Тамоми пайдарпаии транскриптом - Illumina
Вижагиҳо
● Китобхонаи дугона барои пайдарпайии пурраи транскриптом: тамомшавии rRNA пас аз омодасозии китобхонаи PE150 ва интихоби андоза ва пас аз омодасозии китобхонаи SE50
● Таҳлили пурраи биоинформатикаи mRNA, lncRNA, circRNA ва miRNA дар гузоришҳои алоҳидаи биоинформатика
● Таҳлили муштараки ҳама ифодаи РНК дар гузориши якҷоя, аз ҷумла таҳлили шабакаҳои ceRNA.
Афзалиятҳои хидматрасонӣ
●Таҳлили амиқи шабакаҳои танзимкунанда: Таҳлили шабакаи ceRNA тавассути пайдарпайии муштараки mRNA, lncRNA, circRNA ва miRNA ва тавассути ҷараёни мукаммали биоинформатикӣ имконпазир аст.
●Тавсифи ҳамаҷониба: мо барои ба таври функсионалӣ шарҳ додани генҳои дифференсиалии ифодашуда (DEGs) аз пойгоҳи додаҳои сершумор истифода мебарем ва таҳлили ғанисозии мувофиқро анҷом дода, дар бораи равандҳои ҳуҷайравӣ ва молекулавӣ, ки дар асоси аксуламали транскриптомӣ ҷойгиранд, маълумот медиҳем.
●Экспертизаи васеъ: бо таҷрибаи бомуваффақият бастани беш аз 2000 лоиҳаи транскриптомӣ дар соҳаи гуногуни тадқиқот, дастаи мо ба ҳар як лоиҳа таҷрибаи бой меорад.
●Назорати қатъии сифат: мо нуқтаҳои асосии назоратиро дар тамоми марҳилаҳо, аз омодасозии намуна ва китобхона то пайдарпайӣ ва биоинформатика татбиқ мекунем.Ин мониторинги дақиқ таъмин намудани натиҷаҳои пайвастаи баландсифатро таъмин мекунад.
● Шарҳи ҳамаҷониба: мо барои ба таври функсионалӣ шарҳ додани генҳои дифференсиалии ифодашуда (DEGs) аз пойгоҳи додаҳои сершумор истифода мебарем ва таҳлили ғанисозии мувофиқро анҷом дода, дар бораи равандҳои ҳуҷайравӣ ва молекулавӣ, ки дар асоси аксуламали транскриптомӣ ҷойгиранд, маълумот медиҳем.
●Дастгирии пас аз фурӯш: Уҳдадории мо пас аз анҷоми лоиҳа бо мӯҳлати хидматрасонии 3-моҳаи пас аз фурӯш фаротар аст.Дар ин муддат, мо пайгирии лоиҳа, кӯмак дар ҳалли мушкилот ва ҷаласаҳои саволу ҷавобро барои ҳалли ҳама гуна дархостҳои марбут ба натиҷаҳо пешниҳод мекунем.
Талаботи намунавӣ ва интиқол
| Китобхона | Стратегияи пайдарпай | Маълумот тавсия дода мешавад | Назорати сифат |
| rRNA тамом шуд | Illumina PE150 | 16 ГБ | Q30≥85% |
| Андозаи интихобшуда | Illumina SE50 | 10-20 миллион хонда мешавад |
Талаботи намунавӣ:
Нуклеотидҳо:
| Консентрат (нг/мкл) | Миқдор (мкг) | Покӣ | Беайбият |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Маҳдуд ё тамоман ифлосшавии протеин ё ДНК дар гел нишон дода шудааст. | Растаниҳо: RIN≥6,5 Ҳайвонот: RIN≥7,0 5,0≥28S/18S≥1,0; маҳдуд ё набудани баландии ибтидоӣ |
Интиқоли намунаи тавсияшуда
Контейнер:
2 мл найчаи центрифуга (фолгаи тунука тавсия дода намешавад)
Тамғагузории намуна: Гурӯҳ+такрор, масалан, A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Интиқол:
1.Ях хушк: Намунаҳо бояд дар халтаҳо печонида шаванд ва дар яхи хушк дафн карда шаванд.
2.Тӯбҳои RNAstable: Намунаҳои RNA-ро дар найчаи устуворсозии РНК (масалан, RNAstable®) хушк кардан мумкин аст ва дар ҳарорати хона интиқол дода мешавад.
Раванди кори хидмат
Тарҳрезии таҷриба
Интиқоли намуна
истихроҷи РНК
Сохтмони китобхона
пайдарпай
Таҳлили маълумот
Хизматрасонии пас аз фурӯш
Биоинформатика
Баррасии ифодаи РНК
Генҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашуда
таҳлили ceRNA
miRNAs ва РНК-ҳои ба таври гуногун ифодашуда
Пешрафтҳои тадқиқотеро, ки тавассути тамоми хидматҳои пайдарпайии транскриптомҳои BMKGene 'тавассути маҷмӯаи нашрияҳо мусоидат мекунад, омӯзед.
Дай, Ю ва дигарон.(2022) 'Профилҳои ифодаи ҳамаҷонибаи mRNAs, lncRNAs ва miRNAs дар бемории Кашин-Бек, ки аз ҷониби РНК-секвенсия муайян карда шудаанд', Omics Molecular, 18(2), саҳ. 154–166.дои: 10.1039 / D1MO00370D.
Лю, N. нан ва дигарон.(2022) 'Таҳлили пурраи транскриптомҳои муқовимат ба сардии Apis cerana дар кӯҳи Чангбай дар давраи зимистонгузаронӣ.', Ген, 830, саҳ. 146503–146503.дои: 10.1016 / J.GENE.2022.146503.
Ванг, XJ ва дигарон.(2022) 'Авлавиятдиҳии бар асоси интегратсияи бисёрҷонибаи РНК-и рақобаткунанда дар саратони шушҳои хурд: Хусусиятҳои молекулавӣ ва номзадҳои маводи мухаддир', Сарҳадҳо дар онкология, 12, саҳ.904865. дои: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Сю, П.(2022) 'Таҳлили ҳамгирошудаи профилҳои ифодаи lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA фаҳмиши навро дар бораи механизмҳои эҳтимолӣ дар посух ба нематодҳои реша дар арахис ошкор мекунад', BMC Genomics, 23(1), саҳ. 1-12.дои: 10.1186 / S12864-022-08470-3 / РАҚАМҲО / 7.
Ян, З.(2022) 'Секвенсияи пурраи транскриптомии РНК механизмҳои молекулавиро, ки бо нигоҳ доштани сифати пас аз ҳосил дар брокколи бо шуоъдиҳии LED сурх алоқаманданд, таъкид мекунад', Биология ва технологияи пас аз ҳосил, 188, саҳ.111878. дои: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
