Пайдарпайкунии тамоми геномҳои растанӣ/ҳайвонот
1. Афзалиятҳои хидматрасонӣ
Таҷрибаи васеъ дар пайдарпаии геном барои зиёда аз 1000 намуд.
Зиёда аз 800 парвандаи интишоршуда бо омили аккумулятории импакт зиёда аз 4000.
Таҳлили ҳамаҷонибаи биоинформатика оид ба даъвати тағирот ва таҳлили функсия.
2. Мушаххасоти хадамот
| Платформа | Китобхона | Амиқии тавсияшаванда | |
| Иллюмина | PE 150 | Барои SNP, InDel занг мезанад ≥ 10x Барои SV, CNY занг задан ≥ 30x
| |
| Нанопора
| 8 кб | Барои SV, CNY занг задан ≥ 20x | |
| Пакбио | CCS | 15 кб | Барои SNP, InDel, SV, CNY занги ≥ 10x |
3. Талаботи намунавӣ
| Платформа | Conc.(ng/μL)
| Маблағ (нг)
| Покӣ
| Гели агароз
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. Тоза банд асосии бо нест ё маҳдудтаназзул дар gel мушоҳида мешавад. 2. Ифлосшавии РНК ё сафеда вуҷуд надорад ё маҳдуд аст
| ||||
| Иллюмина | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| Нанопора
| ≥30 | Аз ҳосили маълумот вобаста аст 10 мкг / ҳуҷайра | 1,7-2,2 | ≥1,5 | ||
| Пакбио | CCS | ≥50 | 1,7-2,2 | 1,8-2,5 | ||
4. Таҳлили биоинформатсионӣ
5. Ҷараёни кори хидмат
Интиқоли намуна
истихроҷи ДНК
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Интиқоли маълумот
1) Омори харитасозии геном
Ҷадвали 1 Омори натиҷаи харитасозӣ
Тасвири 1 Тақсимоти андоза ва фарогирии хондан.
2) Муайян кардани тағирот
Расми 2 Омор ва шарҳи SNP/INDEL/SV дар байни Намунаҳо
Тасвири 3 Тақсимоти геномӣ дар саросари вататсия
3) Аннотацияи функсионалии вариантҳо
| 2019 | Муоширати табиат | Тағйирёбии тамоми геном пайдоиши Brassica napus ва макони генетикиро, ки дар такмили он иштирок мекунанд, ошкор мекунад |
| 2020 | PNAS | Таърихи пайдоиши эволютсионӣ ва хонагии моҳии тиллоӣ (Carassius auratus) |
| 2021 | Маҷаллаи биотехнологияи растанӣ | Геномҳои истинод аз ду намуди ҷути парваришшуда |
| 2021 | Маҷаллаи биотехнологияи растанӣ | Имзои геномии аллополиплоидҳои растанӣ ва равғании Brassicajuncea ва локусҳои генетикӣ, ки ҷамъшавии глюкозинолатҳоро назорат мекунанд |
| 2019 | Заводи молекулавӣ | Тағйирёбии геномии маҷмӯи умумиҷаҳонии пайвастагиҳои рапс заминаи генетикии дивергенсияи экотипи онҳоро ошкор мекунад |
| 2022 | Тадқиқоти боғдорӣ | Таҳлили ассотсиатсияи геномӣ дар бораи тағирёбии табиии андозаи тухми тарбуз фаҳмиши молекулавӣ медиҳад |
| 2021 | Маҷаллаи ботаникаи таҷрибавӣ | Тадқиқоти ассотсиатсияи умуми геномӣ вариантҳои GhSAD1-ро муайян мекунад, ки таҳаммулпазирии сардро дар пахта таъмин мекунад |
| 2021 | Маҷаллаи ботаникаи таҷрибавӣ | Омӯзиши ассотсиатсияи геномӣ ва муқоисаи транскриптомҳо генҳои нави QTL ва номзадҳоро ошкор мекунанд, ки андозаи гулбаргҳоро дар рапс назорат мекунанд |
