Таҳлили ассотсиатсияи саросарии геном
Ҷараёни корӣ
Бартариятҳои хизматрасонӣ
●Сабтҳои васеи коршиносӣ ва нашрияҳоБо таҷрибаи ҷамъшуда дар GWAS, BMKGene садҳо лоиҳаҳои намудҳоро дар таҳқиқоти популятсия GWAS анҷом додааст, ба муҳаққиқон дар нашри зиёда аз 100 мақола кумак кардааст ва омили таъсири ҷамъшуда ба 500 расидааст.
● Таҳлили ҳамаҷонибаи биоинформатикаҶараёни корӣ таҳлили ассотсиатсияи хусусиятҳои SNP-ро дар бар мегирад, ки маҷмӯи генҳои номзад ва аннотатсияи функсионалии мувофиқи онҳоро пешниҳод мекунад.
●Гурӯҳи баландихтисоси биоинформатик ва давраи кӯтоҳи таҳлилБо таҷрибаи бузург дар таҳлили пешрафтаи геномика, дастаи BMKGene таҳлилҳои ҳамаҷонибаро бо муддати кӯтоҳ анҷом медиҳад.
●Дастгирии пас аз фурӯш:Ӯҳдадории мо аз анҷоми лоиҳа фаротар меравад ва мӯҳлати хидматрасонии пас аз фурӯши 3-моҳаро дар бар мегирад. Дар ин муддат, мо пайгирии лоиҳа, кӯмаки ҳалли мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои посух додан ба ҳама гуна саволҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод менамоем.
Мушаххасот ва талаботи хидматрасонӣ
| Навъи пайдарпайӣ | Миқёси тавсияшудаи аҳолӣ | Стратегияи пайдарпайӣ | Талабот ба нуклеотид |
| Пайдарпайии пурраи геном | 200 намуна | 10x | Консентратсия: ≥ 1 нг/µL Миқдори умумӣ ≥ 30 нг Таназзул ё ифлосшавии маҳдуд ё тамоман вуҷуд надорад |
| Қисмати тақвиятёфтаи дорои локуси мушаххас (SLAF) | Чуқурии барчасп: 10x Шумораи барчаспҳо: < 400 Мб: WGS тавсия дода мешавад < 1 ГБ: 100 ҳазор барчасп 1 ГБ > 2 ГБ: 300 ҳазор барчасп Ҳадди аксар 500 ҳазор барчасп | Консентратсия ≥ 5 нг/µL Миқдори умумӣ ≥ 80 нг Наноқатра OD260/280=1.6-2.5 Гели агароз: таҷзия ё ифлосшавӣ надорад ё маҳдуд
|
Интихоби мавод
Навъҳои гуногун, зернамудҳо, нажодҳои ландшафтӣ/бонкҳои генӣ/оилаҳои омехта/захираҳои ваҳшӣ
Навъҳои гуногун, зернамудҳо, нажодҳои ландшафтӣ
Оилаи нимхоҳар/оилаи пуррахоҳар/захираҳои ваҳшӣ
Ҷараёни кори хидматрасонӣ
Тарроҳии таҷрибавӣ
Таҳвили намуна
истихроҷи РНК
Сохтмони китобхона
Сиквенсия
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Таҳлили зеринро дар бар мегирад:
- Таҳлили ассотсиатсияи саросарии геном: модели LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Аннотатсияи функсионалии генҳои номзад
Таҳлили ассотсиатсияи хусусияти SNP - қитъаи Манҳэттен
Таҳлили ассотсиатсияи хусусияти SNP - графики QQ
Пешрафтҳоеро, ки аз ҷониби хидматҳои de GWAS-и BMKGene тавассути маҷмӯаи нашрияҳои интихобшуда ба даст оварда шудаанд, омӯзед:
Лв, Л. ва дигарон (2023) 'Фаҳмиши асосҳои генетикии таҳаммулпазирии аммиак дар моллюскаи риштарошӣ Sinonovacula constricta тавассути омӯзиши ассотсиатсияи геномӣ',Аквакультура, 569, саҳ. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Ли, Х. ва дигарон (2022) 'Таҳлили мултиомикии 398 намунаи арзани думи рӯбоҳ минтақаҳои геномиро, ки бо хонагӣ, хусусиятҳои метаболит ва таъсири зиддиилтиҳобӣ алоқаманданд, ошкор мекунад',Растании молекулавӣ, 15(8), сах. 1367—1383. дои: 10.1016 / j.molp.2022.07.003.
Ли, Ҷ. ва дигарон (2022) 'Харитаи ассотсиатсияи геном дар саросари фенотипҳои бепушт дар муҳити хушксолӣ',Марзҳо дар илми растанӣ, 13, саҳ. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Жао, X. ва дигарон (2021) 'GmST1, ки сулфотрансферазаро рамзгузорӣ мекунад, ба штаммҳои вируси мозаикаи лӯбиёи соя G2 ва G3 муқовимат медиҳад',Растанӣ, ҳуҷайра ва муҳити зист, 44(8), саҳ. 2777–2792. дои: 10.1111 / PCE.14066.
