การจัดลำดับดีเอ็นเอแบบยาวที่ไม่เข้ารหัส - อิลลูมินา
ข้อดีของการบริการ
●การวิเคราะห์ร่วมกันของ mRNA และ lncRNAการผสมผสานการวัดปริมาณ mRNA กับการศึกษา lncRNA และเป้าหมายของพวกมัน ทำให้สามารถมองเห็นภาพรวมเชิงลึกของกลไกการควบคุมที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของเซลล์ได้
●ความเชี่ยวชาญที่กว้างขวางเราได้ดำเนินการวิเคราะห์ตัวอย่างไปแล้วกว่า 230,000 ตัวอย่าง ครอบคลุมตัวอย่างและวัตถุประสงค์ของโครงการที่หลากหลาย เรานำความเชี่ยวชาญมากมายมาใช้ในทุกโครงการ
●การวิเคราะห์ร่วมกันของ mRNA และ lncRNAเราได้ผสานการวัดปริมาณ mRNA เข้ากับการศึกษา lncRNA และเป้าหมายของพวกมัน ทำให้สามารถมองเห็นภาพรวมเชิงลึกของกลไกการควบคุมที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของเซลล์ได้
●การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวดเราใช้มาตรการควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่าง การเตรียมไลบรารี การจัดลำดับดีเอ็นเอ และชีวสารสนเทศ การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันของเราช่วยให้มั่นใจได้ว่าผลลัพธ์ที่ได้มีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
●คำอธิบายประกอบที่ครอบคลุมเราใช้ฐานข้อมูลหลายแห่งเพื่อระบุหน้าที่การทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEGs) และทำการวิเคราะห์การเสริมคุณค่าที่เกี่ยวข้อง วิธีการที่ครอบคลุมนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกระบวนการระดับเซลล์และโมเลกุลที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของทรานสคริปโตม ทำให้มั่นใจได้ว่าคุณจะได้รับข้อมูลทั้งหมดที่เป็นไปได้เกี่ยวกับข้อมูลการทดลองของคุณ
●บริการหลังการขายเราเข้าใจดีว่าการอยู่เคียงข้างลูกค้ามีความสำคัญเพียงใด นั่นคือเหตุผลที่ความมุ่งมั่นของเราไม่ได้จำกัดอยู่แค่เพียงการเสร็จสิ้นโครงการ แต่ยังรวมถึงบริการหลังการขายอีก 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราจะติดตามโครงการ ให้ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และจัดช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ข้อกำหนดและวิธีการจัดส่งตัวอย่าง
| ห้องสมุด | แพลตฟอร์ม | ข้อมูลที่แนะนำ | การตรวจสอบคุณภาพข้อมูล |
| ไลบรารีทิศทางที่ขาด rRNA | อิลลูมินา พีอี150 | 10-16 กิกะไบต์ | Q30≥85% |
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น (นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณ (ไมโครกรัม) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ไม่พบการปนเปื้อนของโปรตีนหรือดีเอ็นเอในเจล หรือพบเพียงเล็กน้อย | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
● พืช:
ราก ลำต้น หรือกลีบดอก: 450 มก.
ใบหรือเมล็ด: 300 มก.
ผลไม้: 1.2 กรัม
● สัตว์:
หัวใจหรือลำไส้: 450 มก.
อวัยวะภายในหรือสมอง: 240 มก.
กล้ามเนื้อ: 600 มก.
กระดูก เส้นผม หรือผิวหนัง: 1.5 กรัม
● สัตว์ขาปล้อง:
แมลง: 9 กรัม
กุ้งและปู: 450 มก.
● เลือดครบส่วน:2 หลอด
● เซลล์: 106 เซลล์
● เซรั่มและพลาสมา: 6 มล.
คำแนะนำในการจัดส่งตัวอย่าง
ภาชนะ: หลอดเหวี่ยงขนาด 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้ฟอยล์อลูมิเนียม)
การติดฉลากตัวอย่าง: กลุ่ม + ตัวอย่างซ้ำ เช่น A1, A2, A3; B1, B2, B3
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างต้องบรรจุในถุงและฝังไว้ในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอดเก็บรักษา RNA: สามารถนำตัวอย่าง RNA ไปอบแห้งในหลอดเก็บรักษา RNA (เช่น RNAstable®) และจัดส่งที่อุณหภูมิห้องได้
ขั้นตอนการให้บริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัด RNA
การก่อสร้างห้องสมุด
การจัดลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศ
- ข้อมูลดิบ
- การตรวจสอบคุณภาพข้อมูล
- การจัดเรียงจีโนม
- โครงสร้างยีน (การตัดต่อทางเลือก การปรับโครงสร้างยีนให้เหมาะสม และการทำนายยีนใหม่)
- การหาปริมาณการแสดงออกของยีน
- การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกัน
- การระบุและเสริมคุณค่าของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน + ยีนเป้าหมายของ lncRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
- การระบุเอกสารถอดเสียง
- การระบุ lncRNA (การอนุรักษ์ lncRNA และ lncRNA ที่รู้จัก)
- การทำนายยีนเป้าหมายของ lncRNA
- การหาปริมาณการแสดงออกของ lncRNA
- การวิเคราะห์ร่วมกับข้อมูล mRNA
การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่แตกต่างกัน (DEGs)
การหาปริมาณการแสดงออกของ lncRNA – การจัดกลุ่ม
การเพิ่มความเข้มข้นของยีนเป้าหมาย lncRNA
การวิเคราะห์ตำแหน่งร่วมกันของ mRNA และ lncRNA – แผนภาพ Circos (วงกลมตรงกลางคือ mRNA และวงกลมด้านในคือ lncRNA)
สำรวจความก้าวหน้าต่างๆ ที่เกิดขึ้นจากบริการจัดลำดับ lncRNA ของ BMKGene ผ่านชุดบทความวิจัยที่คัดสรรมาอย่างดี
Ji, H. และคณะ (2020) 'การระบุ การทำนายหน้าที่ และการตรวจสอบ lncRNA ที่สำคัญที่เกี่ยวข้องกับความเครียดจากความเย็นในตับหนู'รายงานทางวิทยาศาสตร์2020 10:1, 10(1), หน้า 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. และคณะ (2021) 'การวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกแบบบูรณาการเผยให้เห็นกลไกภูมิคุ้มกันของสายพันธุ์ปลาคาร์พธรรมดาที่ต้านทาน CyHV-3'แนวหน้าในภูมิคุ้มกันวิทยา, 12, น. 687151. ดอย: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ และคณะ (2022) 'การจัดลำดับความสำคัญของเครือข่ายการควบคุม RNA ภายในเซลล์ที่แข่งขันกันในมะเร็งปอดชนิดเซลล์เล็กโดยอาศัยการบูรณาการมัลติโอมิกส์: ลักษณะทางโมเลกุลและตัวยาที่อาจเป็นไปได้'แนวหน้าในด้านมะเร็งวิทยา, 12, น. 904865. ดอย: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. และคณะ (2020) 'การวิเคราะห์ทางพันธุกรรมของเครือข่ายการแสดงออกร่วมของยีนที่เป็นพื้นฐานของการสังเคราะห์แสงใน Populus'วารสารเทคโนโลยีชีวภาพพืช, 18(4), หน้า 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. และคณะ (2022) 'เครือข่ายควบคุมระดับโลกสำหรับการแสดงออกของยีนที่ผิดปกติและการส่งสัญญาณเมตาบอลิซึมที่ผิดปกติในเซลล์ภูมิคุ้มกันในสภาพแวดล้อมจุลภาคของโรคเกรฟส์และโรคต่อมไทรอยด์อักเสบฮาชิโมโตะ'แนวหน้าในภูมิคุ้มกันวิทยา, 13, น. 879824. ดอย: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
