Пайдарпаии фрагментҳои пурқувватшудаи мушаххаси маҳал (SLAF-seq)
Тафсилоти хидмат
Нақшаи техникӣ
Раванди кор
Афзалиятҳои хидматрасонӣ
Самаранокии баланди кашфи маркер- Технологияи пайдарпайии баландсуръат ба SLAF-Seq дар кашф кардани садҳо ҳазор тегҳо дар тамоми геном кӯмак мекунад.
Вобастагии паст аз геном- Он метавонад ба намудҳо бо геноми истинод ё бидуни истинод татбиқ карда шавад.
Тарҳрезии нақшаи чандир- Як-фермент, ду-фермент, ҳозима бисёр-ферментӣ ва намудҳои гуногуни ферментҳо, ҳама метавонанд барои қонеъ кардани ҳадаф ё намудҳои гуногуни тадқиқот интихоб карда шаванд.Арзёбии пешакӣ дар силико барои таъмини тарҳи оптималии фермент истифода мешавад.
Ҳазми самараноки ферментативӣ- Барои оптимизатсияи шароит пеш аз таҷриба гузаронида шуд, ки ин таҷрибаро устувор ва боэътимод мегардонад.Самаранокии ҷамъоварии фрагментҳо метавонад беш аз 95% ба даст орад.
Тегҳои SLAF ба таври баробар тақсим карда мешаванд- Тегҳои SLAF дар ҳама хромосомаҳо ба таври баробар тақсим карда мешаванд ва ба ҳисоби миёна 1 SLAF барои 4 кб мерасад.
Пешгирии самараноки такрор- пайдарпаии такрорӣ дар маълумоти SLAF-Seq то камтар аз 5% кам карда мешавад, махсусан дар намудҳое, ки сатҳи такрори баланд доранд, ба монанди гандум, ҷуворимакка ва ғайра.
Таҷрибаи васеъ- Зиёда аз 2000 лоиҳаҳои пӯшидаи SLAF-Seq оид ба садҳо намудҳо, ки растаниҳо, ширхӯрон, паррандагон, ҳашаротҳо, акваорганизмҳо ва ғайраҳоро фаро мегиранд.
Ҷараёни кории биоинформатикии худ таҳияшуда- Ҷараёни ҳамгирошудаи биоинформатикӣ барои SLAF-Seq аз ҷониби BMKGENE бо мақсади таъмини эътимоднокӣ ва дақиқии натиҷаи ниҳоӣ таҳия шудааст.
Мушаххасоти хадамот
| Платформа | Консентрат (ng/gl) | Ҳамагӣ (ug) | OD260/280 |
| Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Чилди >15μl) | 1,6-2,5 |
Стратегияи тавсияшудаи пайдарпай
умқи пайдарпай: 10X / Tag
| Андозаи геном | Тегҳои тавсияшудаи SLAF |
| < 500 Мб | 100K ё WGS |
| 500 Мб - 1 Гб | 100 К |
| 1 Гб -2 Гб | 200 К |
| Геномҳои азим ё мураккаб | 300 - 400К |
| Барномаҳо
| Тавсия дода мешавад Миқёси аҳолӣ
| Стратегияи пайдарпай ва амиқ
| |
| Амиқ
| Рақами тег
| ||
| GWAS
| Рақами намуна ≥ 200
| 10X
|
Бино бар андозаи геном
|
| Эволютсияи генетикӣ
| Шахсони ҳар як зергурӯҳ ≥ 10; намунаҳои умумӣ ≥ 30
| 10X
| |
Интиқоли намунаи тавсияшуда
Контейнер: 2 мл найчаи центрифуга
Барои аксари намунаҳо тавсия медиҳем, ки дар этанол нигоҳ дошта нашавад.
Тамғагузории намуна: Намунаҳо бояд ба таври возеҳ тамғагузорӣ карда шаванд ва ба варақаи иттилоотии намунаи пешниҳодшуда шабеҳ бошанд.
Интиқол: хушк-ях: Намунаҳои бояд аввал дар халтаҳои бастабандишуда ва дар ях хушк дафн.
Раванди кори хидмат
Намунаи QC
Таҷрибаи пилотӣ
SLAF-таҷриба
Омодасозии китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хидматҳои пас аз фурӯш
1. Омори натиҷаи харита
2. Ташаккули нишонаи SLAF
3. Шарҳи вариант
| Соли | Журнал | IF | Унвон | Барномаҳо |
| 2022 | Муоширати табиат | 17.694 | Асоси геномии гига-хромосомаҳо ва гига-геноми пиони дарахт Ostii Paeonia | SLAF-GWAS |
| 2015 | Фитологи нав | 7.433 | Изҳои хонагӣ ба минтақаҳои геномии дорои аҳамияти агрономӣ лангар мезананд лубиё | SLAF-GWAS |
| 2022 | Маҷаллаи тадқиқоти пешрафта | 12.822 | Интрогрессияҳои сунъии геномии Gossypium barbadense ба G. hirsutum барои дар як вакт баланд бар-доштани сифат ва хосилнокии нахи пахта локхои аъло ошкор кунанд хислатхо | SLAF - Генетикаи эволютсионӣ |
| 2019 | Заводи молекулавӣ | 10.81 | Таҳлили геномии аҳолӣ ва Ассамблеяи Де Ново пайдоиши алафҳои бегонаро ошкор мекунад Райс ҳамчун бозии эволютсионалӣ | SLAF - Генетикаи эволютсионӣ |
| 2019 | Генетикаи табиат | 31.616 | пайдарпаии геном ва гуногунии генетикии карп маъмул, Cyprinus carpio | Харитаи SLAF-Linkage |
| 2014 | Генетикаи табиат | 25.455 | Геном аз чормағзи парваришшуда дар бораи кариотипҳои лӯбиёгӣ, полиплоидҳо маълумот медиҳад. эволютсия ва хонагии зироат. | Харитаи SLAF-Linkage |
| 2022 | Маҷаллаи биотехнологияи растанӣ | 9.803 | Муайян кардани ST1 интихоберо, ки бо автотранспорти морфологияи тухмӣ алоқаманд аст, нишон медиҳад ва мазмуни равган дар вақти соябонӣ | Рушди SLAF-Маркер |
| 2022 | Маҷаллаи байналмилалии илмҳои молекулавӣ | 6.208 | Идентификатсия ва рушди маркери ДНК барои гандум-Леймус моллис 2Ns (2D) Ивазкунии хромосомаҳои дисомӣ | Рушди SLAF-Маркер |
