пайдарпайии mRNA эукариотӣ - Illumina
Афзалиятхо
ØТаҷрибаи баланд: Дар BMK зиёда аз 200,000 намунаҳо коркард карда шуданд, ки намудҳои гуногуни намуна, аз ҷумла фарҳанги ҳуҷайра, бофта, моеъи бадан ва ғайраро дар бар мегиранд ва зиёда аз 7,000 лоиҳаҳои mRNA-Seq, ки дар доираи тадқиқоти гуногун баста шудаанд, коркард карда шудаанд.
ØСистемаи қатъии назорати сифат: Нуқтаҳои асосии назорати сифат дар тамоми марҳилаҳо, аз ҷумла омодасозии намуна, омодасозии китобхона, пайдарпайӣ ва биоинформатика бо мақсади ба даст овардани натиҷаҳои баландсифат таҳти назорати қатъӣ қарор доранд.
ØЯкчанд пойгоҳи додаҳо барои шарҳи функсияҳо ва омӯзиши ғанисозӣ барои иҷрои ҳадафҳои гуногуни таҳқиқот дастрасанд.
ØХидматҳои пас аз фурӯш: Хидматҳои пас аз фурӯш дар тӯли 3 моҳ пас аз ба итмом расидани лоиҳа эътибор доранд, аз ҷумла пайгирии лоиҳаҳо, бартараф кардани мушкилот, натиҷаҳои саволу ҷавоб ва ғайра.
Талаботи намунавӣ ва интиқол
| Китобхона | Стратегияи пайдарпай | Маълумот тавсия дода мешавад | Назорати сифат |
| Poly A ғанӣ гардонида шудааст | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Талаботи намунавӣ:
Нуклеотидҳо:
| Покӣ | Беайбӣ | Маблағ |
| OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Маҳдуд ё тамоман ифлосшавии протеин ё ДНК дар гел нишон дода шудааст. | Барои растаниҳо: RIN≥6,5;Барои ҳайвонот: RIN≥7;28S/18S≥1,0;баландии ибтидоӣ маҳдуд ё тамоман нест | Конц.≥30 нг/мкл;Ҳаҷми ≥ 10 мкл;Ҳамагӣ ≥ 1,5 мкг |
Матоъ: Вазн (хушк):≥1 г
* Барои матоъҳои хурдтар аз 5 мг, мо тавсия медиҳем, ки намунаи бофтаи флешдор яхкардашуда (дар нитрогени моеъ) фиристед.
боздоштани ҳуҷайра:Шумораи ҳуҷайраҳо = 3 × 106- 1×107
*Мо тавсия медиҳем, ки лизати яхкардашудаи ҳуҷайраро интиқол диҳед.Агар шумораи ҳуҷайраҳо аз 5 × 105 камтар бошад, флеши дар нитрогени моеъ яхкардашуда тавсия дода мешавад, ки барои микроэкстраксия беҳтар аст.
Намунаҳои хун:Ҳаҷм ≥1 мл
Микроорганизм:Вазнаш ≥ 1 г
Интиқоли намунаи тавсияшуда
Контейнер: 2 мл найчаи центрифуга (фолгаи тунука тавсия дода намешавад)
Тамғагузории намуна: Гурӯҳ+реплика масалан A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Интиқол:
- Хушк-ях: Намунаҳо бояд дар халтаҳо баста шаванд ва дар яхи хушк дафн карда шаванд.
- Намудҳои RNAstable: Намунаҳои РНК-ро дар найчаи устуворсозии РНК хушк кардан мумкин аст (масалан, RNAstable®) ва дар ҳарорати хона интиқол дода мешавад.
Раванди кори хидмат
Тарҳрезии таҷриба
Интиқоли намуна
истихроҷи РНК
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Биоинформатика
Эукариот Ҷараёни кории таҳлили пайдарпайии mRNA
Биоинформатика
ØНазорати сифати маълумоти хом
ØҲамоҳангсозии геномҳои истинод
ØТаҳлили сохтори транскрипт
ØМиқдори ифода
ØТаҳлили ифодаи дифференсиалӣ
ØАннотация ва ғанисозии функсия
1.mRNA хати каҷшавии маълумот
2.Таҳлили ифодаи дифференсиалӣ - Қитъаи вулқон
3.Тавсифи KEGG дар DEGs
4.Таснифи GO дар DEGs
