-
PacBio-Transcriptome แบบเต็มความยาว (ไม่อ้างอิง)
แพลตฟอร์ม Amplicon (16S/18S/ITS) ได้รับการพัฒนาด้วยประสบการณ์หลายปีในการวิเคราะห์โครงการความหลากหลายของจุลินทรีย์ ซึ่งประกอบด้วยการวิเคราะห์พื้นฐานที่เป็นมาตรฐานและการวิเคราะห์เฉพาะบุคคล: การวิเคราะห์พื้นฐานครอบคลุมเนื้อหาการวิเคราะห์กระแสหลักของการวิจัยจุลินทรีย์ในปัจจุบัน เนื้อหาการวิเคราะห์มีความสมบูรณ์และครอบคลุม และผลการวิเคราะห์นำเสนอในรูปแบบรายงานโครงการเนื้อหาของการวิเคราะห์ส่วนบุคคลมีความหลากหลายสามารถเลือกตัวอย่างและตั้งค่าพารามิเตอร์ได้อย่างยืดหยุ่นตามรายงานการวิเคราะห์พื้นฐานและวัตถุประสงค์การวิจัย เพื่อให้เป็นไปตามข้อกำหนดส่วนบุคคลระบบปฏิบัติการ Windows ที่ง่ายและรวดเร็ว
-
PacBio-Transcriptome แบบเต็มความยาว (ไม่อ้างอิง)
การใช้ข้อมูลการจัดลำดับ Isoform ของ Pacific Biosciences (PacBio) เป็นอินพุต แอปนี้สามารถระบุลำดับการถอดเสียงแบบเต็มความยาวได้ (โดยไม่ต้องประกอบ)โดยการทำแผนที่ลำดับความยาวเต็มกับจีโนมอ้างอิง การถอดเสียงสามารถเพิ่มประสิทธิภาพได้ด้วยยีนที่รู้จัก การถอดเสียง บริเวณการเข้ารหัส ฯลฯ ในกรณีนี้ การระบุโครงสร้าง mRNA ที่แม่นยำยิ่งขึ้น เช่น การต่อประกบทางเลือก ฯลฯ สามารถทำได้การวิเคราะห์ร่วมกับข้อมูลการจัดลำดับการถอดรหัส NGS ช่วยให้สามารถใส่หมายเหตุประกอบที่ครอบคลุมมากขึ้นและให้ปริมาณที่แม่นยำยิ่งขึ้นในนิพจน์ที่ระดับการถอดเสียง ซึ่งเป็นประโยชน์อย่างมากต่อการแสดงออกเชิงอนุพันธ์ปลายน้ำและการวิเคราะห์เชิงฟังก์ชัน
-
ชุดเครื่องมือ
BMKCloud เป็นแพลตฟอร์มข้อมูลชีวภาพชั้นนำที่ให้บริการโซลูชั่นแบบครบวงจรสำหรับโปรแกรมจีโนม ซึ่งได้รับความไว้วางใจอย่างกว้างขวางจากนักวิจัยในด้านต่างๆ รวมถึงการแพทย์ การเกษตร สิ่งแวดล้อม ฯลฯ BMKCloud มุ่งมั่นที่จะให้บริการแบบบูรณาการ เชื่อถือได้ และมีประสิทธิภาพ รวมถึงแพลตฟอร์มและเครื่องมือวิเคราะห์ข้อมูลชีวสารสนเทศ , ทรัพยากรการคำนวณ, ฐานข้อมูลสาธารณะ, หลักสูตรออนไลน์ด้านชีวสารสนเทศ ฯลฯ BMKCloud มีเครื่องมือชีวสารสนเทศที่ใช้บ่อยต่างๆ ซึ่งรวมถึงคำอธิบายประกอบของยีน, เครื่องมือทางพันธุกรรมวิวัฒนาการ, ncRNA, การควบคุมคุณภาพข้อมูล, การประกอบ, การจัดตำแหน่ง, การดึงข้อมูล, การกลายพันธุ์, สถิติ, เครื่องกำเนิดตัวเลข, ลำดับ การวิเคราะห์ ฯลฯ
-
RNA ขนาดเล็ก
RNA ขนาดเล็กเป็นประเภทของ RNA ที่ไม่มีการเข้ารหัสแบบสั้น โดยมีความยาวเฉลี่ย 18-30 nt รวมถึง miRNA, siRNA และ piRNARNA ขนาดเล็กเหล่านี้ได้รับรายงานอย่างหนาแน่นว่ามีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการทางชีววิทยาต่างๆ เช่น การเสื่อมสภาพของ mRNA การยับยั้งการแปล การสร้างเฮเทอโรโครมาติน เป็นต้น การวิเคราะห์หาลำดับเบสของ SmallRNA ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการศึกษาเกี่ยวกับการพัฒนาสัตว์/พืช โรค ไวรัส ฯลฯ แพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับประกอบด้วยการวิเคราะห์มาตรฐานและการทำเหมืองข้อมูลขั้นสูงบนพื้นฐานของข้อมูล RNA-seq การวิเคราะห์มาตรฐานสามารถบรรลุการระบุและการทำนาย miRNA การทำนายยีนเป้าหมาย miRNA การวิเคราะห์คำอธิบายประกอบและการแสดงออกการวิเคราะห์ขั้นสูงช่วยให้สามารถค้นหาและแยกข้อมูล miRNA ที่กำหนดเอง การสร้างแผนภาพเวนน์ miRNA และการสร้างเครือข่ายยีนเป้าหมาย
-
NGS-WGS (อิลลูมินา/BGI)
NGS-WGS เป็นแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับจีโนมใหม่ทั้งหมด ซึ่งพัฒนาขึ้นจากประสบการณ์อันยาวนานในเทคโนโลยีไบโอมาร์คเกอร์แพลตฟอร์มที่ใช้งานง่ายนี้ช่วยให้ส่งเวิร์กโฟลว์การวิเคราะห์แบบบูรณาการได้อย่างรวดเร็วโดยเพียงแค่ตั้งค่าพารามิเตอร์พื้นฐานสองสามตัว ซึ่งเหมาะกับข้อมูลการจัดลำดับ DNA ที่สร้างขึ้นจากทั้งแพลตฟอร์ม Illumina และแพลตฟอร์มการจัดลำดับ BGIแพลตฟอร์มนี้ใช้งานบนเซิร์ฟเวอร์การประมวลผลประสิทธิภาพสูง ซึ่งช่วยให้การวิเคราะห์ข้อมูลมีประสิทธิภาพสูงในเวลาจำกัดการทำเหมืองข้อมูลในแบบของคุณนั้นมีอยู่บนฐานของการวิเคราะห์มาตรฐาน รวมถึงการสืบค้นยีนที่กลายพันธุ์ การออกแบบไพรเมอร์ PCR เป็นต้น
-
mRNA(อ้างอิง)
Transcriptome คือความเชื่อมโยงระหว่างข้อมูลทางพันธุกรรมของจีโนมและโปรตีโอมของการทำงานทางชีววิทยาการควบคุมระดับการถอดเสียงเป็นโหมดการควบคุมสิ่งมีชีวิตที่สำคัญที่สุดและมีการศึกษาอย่างกว้างขวางที่สุดการหาลำดับทรานสคริปโทมสามารถจัดลำดับทรานสคริปโทมได้ทุกเวลาหรือภายใต้สภาวะใดๆ โดยมีความละเอียดแม่นยำถึงนิวคลีโอไทด์ตัวเดียว มันสามารถสะท้อนระดับของการถอดรหัสยีนแบบไดนามิก ระบุและวัดปริมาณการถอดเสียงที่หายากและปกติพร้อมๆ กัน และให้ข้อมูลโครงสร้างของ ตัวอย่างใบรับรองผลการเรียนเฉพาะ
ในปัจจุบัน เทคโนโลยีการจัดลำดับทรานสคริปโตมมีการใช้กันอย่างแพร่หลายในด้านพืชไร่ ยา และการวิจัยอื่น ๆ รวมถึงกฎระเบียบการพัฒนาสัตว์และพืช การปรับตัวด้านสิ่งแวดล้อม ปฏิสัมพันธ์ของภูมิคุ้มกัน การแปลยีน วิวัฒนาการทางพันธุกรรมของสปีชีส์ และเนื้องอก และการตรวจหาโรคทางพันธุกรรม
-
เมตาจีโนมิกส์ (NGS)
แพลตฟอร์มการวิเคราะห์นี้ออกแบบมาสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลเมตาเจโนมิกของปืนลูกซองจากประสบการณ์หลายปีประกอบด้วยเวิร์กโฟลว์แบบบูรณาการที่มีการวิเคราะห์เมตาเจโนมิกส์ที่จำเป็นโดยทั่วไป ซึ่งรวมถึงการประมวลผลข้อมูล การศึกษาระดับสปีชีส์ การศึกษาระดับฟังก์ชันของยีน การรวมเมทาจีโนม ฯลฯ นอกจากนี้ เครื่องมือขุดข้อมูลแบบกำหนดเองยังพร้อมใช้งานตามเวิร์กโฟลว์การวิเคราะห์มาตรฐาน รวมถึงการสืบค้นยีนและสปีชีส์ , การตั้งค่าพารามิเตอร์, การสร้างตัวเลขส่วนบุคคล ฯลฯ
-
LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) เป็นชนิดของการถอดรหัสที่มีความยาวมากกว่า 200 nt ซึ่งไม่สามารถเข้ารหัสโปรตีนได้หลักฐานสะสมแสดงให้เห็นว่า lncRNA ส่วนใหญ่มีแนวโน้มที่จะทำงานได้มากเทคโนโลยีการจัดลำดับปริมาณงานสูงและเครื่องมือวิเคราะห์ชีวสารสนเทศช่วยให้เราเปิดเผยลำดับ lncRNA และข้อมูลการจัดตำแหน่งได้อย่างมีประสิทธิภาพมากขึ้น และนำเราไปสู่การค้นพบ lncRNAs ด้วยฟังก์ชันการกำกับดูแลที่สำคัญBMKCloud ภูมิใจนำเสนอแพลตฟอร์มการวิเคราะห์ลำดับ lncRNA แก่ลูกค้า เพื่อให้ได้รับการวิเคราะห์ lncRNA ที่รวดเร็ว เชื่อถือได้ และยืดหยุ่น
-
GWAS
การศึกษาการเชื่อมโยงทั่วทั้งจีโนม (GWAS) มีวัตถุประสงค์เพื่อระบุตัวแปรทางพันธุกรรม (จีโนไทป์) ที่เกี่ยวข้องกับลักษณะเฉพาะ (ฟีโนไทป์)การศึกษาของ GWA จะตรวจสอบเครื่องหมายทางพันธุกรรมข้ามจีโนมทั้งหมดของบุคคลจำนวนมาก และคาดการณ์ความสัมพันธ์ของจีโนไทป์-ฟีโนไทป์โดยการวิเคราะห์ทางสถิติที่ระดับประชากรการหาลำดับจีโนมทั้งหมดอาจค้นพบตัวแปรทางพันธุกรรมทั้งหมดเมื่อรวมกับข้อมูลฟีโนไทป์แล้ว GWAS สามารถประมวลผลเพื่อระบุ SNP, QTLs และยีนที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์ที่เกี่ยวข้องกับฟีโนไทป์ ซึ่งสนับสนุนการเพาะพันธุ์สัตว์/พืชสมัยใหม่อย่างมากSLAF เป็นกลยุทธ์การจัดลำดับจีโนมแบบง่ายที่พัฒนาขึ้นเอง โดยจะค้นพบ SNP เครื่องหมายแบบกระจายทั่วทั้งจีโนมSNPs เหล่านี้เป็นตัวบ่งชี้ทางพันธุศาสตร์ระดับโมเลกุล สามารถประมวลผลสำหรับการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่เป็นเป้าหมายเป็นกลยุทธ์ที่คุ้มค่าในการระบุลักษณะที่ซับซ้อนที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม
-
Nanopore การถอดเสียงแบบเต็มความยาว
ไอโซฟอร์มทางเลือกที่ซับซ้อนและแปรผันในสิ่งมีชีวิตเป็นกลไกทางพันธุกรรมที่สำคัญสำหรับควบคุมการแสดงออกของยีนและความหลากหลายของโปรตีนการระบุโครงสร้างการถอดเสียงที่แม่นยำเป็นพื้นฐานสำหรับการศึกษารูปแบบการควบคุมการแสดงออกของยีนในเชิงลึกแพลตฟอร์มการจัดลำดับ Nanopore ประสบความสำเร็จในการนำการศึกษาแพลตฟอร์มการวิเคราะห์นี้ออกแบบมาเพื่อวิเคราะห์ข้อมูล RNA-Seq ที่สร้างบนแพลตฟอร์ม Nanopore บนฐานของจีโนมอ้างอิง ซึ่งบรรลุการวิเคราะห์เชิงคุณภาพและเชิงปริมาณทั้งในระดับยีนและระดับทรานสคริปต์
