การจัดลำดับ mRNA ของยูคาริโอต (NGS)
คุณสมบัติ
● การเตรียมไลบรารี mRNA แบบกำหนดทิศทาง (ไม่บังคับ) เพื่อให้สามารถได้ข้อมูลการจัดลำดับแบบจำเพาะสาย
● การวิเคราะห์ BI ที่หลากหลายครอบคลุมทุกความต้องการของลูกค้าของเรา
ข้อดี
●ความเชี่ยวชาญที่กว้างขวางเราได้ดำเนินการวิเคราะห์ตัวอย่างมาแล้วกว่า 600,000 ตัวอย่าง ครอบคลุมตัวอย่างหลากหลายประเภท เช่น เซลล์เพาะเลี้ยง เนื้อเยื่อ และของเหลวในร่างกาย เรานำความเชี่ยวชาญมากมายมาใช้ในทุกโครงการ
●การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวดเราใช้มาตรการควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่าง การเตรียมไลบรารี การจัดลำดับดีเอ็นเอ และชีวสารสนเทศ การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันของเราช่วยให้มั่นใจได้ว่าผลลัพธ์ที่ได้มีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
●คำอธิบายประกอบที่ครอบคลุมเราใช้ฐานข้อมูลหลายแห่งเพื่อระบุหน้าที่การทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEGs) และทำการวิเคราะห์การเสริมคุณค่าที่เกี่ยวข้อง วิธีการที่ครอบคลุมนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกระบวนการระดับเซลล์และโมเลกุลที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของทรานสคริปโตม ทำให้มั่นใจได้ว่าคุณจะได้รับข้อมูลทั้งหมดที่เป็นไปได้เกี่ยวกับข้อมูลการทดลองของคุณ
●บริการหลังการขายเราเข้าใจดีว่าการอยู่เคียงข้างลูกค้ามีความสำคัญเพียงใด นั่นคือเหตุผลที่ความมุ่งมั่นของเราไม่ได้จำกัดอยู่แค่เพียงการเสร็จสิ้นโครงการ แต่ยังรวมถึงบริการหลังการขายอีก 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราจะติดตามโครงการ ให้ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และจัดช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ข้อกำหนดและวิธีการจัดส่งตัวอย่าง
| ห้องสมุด | กลยุทธ์การจัดลำดับ | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพ |
| อุดมด้วยโพลีเอ | อิลลูมินา พีอี150 ดีเอ็นบีเอสคิว-ที7 | 6-10 GB | Q30≥85% |
ตัวอย่างข้อกำหนด:
นิวคลีโอไทด์:
ข้อกำหนดขั้นต่ำสำหรับตัวอย่าง:
| ความเข้มข้น (นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณ (ไมโครกรัม) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ | |
| ห้องสมุดมาตรฐาน | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ไม่พบการปนเปื้อนของโปรตีนหรือดีเอ็นเอในเจล หรือพบเพียงเล็กน้อย | สำหรับพืช: RIN≥4.0; สำหรับสัตว์: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
| ห้องสมุดบอกทิศทาง | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ไม่พบการปนเปื้อนของโปรตีนหรือดีเอ็นเอในเจล หรือพบเพียงเล็กน้อย | สำหรับพืช: RIN≥4.0; สำหรับสัตว์: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
| พืช | สัตว์ | สัตว์ขาปล้อง | เลือดครบส่วน | เซลล์ |
| ราก ลำต้น หรือกลีบดอก: 450 มก. ใบหรือเมล็ด: 300 มก. ผลไม้: 1.2 กรัม | หัวใจหรือลำไส้: 300 มก. อวัยวะภายในหรือสมอง: 240 มก. กล้ามเนื้อ: 450 มก. กระดูก เส้นผม หรือผิวหนัง: 1 กรัม | แมลง: 6 กรัม กุ้งและปู: 300 มก. | 1 หลอด | 106 เซลล์ |
คำแนะนำในการจัดส่งตัวอย่าง
ภาชนะ: หลอดเหวี่ยงขนาด 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้ฟอยล์อลูมิเนียม)
การติดฉลากตัวอย่าง: กลุ่ม+ตัวอย่างซ้ำ เช่น A1, A2, A3; B1, B2, B3...
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างต้องบรรจุในถุงและฝังไว้ในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอดสำหรับเก็บรักษา RNA: สามารถนำตัวอย่าง RNA ไปอบแห้งในหลอดรักษาเสถียรภาพ RNA (เช่น RNAstable®) และจัดส่งที่อุณหภูมิห้องได้
ข้อกำหนดและวิธีการจัดส่งตัวอย่าง
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัด RNA
การก่อสร้างห้องสมุด
การจัดลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศ
สำหรับตัวอย่างที่มีจีโนมอ้างอิง การวิเคราะห์ BI จะเป็นดังนี้:
Øการควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบ
Øการจัดเรียงจีโนมอ้างอิง
Øการวิเคราะห์โครงสร้างการถอดรหัส
Øการหาปริมาณการแสดงออก
Øการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกัน
Øการระบุและเสริมฟังก์ชัน
สำหรับตัวอย่างที่ไม่มีจีโนมอ้างอิง ตัวเลือกที่มีให้เลือกคือ:
• การควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบ
•การประกอบโดยคำนึงถึงการปรับโครงสร้างให้เหมาะสม
•การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกัน
•การระบุและเสริมฟังก์ชัน
การจัดเรียงจีโนมอ้างอิง
ความอิ่มตัวของข้อมูล
การหาความสัมพันธ์ของตัวอย่างและการประเมินตัวอย่างซ้ำทางชีวภาพ
ยีนที่มีการแสดงออกแตกต่างกัน (DEGs)
การระบุหน้าที่ของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEGs)
การเสริมคุณค่าเชิงหน้าที่ของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน
สำรวจความก้าวหน้าต่างๆ ที่เกิดขึ้นจากบริการการจัดลำดับ mRNA ด้วยเทคโนโลยี NGS ของยูคาริโอตจาก BMKGene ผ่านชุดบทความวิจัยที่คัดสรรมาอย่างดี
Huang, L. et al. (2023) 'ไตรโคลซานและไตรโคลคาร์บานทำให้ความสามารถในการรับกลิ่นของปลาทองลดลงโดยการจำกัดการรับรู้กลิ่น ขัดขวางการส่งสัญญาณรับกลิ่น และรบกวนการประมวลผลข้อมูลรับกลิ่น'การวิจัยน้ำ, 233, หน้า 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ และคณะ (2023) 'Aspergillus fumigatus ยึดครอง p11 ของมนุษย์เพื่อเปลี่ยนเส้นทางฟาโกโซมที่มีเชื้อราไปยังเส้นทางที่ไม่ย่อยสลาย'เซลล์เจ้าบ้านและจุลินทรีย์, 31(3), หน้า 373-388.e10. ดอย: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. และคณะ (2022) 'ปัจจัยการถอดรหัส TCP ที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาหน่อของไผ่มา (Dendrocalamus latiflorus Munro)'ขอบเขตในวิทยาศาสตร์พืช, 13, หน้า 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. และคณะ (2022) 'จีโนมของ Chrysanthemum lavandulifolium และกลไกโมเลกุลที่อยู่เบื้องหลังประเภทช่อดอกที่หลากหลาย'การวิจัยด้านพืชสวน9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie และคณะ (2023) 'นาโนรีแอคเตอร์แบบเรียงลำดับเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการบำบัดด้วยคลื่นเสียงในมะเร็งลำไส้ใหญ่และทวารหนักผ่านการเสริมฤทธิ์กันของ ROS และการปิดกั้นออโตฟาจี'นาโนทูเดย์, 49, น. 101798. ดอย: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
