สินค้า

การจัดลำดับดีเอ็นเอ/อาร์เอ็นเอ – เครื่องจัดลำดับนาโนพอเร

การจัดลำดับดีเอ็นเอ/อาร์เอ็นเอ – ภาพประกอบหลัก: เครื่องจัดลำดับนาโนพอเร

เทคโนโลยีการจัดลำดับดีเอ็นเอแบบ ONT เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับสัญญาณไฟฟ้าแบบเรียลไทม์ระดับโมเลกุลเดี่ยวโดยอาศัยรูพรุนระดับนาโน หลักการจัดลำดับของแต่ละแพลตฟอร์มนั้นเหมือนกัน ดีเอ็นเอ/อาร์เอ็นเอแบบสองสายจะจับกับโปรตีนรูพรุนระดับนาโนที่ฝังอยู่ในไบโอฟิล์มและคลายตัวภายใต้การนำของโปรตีนมอเตอร์ ภายใต้การทำงานของความต่างศักย์ไฟฟ้าจากทั้งสองด้านของไบโอฟิล์ม สายดีเอ็นเอ/อาร์เอ็นเอจะผ่านช่องโปรตีนรูพรุนระดับนาโนในอัตราที่กำหนด เนื่องจากความแตกต่างของคุณสมบัติทางเคมีของเบสต่างๆ บนสายดีเอ็นเอ/อาร์เอ็นเอ เมื่อเบสเดี่ยวหรือโมเลกุลดีเอ็นเอผ่านช่องรูพรุนระดับนาโน จะทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของสัญญาณไฟฟ้าที่แตกต่างกัน โดยการตรวจจับและจับคู่สัญญาณเหล่านี้ สามารถคำนวณชนิดของเบสที่สอดคล้องกันได้ และสามารถตรวจจับลำดับแบบเรียลไทม์ได้สำเร็จ

ติดต่อเรา

รายละเอียดบริการ

ผลลัพธ์การสาธิต

รายละเอียดบริการ คุณสมบัติ

แพลตฟอร์ม	ขนาดห้องสมุด	ผลผลิตข้อมูลเชิงทฤษฎี (ต่อเซลล์)	ความแม่นยำฐานเดี่ยว	แอปพลิเคชัน
นาโนพอเร	8kb, 10kb, 20kb, ยาวพิเศษ, cDNA-PCR	70-90Gb/เซลล์	85-92%	การเรียก SV, ดีโนโว, การจัดลำดับแบบเต็มความยาว, ไอโซเซค, การระบุตำแหน่งยีน, การตรวจจับเมทิลเลชั่นของดีเอ็นเอ

ข้อดีของการบริการ

● มีประสบการณ์มากกว่า 5 ปีในการใช้แพลตฟอร์มการจัดลำดับดีเอ็นเอ PacBio โดยมีโครงการที่เสร็จสมบูรณ์แล้วหลายพันโครงการกับสิ่งมีชีวิตหลากหลายชนิด
● BMKGENE เป็นพันธมิตรอย่างเป็นทางการของ Oxford Nanopore โดยได้รับการรับรองแพลตฟอร์มคู่ RNA/DNA
● มีเครื่องซีเควนเซอร์รุ่นหลักๆ ที่มาพร้อมอุปกรณ์ครบครันและมีกำลังการประมวลผลซีเควนเซอร์ที่เพียงพอ
● จากแพลตฟอร์ม Nanopore งานวิจัย Denovo เกี่ยวกับสัตว์และพืชมากกว่า 10 ชิ้นได้รับการตีพิมพ์ในวารสารระดับนานาชาติที่มีชื่อเสียง

ตัวอย่างข้อกำหนด

ประเภทตัวอย่าง

จำนวน

ความเข้มข้น (Qubit ®)

ปริมาณ

ความบริสุทธิ์

คนอื่น

ดีเอ็นเอจีโนม

ขึ้นอยู่กับความต้องการข้อมูล

≥20 นาโนกรัม/ไมโครลิตร

≥15 ไมโครลิตร

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

พบพีคชัดเจนที่ 260 นาโนเมตร ไม่มีสิ่งปนเปื้อน

ความเข้มข้นต้องวัดโดย Qubit และ Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA ทั้งหมด

≥1.2 ไมโครกรัม

≥100 μg/μl

≥15 ไมโครลิตร

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5; ไม่มีสิ่งปนเปื้อน

ค่า RIN ≥7.5

ขั้นตอนการทำงานของบริการ

การเตรียมตัวอย่าง

การก่อสร้างห้องสมุด

การจัดลำดับ

การวิเคราะห์ข้อมูล

การส่งมอบโครงการ

ก่อนหน้า: ไลบรารีสำเร็จรูปของ Illumina

ต่อไป: การจัดลำดับชิ้นส่วนที่ขยายสัญญาณเฉพาะตำแหน่ง (SLAF-Seq)

การประเมินคุณภาพข้อมูลของตัวอย่างดีเอ็นเอ

ตารางที่ 1 สถิติเกี่ยวกับข้อมูลที่ผ่านการประมวลผลแล้ว

บีเอ็มคิด	หมายเลขลำดับดิบ	ฐานข้อมูลผลรวมดิบ	หมายเลขลำดับสะอาด	ฐานข้อมูลผลรวมสะอาด	คลีนเอ็น50เลน	cleanN90Len	คลีนมีนเลน	คลีนแม็กซ์เลน	คลีนมีนคุณภาพ
ดีเอ็นเอ_บีเอ็มเค01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9

การประเมินคุณภาพข้อมูลของตัวอย่าง RNA

ตารางที่ 1 สถิติเกี่ยวกับข้อมูลที่ผ่านการประมวลผลแล้ว

ชื่อไฟล์	รหัสลูกค้า	อ่านหมายเลข	ฐานเลข	เอ็น50	ความยาวเฉลี่ย	ความยาวสูงสุด	คะแนนเฉลี่ย
RNA_BMK001	C2	8,947,708	4,047,230,083	398	452	129,227	ไตรมาสที่ 12