NGS-и пайдарпайии mRNA-и эукариотӣ
Вижагиҳо
● Омодасозии ихтиёрии китобхонаи самтии mRNA барои имкон додани гирифтани маълумоти пайдарпайии мушаххаси риштаҳо
● Таҳлилҳои гуногуни BI ҳамаи ниёзҳои муштариёни моро фаро мегиранд
Бартариҳо
●Таҷрибаи васеъМо зиёда аз 600,000 намунаро коркард кардем, ки аз намудҳои гуногуни намунаҳо, аз қабили фарҳангҳои ҳуҷайра, бофтаҳо ва моеъҳои бадан иборатанд. Мо ба ҳар як лоиҳа таҷрибаи бойи таҷрибаро пешниҳод менамоем.
●Назорати қатъии сифатМо нуқтаҳои назоратии асосиро дар ҳама марҳилаҳо, аз омода кардани намуна то омодасозии китобхона, пайдарпайӣ ва биоинформатика, татбиқ мекунем. Назорати дақиқи мо таъмини натиҷаҳои пайваста босифатро таъмин мекунад.
●Шарҳи ҳамаҷонибаМо аз пойгоҳи додаҳои сершумор барои шарҳи функсионалии генҳои ифодашудаи дифференсиалӣ (DEG) ва анҷом додани таҳлилҳои мувофиқи ғанӣгардонӣ истифода мебарем. Ин равиши ҳамаҷониба фаҳмиши равандҳои ҳуҷайравӣ ва молекулавиро, ки дар асоси вокуниши транскриптом қарор доранд, фароҳам меорад ва кафолат медиҳад, ки шумо тамоми маълумоти имконпазирро дар бораи маълумоти озмоиши худ ба даст меоред.
●Дастгирии пас аз фурӯш: Мо мефаҳмем, ки ҳузур доштан то чӣ андоза муҳим аст, аз ин рӯ, ӯҳдадории мо аз анҷоми лоиҳа берун меравад ва мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯшро дар бар мегирад. Дар ин муддат, мо пайгирии лоиҳа, кӯмаки ҳалли мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои посух додан ба ҳама гуна саволҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод менамоем.
Талабот ва таҳвили намуна
| Китобхона | Стратегияи пайдарпайӣ | Маълумоти тавсияшуда | Назорати сифат |
| Поли А-и ғанӣ гардонидашуда | Иллюмина PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Гб | Q30≥85% |
Талаботи намунавӣ:
Нуклеотидҳо:
Талаботи ҳадди ақали намуна:
| Консентратсия (нг/мкл) | Миқдор (мкг) | Покӣ | поквиҷдонӣ | |
| Китобхонаи стандартӣ | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Дар гел ифлосшавии маҳдуд ё тамоман набудани сафеда ё ДНК нишон дода шудааст. | Барои растаниҳо: RIN≥4.0; Барои ҳайвонот: RIN ≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; баландии базавӣ маҳдуд ё тамоман вуҷуд надорад |
| Китобхонаи роҳнамоӣ | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Дар гел ифлосшавии маҳдуд ё тамоман набудани сафеда ё ДНК нишон дода шудааст. | Барои растаниҳо: RIN≥4.0; Барои ҳайвонот: RIN ≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; баландии базавӣ маҳдуд ё тамоман вуҷуд надорад |
| Растаниҳо | Ҳайвон | Буғумпойҳо | Хуни пурра | Ҳуҷайраҳо |
| Реша, поя ё гулбарг: 450 мг Барг ё тухм: 300 мг Мева: 1.2 г | Дил ё рӯда: 300 мг Узвҳои дохилӣ ё мағзи сар: 240 мг Мушак: 450 мг Устухонҳо, мӯй ё пӯст: 1г | Ҳашарот: 6г Харчангшакл: 300 мг | 1 найча | 106 ҳуҷайра |
Намунаи тавсияшудаи интиқол
Зарф: найчаи сентрифугаи 2 мл (Фолгаи қалъагӣ тавсия дода намешавад)
Намунаи нишонгузорӣ: Гурӯҳ+такрорӣ, масалан, A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Интиқол:
1. Яхи хушк: Намунаҳоро бояд дар халтаҳо печонида, дар яхи хушк гӯрондан лозим аст.
2. Найчаҳои мизи РНК: Намунаҳои РНК-ро метавон дар найчаи устуворкунандаи РНК (масалан, RNAstable®) хушк кард ва дар ҳарорати хонагӣ интиқол дод.
Талабот ва таҳвили намуна
Тарроҳии таҷрибавӣ
Таҳвили намуна
истихроҷи РНК
Сохтмони китобхона
Сиквенсия
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Биоинформатика
Барои намунаҳое, ки геноми истинодии дастрас доранд, таҳлили BI чунин аст:
ØНазорати сифати маълумоти хом
ØҲамоҳангсозии геноми истинодӣ
ØТаҳлили сохтори транскрипт
ØМиқдори ифода
ØТаҳлили ифодаи дифференсиалӣ
ØШарҳ ва ғанӣ гардонидани функсия
Барои намунаҳое, ки геноми истинодӣ надоранд, ин имкони дастрас аст:
• Назорати сифати маълумоти хом
•Маҷлис бо беҳсозии сохтор
•Таҳлили ифодаи дифференсиалӣ
•Шарҳ ва ғанӣ гардонидани функсия
Ҳамоҳангсозии геноми истинодӣ
Сершавии маълумот
Ҳамбастагии намуна ва арзёбии такрорҳои биологӣ
Генҳои ифодашудаи дифференсиалӣ (DEG)
Шарҳи функсионалии DEG-ҳо
Ғанигардонии функсионалии DEG-ҳо
Пешрафтҳоеро, ки аз ҷониби хидматҳои секвенсияи mRNA-и эукариотикии NGS-и BMKGene тавассути маҷмӯаи нашрияҳои интихобшуда ба даст оварда шудаанд, омӯзед.
Хуанг, Л. ва дигарон (2023) 'Триклозан ва триклокарбан қобилияти бӯйшиносии моҳии тиллоиро тавассути маҳдуд кардани шинохти бӯй, халалдор кардани интиқоли сигнали бӯй ва халалдор кардани коркарди маълумоти бӯй суст мекунанд',Тадқиқоти об, 233, саҳ. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Ҷиа, ЛҶ ва ҳамкорон (2023) 'Aspergillus fumigatus p11-и инсонро барои равона кардани фагосомаҳои дорои замбӯруғ ба роҳи ғайритаҷзияшаванда рабуд',Мизбони ҳуҷайра ва микроб, 31(3), саҳ. 373-388.e10. дои: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Ҷин, К. ва дигарон (2022) 'Омилҳои транскрипсияи TCP, ки дар рушди навдаҳои Ма Бамбук (Dendrocalamus latiflorus Munro) иштирок мекунанд',Марзҳо дар илми растанӣ, 13, саҳ. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Вен, Х. ва дигарон (2022) 'Геноми лавандулифолиуми хризантема ва механизми молекулавии асоси намудҳои гуногуни капитулум',Таҳқиқоти боғдорӣ, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Чжан, Юҷие ва дигарон (2023) 'Нанореактори каскадӣ барои беҳтар кардани терапияи сонодинамикии саратони колоректалӣ тавассути афзоиши синергетикии ROS ва басташавии аутофагия',Нано имрӯз, 49, с. 101798. дои: 10.1016/Ч.НАНТОД.2023.101798.
