การจัดลำดับแบบไม่เข้ารหัสแบบยาว-Illumina
ข้อดีของการบริการ
การวิเคราะห์ร่วมของ mRNA และ lncRNA:การผสมผสานการวัดปริมาณของทรานสคริปต์ mRNA เข้ากับการศึกษา lncRNA และเป้าหมาย ทำให้สามารถรับภาพรวมเชิงลึกของกลไกการควบคุมที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของเซลล์ได้
ความเชี่ยวชาญอย่างกว้างขวาง:เราได้ประมวลผลตัวอย่างมากกว่า 230,000 ตัวอย่าง ครอบคลุมตัวอย่างที่หลากหลายและวัตถุประสงค์ของโครงการ เรานำความเชี่ยวชาญอันล้ำค่ามาสู่ทุกโครงการ
การวิเคราะห์ร่วมของ mRNA และ lncRNA:เราผสมผสานการวัดปริมาณของทรานสคริปต์ mRNA เข้ากับการศึกษา lncRNA และเป้าหมาย ทำให้สามารถรับภาพรวมเชิงลึกของกลไกการควบคุมที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของเซลล์ได้
การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด:เราใช้จุดควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่าง การเตรียมห้องสมุด การจัดลำดับเบส และชีวสารสนเทศศาสตร์ การตรวจสอบอย่างละเอียดของเราช่วยให้มั่นใจได้ว่าผลลัพธ์จะมีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
คำอธิบายประกอบที่ครอบคลุม:เราใช้ฐานข้อมูลหลายชุดเพื่ออธิบายฟังก์ชันการทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่าง (DEG) และดำเนินการวิเคราะห์การเสริมสมรรถนะที่เกี่ยวข้อง วิธีการที่ครอบคลุมนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกระบวนการระดับเซลล์และโมเลกุลที่เป็นพื้นฐานของการตอบสนองของทรานสคริปโตม เพื่อให้แน่ใจว่าคุณจะได้รับข้อมูลทั้งหมดที่เป็นไปได้เกี่ยวกับข้อมูลการทดลองของคุณ
การสนับสนุนหลังการขายเราเข้าใจดีว่าการเข้าร่วมโครงการนั้นสำคัญเพียงใด เราจึงมุ่งมั่นทุ่มเทบริการหลังการขายตลอดระยะเวลา 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เรามีบริการติดตามผลโครงการ ช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และช่วงถาม-ตอบ เพื่อตอบข้อสงสัยต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ความต้องการตัวอย่างและการจัดส่ง
| ห้องสมุด | แพลตฟอร์ม | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพข้อมูล |
| ห้องสมุดทิศทางที่หมดลงของ rRNA | อิลลูมิน่า PE150 | 10-16 กิกะไบต์ | Q30≥85% |
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น(นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณ (μg) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 มีการปนเปื้อนของโปรตีนหรือ DNA ในเจลอย่างจำกัดหรือไม่มีเลย | RIN≥6.0; 5.0≥28วินาที/18วินาที≥1.0; ระดับความสูงฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
● พืช:
ราก ลำต้น หรือกลีบดอก: 450 มก.
ใบหรือเมล็ด: 300 มก.
ผล: 1.2 กรัม
● สัตว์:
หัวใจหรือลำไส้: 450 มก.
อวัยวะภายในหรือสมอง: 240 มก.
กล้ามเนื้อ: 600 มก.
กระดูก เส้นผม หรือผิวหนัง: 1.5 กรัม
● สัตว์ขาปล้อง:
แมลง: 9 กรัม
ครัสเตเชีย: 450 มก.
● เลือดทั้งหมด:2 หลอด
● เซลล์: 106 เซลล์
● ซีรั่มและพลาสมา: 6 มล.
การจัดส่งตัวอย่างที่แนะนำ
ภาชนะ: หลอดเซนตริฟิวจ์ 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้กระดาษฟอยล์)
ตัวอย่างการติดฉลาก: กลุ่ม+การจำลอง เช่น A1, A2, A3; B1, B2, B3
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างจะต้องบรรจุลงในถุงและฝังไว้ในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอด RNAstable: ตัวอย่าง RNA สามารถทำให้แห้งในหลอด RNA stabilize (เช่น RNAstable®) และจัดส่งในอุณหภูมิห้อง
กระบวนการทำงานของบริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัด RNA
การก่อสร้างห้องสมุด
การจัดลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศศาสตร์
- ข้อมูลดิบ
- การควบคุมคุณภาพข้อมูล
- การจัดตำแหน่งจีโนม
- โครงสร้างยีน (การตัดต่อทางเลือก การเพิ่มประสิทธิภาพโครงสร้างยีน และการทำนายยีนแบบใหม่)
- การวัดปริมาณการแสดงออกของยีน
- การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกัน
- คำอธิบายประกอบและการเพิ่มความเข้มข้นของ DEG + ยีนเป้าหมาย lncRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
- การระบุตัวตนของบันทึกการถอดเสียง
- การระบุ lncRNA (การอนุรักษ์ lncRNA และ lncRNA ที่ทราบ)
- การทำนายยีนเป้าหมาย lncRNA
- การวัดปริมาณการแสดงออกของ lncRNA
- การวิเคราะห์ร่วมกับข้อมูล mRNA
การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่แตกต่างกัน (DEGs)
การวัดปริมาณการแสดงออกของ lncRNA – การจัดกลุ่ม
การเสริมประสิทธิภาพของยีนเป้าหมาย lncRNA
การวิเคราะห์ตำแหน่งร่วมของ mRNA และ lncRNA – พล็อต Circos (วงกลมตรงกลางคือ mRNA และวงกลมด้านในคือ lncRNA)
สำรวจความก้าวหน้าที่ได้รับการสนับสนุนโดยบริการการจัดลำดับ lncRNA ของ BMKGene ผ่านคอลเลกชันสิ่งพิมพ์ที่คัดสรรมาอย่างดี
Ji, H. et al. (2020) 'การระบุ การทำนายการทำงาน และการตรวจสอบ lncRNA สำคัญของ lncRNA ที่เกี่ยวข้องกับความเครียดจากความเย็นในตับหนู'รายงานทางวิทยาศาสตร์2020 10:1, 10(1), หน้า 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. และคณะ (2021) 'การวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกเชิงบูรณาการเผยให้เห็นกลไกภูมิคุ้มกันของสายพันธุ์ปลาคาร์ปทั่วไปที่ต้านทาน CyHV-3'แนวหน้าในวิทยาภูมิคุ้มกัน, 12, น. 687151. ดอย: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ และคณะ (2022) 'การจัดลำดับความสำคัญของเครือข่ายการควบคุม RNA ที่เกิดขึ้นเองซึ่งแข่งขันกันโดยอิงจากการผสานรวมมัลติโอมิกส์ในมะเร็งปอดชนิดเซลล์เล็ก: ลักษณะทางโมเลกุลและยาที่เป็นตัวเลือก'แนวหน้าด้านเนื้องอกวิทยา, 12, น. 904865. ดอย: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. และคณะ (2020) 'การผ่าตัดทางพันธุกรรมของเครือข่ายการแสดงออกร่วมกันของยีนที่อยู่เบื้องหลังการสังเคราะห์แสงใน Populus'วารสารเทคโนโลยีชีวภาพพืช, 18(4), หน้า 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
เจิ้ง, เอช. และคณะ (2022) 'เครือข่ายกำกับดูแลระดับโลกสำหรับการแสดงออกของยีนที่ผิดปกติและการส่งสัญญาณการเผาผลาญที่ผิดปกติในเซลล์ภูมิคุ้มกันในสภาพแวดล้อมจุลภาคของโรคเกรฟส์และโรคไทรอยด์อักเสบฮาชิโมโต'แนวหน้าในวิทยาภูมิคุ้มกัน, 13, น. 879824. ดอย: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
