เมตาโบโลมิกส์
คุณสมบัติ
●ไม่ใช่เมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมาย (เมตาโบโลมิกส์เชิงค้นพบ)
เทคนิคเมตาโบโลมิกส์แบบไม่เจาะจงเป้าหมาย ซึ่งอาศัยเทคโนโลยีโครมาโทกราฟีของเหลว-แมสสเปกโทรเมตรี (LC-MS) ช่วยให้สามารถตรวจจับสารเมตาโบไลต์โมเลกุลขนาดเล็กได้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ในตัวอย่างทางชีวภาพ เช่น เซลล์ เนื้อเยื่อ อวัยวะ หรือของเหลวในร่างกาย โดยทำการวิเคราะห์เปรียบเทียบระหว่างกลุ่มทดลองและกลุ่มควบคุม และคัดกรองสารเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกันผ่านการวิเคราะห์ทางสถิติ
● การวิเคราะห์เมตาโบลิซึมแบบไม่เจาะจงเป้าหมายสำหรับไขมัน
โดยใช้ประโยชน์จากเทคโนโลยีโครมาโทกราฟีของเหลว-แมสสเปกโทรเมตรี (LC-MS)nการวิเคราะห์เมตาโบลิกแบบเจาะจงเป้าหมายสำหรับไขมัน ช่วยให้สามารถตรวจจับโมเลกุลไขมันได้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ในตัวอย่างทางชีวภาพ เช่น เซลล์ เนื้อเยื่อ อวัยวะ หรือของเหลวในร่างกาย โดยไม่ลำเอียง
● กว้าง-เมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมาย
บริการนี้ผสานรวมข้อดีของเทคโนโลยีแบบไม่กำหนดเป้าหมาย ทั้งความละเอียดสูงและการครอบคลุมพื้นที่กว้าง เข้ากับความไวสูงและความแม่นยำในการหาปริมาณสารด้วยเทคโนโลยี MRM (Multiple Reaction Monitoring) แบบกำหนดเป้าหมายได้อย่างลงตัว ขั้นตอนการทำงานมีดังนี้: ขั้นแรก ใช้เครื่องแมสสเปกโทรเมตรีความละเอียดสูงในการสแกน MS² ที่มีความครอบคลุมสูงมากบนตัวอย่าง เพื่อให้ได้สเปกตรัม MS² ของเมตาบอไลต์ "ทั้งหมด" จากนั้น ดำเนินการระบุเมตาบอไลต์อย่างแม่นยำโดยการรวมกับไลบรารี MS² ความละเอียดสูง (ครอบคลุมเมตาบอไลต์มากกว่า 25,000 ชนิด โดยมีสเปกตรัม MS² ความละเอียดสูงมาตรฐานหลายชุดสำหรับแต่ละเมตาบอไลต์) ต่อมา สกัดข้อมูลคู่ไอออน MRM จากสเปกตรัมมวลเพื่อสร้างไลบรารีเฉพาะสำหรับตัวอย่าง สุดท้าย ใช้เครื่องแมสสเปกโทรเมตรีแบบควอดรูโพลสามตัวร่วมกับเทคโนโลยี MRM ในการหาปริมาณสารอย่างแม่นยำ
● เมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมาย
เมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมายมุ่งเน้นไปที่สารประกอบเป้าหมายหลายชนิด หรือเมตาโบไลต์ทั้งหมด/บางส่วนที่เกี่ยวข้องในวิถีการเผาผลาญเฉพาะ โดยใช้สารมาตรฐาน วิธีการนี้สร้างวิธีการตรวจวัดที่มีความจำเพาะสูง ความไวสูง และความสามารถในการทำซ้ำที่ดีสำหรับการหาปริมาณและการวิเคราะห์สารประกอบเป้าหมาย โดยใช้สารมาตรฐานภายนอกร่วมกับสารมาตรฐานภายในสำหรับการหาปริมาณแบบสัมบูรณ์ ซึ่งความสัมพันธ์เชิงเส้นของกราฟมาตรฐานสูงกว่า 0.99 และความไวสูงถึงระดับ ng/mL
ข้อดี
●แพลตฟอร์มการตรวจจับขั้นสูง
-พร้อมด้วยเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีความละเอียดสูงระดับแนวหน้าและเครื่องแมสสเปกโทรเมตรีแบบควอดรูโพลสามตัว ทำให้สามารถตรวจจับและวิเคราะห์สารเมตาบอไลต์ได้หลายพันชนิดพร้อมกัน
●ฐานข้อมูลที่ครอบคลุม
- ฐานข้อมูลสาธารณะ: ครอบคลุม METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas และ Lipidmaps ซึ่งมีสารเมตาบอไลต์มากกว่า 500,000 ชนิด
- ภายในองค์กรฐานข้อมูลเฉพาะพืช: ประกอบด้วยสารเมตาบอไลต์มากกว่า 25,000 ชนิด รวมถึงสารเมตาบอไลต์ปฐมภูมิและทุติยภูมิ
- ภายในองค์กรฐานข้อมูลเฉพาะด้านสัตว์/การแพทย์: ประกอบด้วยสารเมตาบอไลต์มากกว่า 12,000 ชนิด
●ระบบควบคุมคุณภาพที่เข้มงวด
-มีการควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด ครอบคลุมถึงความเสถียรของเครื่องมือ สารตกค้าง การวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก (PCA) ของตัวอย่าง QC และการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ เพื่อให้มั่นใจได้ว่าข้อมูลมีคุณภาพน่าเชื่อถือ
●ความสามารถในการตรวจจับสารเมตาบอไลต์สูง
- ไม่ใช่การวิเคราะห์เมตาโบไลต์แบบเจาะจงเป้าหมาย: ตรวจจับเมตาโบไลต์ได้เฉลี่ยกว่า 4,200 ชนิดต่อรอบ เหมาะอย่างยิ่งสำหรับการสำรวจเมตาโบไลต์ที่ไม่รู้จักในตัวอย่าง และการระบุเมตาโบไลต์ในตัวอย่างที่ซับซ้อน
- กว้าง-การวิเคราะห์เมตาโบไลต์แบบเจาะจงเป้าหมาย (พืช): ตรวจจับเมตาโบไลต์ได้เฉลี่ยมากกว่า 2,410 ชนิดต่อการวิเคราะห์หนึ่งครั้ง รวมถึงเมตาโบไลต์หลักและเมตาโบไลต์รอง
- กว้าง-การวิเคราะห์เมตาโบไลต์แบบเจาะจงเป้าหมาย (สัตว์): ตรวจจับเมตาโบไลต์ได้เฉลี่ยมากกว่า 1,250 ชนิดต่อการวิเคราะห์หนึ่งครั้ง
- เมตาโบโลมิกส์แบบเจาะจงเป้าหมาย: แผงควบคุมสำหรับหมวดหมู่สารเมตาบอไลต์หลายประเภท
●การวิเคราะห์อย่างครอบคลุม
-มีรายการวิเคราะห์มากกว่า 10 รายการ และแผนภูมิแสดงผลข้อมูลมากกว่า 20 แบบ
●บริการหลังการขายที่ใส่ใจ
-ให้คำปรึกษาหลังการขายและสนับสนุนการตีความรายงานฉบับสุดท้าย
ข้อกำหนดบริการ
| สารละลาย | แพลตฟอร์ม | แนะนำให้ทำซ้ำทางชีวภาพ |
|---|---|---|
| เมตาโบโลมิกส์แบบไม่เจาะจงเป้าหมาย | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | ตัวอย่างพืชและจุลินทรีย์: ≥ 6 ตัวอย่างสัตว์: ≥ 10 ตัวอย่างทางคลินิก: ≥ 30 ตัวอย่างชีวภาพที่ทำซ้ำทั้งหมดได้รับการวิเคราะห์อย่างอิสระ |
| เมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมายกว้าง | เครื่องกรองน้ำ Water Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | ตัวอย่างพืช: ≥ 3 |
| เมตาโบโลมิกส์แบบกำหนดเป้าหมาย | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | ตัวอย่างพืช: ≥ 3 ตัวอย่างสัตว์: ≥ 6 |
ตัวอย่างข้อกำหนด
คุณสงสัยหรือไม่ว่าตัวอย่างของคุณตรงตามเกณฑ์ของเราหรือไม่? คลิกที่นี่เพื่อรับข้อมูลของเราข้อกำหนดตัวอย่างล่าสุด.
ขั้นตอนการให้บริการ
การรวบรวมตัวอย่าง
การสกัดสารเมตาบอไลต์
การเก็บรวบรวมข้อมูล
การวิเคราะห์ข้อมูล
การส่งข้อมูล
1. สัญญาณรบกวนพื้นหลังและการประมวลผลข้อมูลดิบคุณภาพต่ำ
2. การประเมินคุณภาพข้อมูล
2.1 การวิเคราะห์ส่วนประกอบหลัก
2.2 การประเมินความสามารถในการทำซ้ำ
3. การระบุสารเมตาบอไลต์
3.1 การระบุข้อมูลในฐานข้อมูล KEGG
3.2 การใส่คำอธิบายประกอบในฐานข้อมูล HMDB
3.3 การระบุข้อมูลในฐานข้อมูล Lipidmaps
4. การวิเคราะห์ข้อมูลการจัดกลุ่มตัวอย่าง (ตัวอย่างซ้ำทางชีวภาพ)≥3)
4.1 การวิเคราะห์องค์ประกอบหลักของกลุ่ม
4.2 การวิเคราะห์จำแนกประเภทโดยใช้กำลังสองน้อยที่สุดเชิงตั้งฉาก (OPLS-DA)
4.3 การวิเคราะห์เมตาโบไลต์ที่แตกต่างกันระหว่างกลุ่ม
5. การคัดเลือกเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน (ตัวอย่างทางชีวภาพ)≥3)
5.1 การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงแบบพับที่แตกต่างกัน
5.2 แผนภาพภูเขาไฟแสดงความแตกต่างของเมตาโบไลต์
5.3 แผนภูมิความร้อนของการจัดกลุ่มเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
5.4 แผนภาพความสัมพันธ์ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
5.5 แผนภาพค่า Z ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
5.6 การวิเคราะห์แผนภาพเรดาร์ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
5.7 แผนภาพไวโอลินแสดงความแตกต่างของเมตาโบไลต์
5.8 แผนภาพกล่องแสดงความแตกต่างของเมตาโบไลต์
5.9 การวิเคราะห์การระบุหน้าที่และเสริมคุณค่าของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกันโดยใช้ KEGG
5.10 การวิเคราะห์เส้นโค้ง ROC
5.11 การจัดกลุ่มแบบ k-means ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
5.12 แผนภาพเวนน์ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
1. การประเมินคุณภาพข้อมูล
↑Cการวิเคราะห์ความสัมพันธ์(ตัวอย่างทดสอบ/ตัวอย่างควบคุมคุณภาพ)
↑การวิเคราะห์ส่วนประกอบหลัก ↑การวิเคราะห์การจัดกลุ่มเมตาโบไลต์
2. การระบุสารเมตาบอไลต์
↑คำอธิบายประกอบฐานข้อมูล KEGG↑คำอธิบายประกอบฐานข้อมูล HMDB
↑คำอธิบายประกอบฐานข้อมูลลิปิดแมปส์
3. การวิเคราะห์ข้อมูลการจัดกลุ่มตัวอย่าง (ตัวอย่างซ้ำทางชีววิทยา)≥3)
↑การวิเคราะห์ส่วนประกอบหลักของกลุ่ม(2 มิติ/3 มิติ)
↑การวิเคราะห์จำแนกความแตกต่างแบบกำลังสองน้อยที่สุดเชิงตั้งฉาก (OPLS-DA)
4. การคัดเลือกเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน (ตัวอย่างซ้ำทางชีวภาพ)≥3)
↑การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงแบบพับที่แตกต่างกัน↑แผนภูมิภูเขาไฟเมตาโบไลต์เชิงอนุพันธ์
↑แผนภูมิความร้อนของการจัดกลุ่มเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน↑แผนภูมิแสดงความสัมพันธ์ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
↑แผนภูมิแสดงค่า Z-score ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน↑การวิเคราะห์แผนภาพเรดาร์เมตาโบไลต์เชิงอนุพันธ์
↑แผนภาพไวโอลินแสดงความแตกต่างของเมตาโบไลต์↑แผนภาพกล่องแสดงความแตกต่างของเมตาโบไลต์
↑การวิเคราะห์การระบุหน้าที่และเสริมคุณค่าของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกันโดยใช้ KEGG
↑การวิเคราะห์เส้นโค้ง ROC↑การจัดกลุ่มแบบ k-means ของเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกัน
↑แผนภาพเวนน์เมตาบอไลต์ดิฟเฟอเรนเชียล
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. ปัจจัยการถอดรหัสโฮมีโอโดเมนคล้าย BEL1 SAWTOOTH1 (MdSAW1) ใน Malus domestica ช่วยเพิ่มความทนทานของแอปเปิลและ Arabidopsis ที่ได้รับการดัดแปลงพันธุกรรมต่อความเครียดจากสังกะสีส่วนเกิน Int J Biol Macromol. พฤษภาคม 2025;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 10 มีนาคม 2025. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. ผลกระทบเชิงปฏิสัมพันธ์ของอนุภาคนาโนสีเขียวที่สังเคราะห์จาก Moringa oleifera และเชื้อราไมคอร์ไรซาแบบอาร์บัสคูลาร์ต่อการเจริญเติบโต โครงสร้างระบบราก และการดูดซึมสารอาหารในข้าวโพด (Zea mays L.) Plant Physiol Biochem. 2025 ก.ย.;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025 พ.ค. 24. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Jasmonate กระตุ้นโมดูลคล้าย SlJAZ2/3-SlMYC3 ที่ควบคุมการดูดซึม K+ ในมะเขือเทศเพื่อตอบสนองต่อภาวะเครียดจาก K+ ต่ำ J Integr Plant Biol. 2025 ส.ค.;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 พ.ค. 28. PMID: 40432500.
