-
Транскриптомияи пурраи PacBio (ғайри истинод)
Платформаи Amplicon (16S/18S/ITS) бо таҷрибаи чандинсолаи таҳлили лоиҳаи гуногунии микробҳо таҳия шудааст, ки дорои таҳлили стандартии асосӣ ва таҳлили фардӣ мебошад: таҳлили асосӣ мундариҷаи таҳлили асосии тадқиқоти микробиологиро дар бар мегирад, мундариҷаи таҳлил бой ва ҳамаҷониба аст, ва натиҷаҳои таҳлил дар шакли ҳисоботи лоиҳа пешниҳод карда мешаванд;Мазмуни таҳлили фардӣ гуногун аст.Намунаҳоро метавон интихоб кард ва параметрҳоро мувофиқи гузориши таҳлили асосӣ ва ҳадафи тадқиқот чандир муқаррар кардан мумкин аст, то ки талаботи фардӣ амалӣ карда шавад.Системаи оператсионии Windows, оддӣ ва зуд.
-
Транскриптомияи пурраи PacBio (ғайри истинод)
Бо назардошти маълумоти пайдарпайии Isoform Biosciences Pacific Biosciences (PacBio), ин барнома қодир аст пайдарпайии транскрипти пурраи дарозмӯҳлатро (бе васл) муайян кунад.Тавассути харитасозии пайдарпаии пурраи дарозмӯҳлат бар зидди геномҳои истинод, транскриптҳоро метавон тавассути генҳои маълум, транскриптҳо, минтақаҳои рамзгузорӣ ва ғайра оптимизатсия кард. Дар ин ҳолат, муайянкунии дақиқи сохторҳои mRNA, ба монанди сплайсинги алтернативӣ ва ғайра имконпазир аст.Таҳлили муштарак бо маълумоти пайдарпайии транскриптомҳои NGS имкон медиҳад, ки тавзеҳи ҳамаҷониба ва миқдори дақиқтар дар ифода дар сатҳи транскрипт, ки асосан аз ифодаи дифференсиалии поёноб ва таҳлили функсионалӣ манфиат меорад.
-
Маҷмӯаҳои асбобҳо
BMKCloud як платформаи пешбари биоинформатикӣ мебошад, ки ҳалли якдафъаина барои барномаҳои геномӣ мебошад, ки ба он муҳаққиқон дар арсаҳои гуногун, аз ҷумла тиббӣ, кишоварзӣ, экологӣ ва ғайра эътимоди васеъ доранд. BMKCloud ӯҳдадор аст, ки хидматҳои ҳамгирошуда, боэътимод ва муассир, аз ҷумла платформаҳо ва абзорҳои таҳлили биоинформатикиро пешниҳод кунад. , захираҳои компютерӣ, базаи ҷамъиятӣ, курсҳои онлайни биоинформатикӣ ва ғайра. BMKCloud дорои абзорҳои гуногуни биоинформатикии зуд-зуд истифодашаванда, аз ҷумла шарҳи ген, абзорҳои генетикии эволютсионӣ, ncRNA, назорати сифати додаҳо, васлкунӣ, ҳамоҳангсозӣ, истихроҷи додаҳо, мутатсияҳо, омор, генератори рақамҳо, пайдарпаӣ мебошад. таҳлил ва ғ.
-
РНК хурд
РНК-ҳои хурд як намуди РНК-и кӯтоҳи рамзгузоранда нестанд, ки дарозии миёна 18-30 нтро ташкил медиҳанд, аз ҷумла miRNA, siRNA ва piRNA.Ин РНК-ҳои хурд ба таври оммавӣ гузориш дода шудаанд, ки дар равандҳои гуногуни биологӣ, аз қабили таназзули mRNA, ҷилавгирӣ аз тарҷума, ташаккули гетерохроматин ва ғайра иштирок мекунанд. Таҳлили пайдарпайии SmallRNA дар таҳқиқот оид ба рушди ҳайвонот/настаниҳо, бемориҳо, вирусҳо ва ғайра васеъ истифода шудааст. РНК хурд. платформаи таҳлили пайдарпайӣ иборат аст аз таҳлили стандартӣ ва истихроҷи маълумоти пешрафта.Дар асоси маълумоти RNA-seq, таҳлили стандартӣ метавонад муайянсозӣ ва пешгӯии miRNA, пешгӯии генҳои ҳадафи miRNA, эзоҳ ва таҳлили баёнро ба даст орад.Таҳлили пешрафта имкон медиҳад ҷустуҷӯ ва истихроҷи фармоишии miRNA, тавлиди диаграммаи Венн, miRNA ва сохтани шабакаи генҳои ҳадаф.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS як платформаи пурраи таҳлили такрори геномҳо мебошад, ки дар асоси таҷрибаи бой дар Biomarker Technologies таҳия шудааст.Ин платформаи истифодаи осон имкон медиҳад, ки ҷараёни кории ҳамгирошудаи таҳлил тавассути муқаррар кардани чанд параметри асосӣ, ки барои маълумоти пайдарпайии ДНК, ки аз платформаи Illumina ва платформаи пайдарпайии BGI тавлид шудаанд, мувофиқат кунад.Ин платформа дар сервери ҳисоббарории баландсифат ҷойгир карда шудааст, ки дар муддати хеле маҳдуд таҳлили самараноки маълумотро фароҳам меорад.Истихроҷи фардии додаҳо дар асоси таҳлили стандартӣ, аз ҷумла дархости генҳои мутатсияшуда, тарроҳии праймери PCR ва ғайра дастрас аст.
-
mRNA(Истинодия)
Транскриптом пайванди байни иттилооти генетикии геномӣ ва протеомаи функсияи биологӣ мебошад.Танзими сатҳи транскриптӣ усули муҳимтарин ва васеъ омӯхташудаи танзими организмҳо мебошад.пайдарпайии транскриптом метавонад транскриптомро дар ҳар лаҳзаи вақт ё дар ҳама гуна шароит бо резолюцияи дақиқ ба як нуклеотид тартиб диҳад. Он метавонад сатҳи транскрипсияи генро динамикӣ инъикос кунад, ҳамзамон транскриптҳои нодир ва муқаррариро муайян ва муайян кунад ва иттилооти сохтории намунаи стенограммаҳои мушаххас.
Дар айни замон, технологияи пайдарпайии транскриптом дар агрономия, тиб ва дигар соҳаҳои тадқиқотӣ, аз ҷумла танзими рушди ҳайвонот ва растаниҳо, мутобиқсозии муҳити зист, таъсири мутақобилаи иммунӣ, локализатсияи генҳо, эволютсияи генетикии намудҳо ва ошкор кардани варамҳо ва бемориҳои генетикӣ васеъ истифода мешавад.
-
Метагеномика (NGS)
Ин платформаи таҳлилӣ барои таҳлили маълумоти метагеномии тир дар асоси таҷрибаи чандинсола тарҳрезӣ шудааст.Он ҷараёнҳои ҳамгирошудаи кориро дар бар мегирад, ки таҳлилҳои маъмулан зарурии метагеномикиро дар бар мегирад, аз ҷумла коркарди маълумот, таҳқиқот дар сатҳи намудҳо, омӯзиши сатҳи функсияи генҳо, пайвандкунии метагеномҳо ва ғайра. Илова бар ин, асбобҳои фармоишии истихроҷи додаҳо дар ҷараёни таҳлили стандартӣ, аз ҷумла дархости генҳо ва намудҳо мавҷуданд. , танзими параметрҳо, тавлиди рақамҳои фардӣ ва ғайра.
-
LncRNA
РНК-ҳои дарозмуддати рамзгузорӣнашаванда (lncRNA) як намуди транскриптҳо мебошанд, ки дарозии онҳо аз 200 нт зиёд аст, ки сафедаҳои сафедаҳоро рамзгузорӣ карда наметавонанд.Далелҳои ҷамъшуда нишон медиҳанд, ки аксарияти lncRNAҳо эҳтимолияти функсионалӣ доранд.Технологияҳои пайдарпайии баландсуръат ва абзорҳои таҳлили биоинформатикӣ ба мо имкон медиҳанд, ки пайдарпаии lncRNA ва ҷойгиркунии иттилоотро самараноктар ошкор созем ва моро водор созанд, ки lncRNA-ҳоро бо функсияҳои муҳими танзимкунанда кашф кунем.BMKCloud ифтихор дорад, ки ба мизоҷони мо платформаи таҳлили пайдарпайии lncRNA барои ноил шудан ба таҳлили зуд, боэътимод ва фасеҳи lncRNA пешниҳод кунад.
-
GWAS
Омӯзиши ассотсиатсияи умуми геномӣ (GWAS) ба муайян кардани вариантҳои генетикӣ (генотип), ки бо хислатҳои мушаххас (фенотип) алоқаманданд, равона шудааст.Таҳқиқоти GWA маркерҳои генетикиро убури тамоми геноми шумораи зиёди одамонро меомӯзанд ва ассотсиатсияҳои генотип-фенотипро тавассути таҳлили оморӣ дар сатҳи аҳолӣ пешгӯӣ мекунанд.Тағйирёбии геномҳои пурра метавонад ҳама вариантҳои генетикиро кашф кунад.Дар якҷоягӣ бо маълумоти фенотипӣ, GWAS-ро барои муайян кардани SNP-ҳои марбут ба фенотип, QTL ва генҳои номзад коркард кардан мумкин аст, ки парвариши муосири ҳайвонот/набототро сахт дастгирӣ мекунад.SLAF як стратегияи соддакардашудаи пайдарпайии геномест, ки SNP-ро дар саросари геном кашф мекунад.Ин SNPs, ҳамчун аломатҳои генетикии молекулавӣ, метавонанд барои омӯзиши ассотсиатсия бо хислатҳои мақсаднок коркард карда шаванд.Ин як стратегияи камхарҷ дар муайян кардани хислатҳои мураккаби вариантҳои генетикӣ мебошад.
-
Nanopore Транскриптомикаи пурра
Изоформҳои алтернативии мураккаб ва тағирёбанда дар организмҳо механизмҳои муҳими генетикии танзими ифодаи генҳо ва гуногунии сафедаҳо мебошанд.Муайянкунии дақиқи сохторҳои транскрипт асоси омӯзиши амиқи шаклҳои танзими ифодаи ген мебошад.Платформаи пайдарпайии nanopore омӯзиши транскриптомиро бомуваффақият ба сатҳи изоформ расонд.Ин платформаи таҳлилӣ барои таҳлили маълумоти RNA-Seq, ки дар платформаи Nanopore дар асоси геноми истинод тавлид шудааст, тарҳрезӣ шудааст, ки ҳам дар сатҳи ген ва ҳам дар сатҳи транскриптҳо таҳлили сифатӣ ва миқдорӣ ба даст меорад.
