత ఉద్భవించింది. WGBS మొత్తం జన్యువును సింగిల్ బేస్ రిజల్యూషన్లో పరిశీలించడం ద్వారా సమగ్ర అంతర్దృష్టులను అందిస్తుంది, అయితే దాని అధిక ధర పరిమితం చేసే అంశం కావచ్చు, RRBS వ్యూహాత్మకంగా జన్యువు యొక్క ప్రతినిధి భాగాన్ని ఎంపిక చేసి విశ్లేషించడం ద్వారా ఈ సవాలును తగ్గిస్తుంది. ఈ పద్దతి ఖర్చుతో కూడుకున్న DNA మిథైలేషన్ పరిశోధనను ప్రారంభించే మరియు బాహ్యజన్యు విధానాల జ్ఞానాన్ని అభివృద్ధి చేసే అమూల్యమైన సాధనం.
సేవా లక్షణాలు
● ఇల్యూమినా నోవాసెక్లో సీక్వెన్సింగ్.
● రిఫరెన్స్ జీనోమ్ అవసరం.
● బైసల్ఫైట్ మార్పిడి సామర్థ్యాన్ని పర్యవేక్షించడానికి లాంబ్డా DNA ఉపయోగించబడుతుంది.
● MspI జీర్ణ సామర్థ్యం కూడా పర్యవేక్షించబడుతుంది.
● మొక్కల నమూనాల కోసం డబుల్ ఎంజైమ్ జీర్ణక్రియ.
సేవా ప్రయోజనాలు
●WGBS కు ఖర్చు-సమర్థవంతమైన మరియు సమర్థవంతమైన ప్రత్యామ్నాయం: ఇది తక్కువ ఖర్చుతో మరియు తక్కువ నమూనా అవసరాలతో విశ్లేషణను నిర్వహించడానికి వీలు కల్పిస్తుంది.
●పూర్తి వేదిక:మేము నమూనా ప్రాసెసింగ్, లైబ్రరీ నిర్మాణం మరియు సీక్వెన్సింగ్ నుండి బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్ విశ్లేషణ వరకు వన్-స్టాప్ అద్భుతమైన సేవలను అందిస్తాము.
●విస్తృతమైన నైపుణ్యం: విభిన్న జాతులలో మేము విజయం సాధించాము. BMKGENE దశాబ్దానికి పైగా అనుభవం, అత్యంత నైపుణ్యం కలిగిన విశ్లేషణ బృందం, సమగ్ర కంటెంట్ మరియు అద్భుతమైన అమ్మకాల తర్వాత మద్దతును అందిస్తుంది.
సేవా లక్షణాలు
| లైబ్రరీ | సీక్వెన్సింగ్ స్ట్రాటజీ | సిఫార్సు చేయబడిన డేటా అవుట్పుట్ | నాణ్యత నియంత్రణ |
| MspI జీర్ణమై బైసల్ఫైట్ చికిత్స చేయబడిన లైబ్రరీ | ఇల్యూమినా PE150 | 8 జిబి | క్యూ30 ≥ 85% బైసల్ఫైట్ మార్పిడి > 99% MspI కటింగ్ సామర్థ్యం > 95% |
నమూనా అవసరాలు
| గాఢత (ng/µL) | మొత్తం పరిమాణం (µg) |
| |
| జన్యుసంబంధమైన DNA | ≥ 30 | ≥ 1 (1) | పరిమిత క్షీణత లేదా కాలుష్యం |
సర్వీస్ వర్క్ ఫ్లో
నమూనా డెలివరీ
లైబ్రరీ నిర్మాణం
సీక్వెన్సింగ్
డేటా విశ్లేషణ
అమ్మకాల తర్వాత సేవలు
BI విశ్లేషణలో ఇవి ఉన్నాయి:
● ముడి శ్రేణి నాణ్యత నియంత్రణ;
● రిఫరెన్స్ జీనోమ్కు మ్యాపింగ్;
● 5mC మిథైలేటెడ్ బేస్లను గుర్తించడం మరియు మోటిఫ్ గుర్తింపు;
● మిథైలేషన్ పంపిణీ మరియు నమూనా పోలిక విశ్లేషణ;
● డిఫరెన్షియల్లీ మిథైలేటెడ్ ప్రాంతాల విశ్లేషణ (DMRలు);
● DMR లకు సంబంధించిన జన్యువుల క్రియాత్మక ఉల్లేఖనం.
నాణ్యత నియంత్రణ: జీర్ణ సామర్థ్యం (జీనోమ్ మ్యాపింగ్లో)
నాణ్యత నియంత్రణ: బైసల్ఫైట్ మార్పిడి (మిథైలేషన్ సమాచార వెలికితీతలో)
మిథైలేషన్ మ్యాప్: 5mC మిథైలేషన్ జీనోమ్-వైడ్ డిస్ట్రిబ్యూషన్
నమూనా పోలిక: ప్రధాన భాగం విశ్లేషణ
డిఫరెన్షియల్లీ మిథైలేటెడ్ రీజియన్స్ (DMRలు) విశ్లేషణ: హీట్మ్యాప్
BMKGene యొక్క మొత్తం జీనోమ్ బైసల్ఫైట్ సీక్వెన్సింగ్ సేవల ద్వారా సులభతరం చేయబడిన పరిశోధన పురోగతులను ప్రచురణల సేకరణ ద్వారా అన్వేషించండి.
లి, జెడ్. మరియు ఇతరులు (2022) 'CRISPR యాక్టివేషన్ మరియు పారాక్రిన్ కారకాల ద్వారా లేడిగ్ లాంటి కణాలలోకి హై-ఫిడిలిటీ రీప్రోగ్రామింగ్',PNAS నెక్సస్, 1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
టియాన్, హెచ్. మరియు ఇతరులు (2023) 'చైనీస్ మోనోజైగోటిక్ కవలలలో శరీర కూర్పు యొక్క జీనోమ్-వైడ్ DNA మిథైలేషన్ విశ్లేషణ',యూరోపియన్ జర్నల్ ఆఫ్ క్లినికల్ ఇన్వెస్టిగేషన్, 53(11), p. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
వు, వై. మరియు ఇతరులు (2022) 'DNA మిథైలేషన్ మరియు నడుము-నుండి-తుంటి నిష్పత్తి: చైనీస్ మోనోజైగోటిక్ కవలలలో ఎపిజెనోమ్-వైడ్ అసోసియేషన్ అధ్యయనం',జర్నల్ ఆఫ్ ఎండోక్రినాలజికల్ ఇన్వెస్టిగేషన్, 45(12), పేజీలు. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
