ลำดับ circRNA-อิลลูมินา
คุณสมบัติ
● การสูญเสีย rRNA ตามมาด้วยการเตรียมไลบรารีทิศทาง ทำให้สามารถจัดลำดับข้อมูลที่เป็นเส้นเฉพาะได้
● ขั้นตอนการทำงานทางชีวสารสนเทศช่วยให้สามารถทำนาย circRNA และวัดปริมาณการแสดงออกได้
ข้อดีของการบริการ
●ไลบรารี RNA ที่ครอบคลุมมากขึ้น:เราใช้การสูญเสีย rRNA แทนการสูญเสีย RNA เชิงเส้นในการจัดเตรียมก่อนห้องสมุดของเรา เพื่อให้มั่นใจว่าข้อมูลลำดับไม่เพียงแต่รวมถึง circRNA เท่านั้น แต่ยังรวมถึง mRNA และ lncRNA ด้วย ทำให้สามารถวิเคราะห์ร่วมกันบนชุดข้อมูลเหล่านี้ได้
●การวิเคราะห์ทางเลือกของเครือข่าย RNA ภายนอก (ceRNA) ที่แข่งขันได้: ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกการกำกับดูแลโทรศัพท์มือถือ
●ความเชี่ยวชาญที่กว้างขวาง: ด้วยประวัติการประมวลผลตัวอย่างมากกว่า 20,000 ตัวอย่างที่ BMK ครอบคลุมประเภทตัวอย่างที่หลากหลายและโครงการ lncRNA ทีมงานของเรานำประสบการณ์มากมายมาสู่ทุกโครงการ
●การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด: เราใช้จุดควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่างและห้องสมุด ไปจนถึงการจัดลำดับและชีวสารสนเทศศาสตร์การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันนี้ช่วยให้มั่นใจได้ถึงผลลัพธ์คุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
● การสนับสนุนหลังการขาย: ความมุ่งมั่นของเราขยายไปไกลกว่าการเสร็จสิ้นโครงการด้วยระยะเวลาบริการหลังการขาย 3 เดือนในช่วงเวลานี้ เราเสนอการติดตามผลโครงการ ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใดๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ข้อกำหนดตัวอย่างและการจัดส่ง
| ห้องสมุด | แพลตฟอร์ม | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพข้อมูล |
| โพลีเอ อุดมด้วย | อิลลูมิน่า พีอี150 | 16-20GB | Q30≥85% |
ข้อกำหนดตัวอย่าง:
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น(ng/μl) | ปริมาณ (ไมโครกรัม) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 โอดี260/230=0.5-2.5 มีการปนเปื้อนของโปรตีนหรือ DNA อย่างจำกัดหรือไม่มีเลยบนเจล | สำหรับพืช: RIN≥6.5; สำหรับสัตว์: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานที่จำกัดหรือไม่มีเลย |
● พืช:
ราก ลำต้น หรือกลีบดอก : 450 มก
ใบหรือเมล็ด : 300 มก
ผลไม้ : 1.2 ก
● สัตว์:
หัวใจหรือลำไส้ : 450 มก
อวัยวะภายในหรือสมอง : 240 มก
กล้ามเนื้อ : 600 มก
กระดูก ผม หรือผิวหนัง: 1.5g
● สัตว์ขาปล้อง:
แมลง: 9g
สัตว์น้ำที่มีเปลือกแข็ง : 450 มก
● เลือดครบส่วน:2หลอด
● เซลล์: 106 เซลล์
● เซรั่มและพลาสมา: 6 มล
การจัดส่งตัวอย่างที่แนะนำ
ภาชนะบรรจุ: หลอดหมุนเหวี่ยงขนาด 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้ฟอยล์ดีบุก)
การติดฉลากตัวอย่าง: กลุ่ม+ทำซ้ำ เช่น A1, A2, A3;บี1 บี2 บี3......
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างจะต้องบรรจุในถุงและฝังในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอด RNAstable: ตัวอย่าง RNA สามารถทำให้แห้งในหลอดรักษาเสถียรภาพ RNA (เช่น RNAstable®) และจัดส่งในอุณหภูมิห้อง
ขั้นตอนการทำงานบริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัดอาร์เอ็นเอ
การก่อสร้างห้องสมุด
การเรียงลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศศาสตร์
การทำนาย circRNA: การกระจายโครโมโซม
circRNAs ที่แสดงออกมาแตกต่างกัน – โครงเรื่องของภูเขาไฟ
circRNA ที่แสดงออกมาต่างกัน - การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น
การเพิ่มประสิทธิภาพการทำงานของยีนโฮสต์ของ circRNA
สำรวจความก้าวหน้าด้านการวิจัยที่อำนวยความสะดวกโดยบริการจัดลำดับ circRNA ของ BMKGene ผ่านคอลเลคชันสิ่งพิมพ์ที่ได้รับการดูแลจัดการ
วัง X. และคณะ(2021) 'CPSF4 ควบคุมการสร้าง circRNA และการปิดเสียงของยีนที่เป็นสื่อกลาง microRNA ในมะเร็งเซลล์ตับ', Oncogene 2021 40:25, 40(25), หน้า 4338–4351ดอย: 10.1038/s41388-021-01867-6.
เซี่ย เค และคณะ(2023) 'X oo-responsive transcriptome เผยบทบาทของ RNA133 แบบวงกลมในการต้านทานโรคโดยควบคุมการแสดงออกของ OsARAB ในข้าว', Phytopathology Research, 5(1), หน้า 1–14ดอย: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. และคณะ(2023) 'CPSF3 ปรับสมดุลของการถอดเสียงแบบวงกลมและเชิงเส้นในมะเร็งเซลล์ตับ'ดอย: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
จาง วาย และคณะ(2023) 'การประเมินที่ครอบคลุมของ circRNAs ในคาร์ดิโอไมโอแพทีของโรคตับแข็งก่อนและหลังการปลูกถ่ายตับ', International Immunopharmacology, 114, p.109495. ดอย: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
