BMKCloud Log in
条形banner-03

สินค้า

การหาลำดับ DNA/RNA – ลำดับนาโนพอร์

การจัดลำดับ ONT เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับสัญญาณไฟฟ้าแบบเรียลไทม์โมเลกุลเดี่ยวที่ใช้นาโนพอร์ หลักการเรียงลำดับของแต่ละแพลตฟอร์มจะเหมือนกันDNA/RNA แบบเกลียวคู่จะจับกับโปรตีนที่มีรูพรุนระดับนาโนที่ฝังอยู่ในแผ่นชีวะและคลี่คลายภายใต้ตะกั่วของโปรตีนมอเตอร์ ภายใต้การกระทำของแรงดันไฟฟ้าที่แตกต่างกันจากทั้งสองด้านของแผ่นชีวะ เส้น DNA/RNA จะผ่านโปรตีนช่องนาโนพอร์ในระดับหนึ่ง ประเมิน.เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีของเบสต่างๆ บนสาย DNA/RNA นั้นแตกต่างกัน เมื่อเบสหรือโมเลกุล DNA เดี่ยวผ่านช่องนาโนพอร์ จะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของสัญญาณไฟฟ้าต่างๆด้วยการตรวจจับและสอดคล้องกับสัญญาณเหล่านี้ จึงสามารถคำนวณประเภทฐานที่สอดคล้องกันได้ และการตรวจจับลำดับแบบเรียลไทม์ก็เสร็จสมบูรณ์ได้


รายละเอียดบริการ

ผลการสาธิต

คุณสมบัติรายละเอียดการบริการ

แพลตฟอร์ม

ขนาดห้องสมุด

ผลผลิตข้อมูลทางทฤษฎี (ต่อเซลล์)

ความแม่นยำแบบฐานเดียว

การใช้งาน

นาโนพอร์

8Kb, 10kb, 20kb, ยาวพิเศษ, cDNA-PCR

70-90Gb/เซลล์

85-92%

การโทร SV, เดอโนโว, การหาลำดับแบบเต็มความยาว, Iso-Seq, คำอธิบายประกอบของยีน, การตรวจหา DNA methylation

ข้อดีของการบริการ

● ประสบการณ์มากกว่า 5 ปีบนแพลตฟอร์มการจัดลำดับ PacBio กับโปรเจ็กต์ที่ปิดไปแล้วหลายพันโปรเจ็กต์ในสายพันธุ์ต่างๆ
● BMKGENE เป็นพันธมิตรอย่างเป็นทางการของ Oxford Nanopore พร้อมการรับรอง RNA/DNA แพลตฟอร์มคู่
● มีโมเดลทั่วไปของซีเควนเซอร์ที่มีอุปกรณ์ครบครันและมีปริมาณงานในการหาลำดับที่เพียงพอ
● จากแพลตฟอร์ม Nanopore งานวิจัยของ Denovo เกี่ยวกับสัตว์และพืชมากกว่า 10 ชิ้นได้รับการตีพิมพ์ในวารสารที่มีชื่อเสียงระดับนานาชาติ

ข้อกำหนดตัวอย่าง


ประเภทตัวอย่าง

จำนวน

ความเข้มข้น(Qubit ®)

ปริมาณ

ความบริสุทธิ์

คนอื่น

จีโนมดีเอ็นเอ

ขึ้นอยู่กับความต้องการข้อมูล

 ≥20ng/ไมโครลิตร

≥15ไมโครลิตร

โอดี260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

ชัดเจนสูงสุดที่ 260 นาโนเมตร ไม่มีการปนเปื้อน

ความเข้มข้นต้องวัดด้วย Qubit และ Qubit/Nanopore ≤ 2

อาร์เอ็นเอทั้งหมด

≥1.2ไมโครกรัม

≥100ไมโครกรัม/ไมโครลิตร

≥15ไมโครลิตร

โอดี260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5 ไม่มีการปนเปื้อน

ค่าริน ≥7.5

 

ขั้นตอนการบริการ

การจัดเตรียมตัวอย่าง

การจัดเตรียมตัวอย่าง

การเตรียมห้องสมุด

การก่อสร้างห้องสมุด

การเรียงลำดับ

การเรียงลำดับ

การวิเคราะห์ข้อมูล

การวิเคราะห์ข้อมูล

ตัวอย่างการควบคุมคุณภาพ

การส่งมอบโครงการ


  • ก่อนหน้า:
  • ต่อไป:

  • การประเมินคุณภาพข้อมูลของตัวอย่าง DNA

    ตารางที่ 1. สถิติเกี่ยวกับข้อมูลที่สะอาด

    บีเอ็มคิด

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    สะอาดN50เลน

    ทำความสะอาด N90Len

    cleanMeanLen

    คลีนแม็กซ์เลน

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    การประเมินคุณภาพข้อมูลของตัวอย่าง RNA

    ตารางที่ 1. สถิติเกี่ยวกับข้อมูลที่สะอาด

    ชื่อไฟล์

    รหัสลูกค้า

    อ่านหมายเลข

    หมายเลขฐาน

    N50

    ความยาวเฉลี่ย

    MaxLength

    มีนคิวสกอร์

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    คำถามที่ 12

    รูปที่ 1 การกระจายความยาวการอ่าน

    A3

    รูปที่ 2 การกระจายคะแนนคุณภาพของข้อมูลที่สะอาด

    A4

    รูปที่ 3 การกระจายคะแนนความยาวและคุณภาพของข้อมูลที่สะอาด

    A5

    ได้รับใบเสนอราคา

    เขียนข้อความของคุณที่นี่แล้วส่งมาให้เรา

    ส่งข้อความของคุณถึงเรา: