● การพร่อง rRNA ตามด้วยการเตรียมไลบรารี mRNA ทิศทาง
● การจัดลำดับบน Illumina NovaSeq
ศึกษาการเปลี่ยนแปลงของชุมชนจุลินทรีย์เชิงซ้อน:สิ่งนี้เกิดขึ้นในระดับการถอดเสียงและสำรวจยีนใหม่ที่มีศักยภาพ
อธิบายปฏิสัมพันธ์ของชุมชนจุลินทรีย์กับโฮสต์หรือสิ่งแวดล้อม
การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศที่ครอบคลุม: ข้อมูลนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับการจัดอนุกรมวิธานและองค์ประกอบเชิงหน้าที่ของชุมชน ตลอดจนการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่แตกต่างกัน
คำอธิบายประกอบยีนที่กว้างขวาง:การใช้ฐานข้อมูลการทำงานของยีนที่ทันสมัยสำหรับข้อมูลการแสดงออกของยีนที่ให้ข้อมูลของชุมชนจุลินทรีย์
การสนับสนุนหลังการขาย:ความมุ่งมั่นของเราขยายไปไกลกว่าการเสร็จสิ้นโครงการด้วยระยะเวลาบริการหลังการขาย 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราเสนอการติดตามผลโครงการ ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใดๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
แพลตฟอร์มลำดับ | กลยุทธ์การจัดลำดับ | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพข้อมูล |
อิลลูมินา NovaSeq | พีอี150 | 12กิกะไบต์ | Q30≥85% |
ความเข้มข้น (นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณทั้งหมด (ไมโครกรัม) | ปริมาตร (ไมโครลิตร) | OD260/280 | OD260/230 | ริน |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
รวมถึงการวิเคราะห์ต่อไปนี้:
● การควบคุมคุณภาพข้อมูลตามลำดับ
● การประกอบการถอดเสียง
● คำอธิบายประกอบอนุกรมวิธานและความอุดมสมบูรณ์
● คำอธิบายประกอบการทำงานและความอุดมสมบูรณ์
● การหาปริมาณนิพจน์และการวิเคราะห์ความแตกต่าง
การกระจายอนุกรมวิธานของแต่ละตัวอย่าง:
การวิเคราะห์ความหลากหลายของเบต้า: UPGMA
คำอธิบายประกอบการทำงาน – GO ความอุดมสมบูรณ์
ความอุดมสมบูรณ์อนุกรมวิธานเชิงอนุพันธ์ – LEFSE
สำรวจความก้าวหน้าที่ได้รับการอำนวยความสะดวกโดยบริการจัดลำดับเมตาทรานสคริปโตมิกส์ของ BMKGene ผ่านคอลเลคชันสิ่งพิมพ์ที่ได้รับการดูแลจัดการ
Lu, Z. และคณะ (2023) 'ความทนทานต่อกรดของแบคทีเรียที่ใช้แลคเตทในลำดับ Bacteroidales มีส่วนช่วยในการป้องกันภาวะกรดในกระเพาะรูเมนในแพะที่ปรับให้เข้ากับอาหารที่มีความเข้มข้นสูง'โภชนาการสัตว์, 14, หน้า 130–140. ดอย: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
ซ่ง Z. และคณะ (2017) 'การเปิดเผยไมโครไบโอต้าเชิงฟังก์ชันหลักในการหมักโซลิดสเตตแบบดั้งเดิมโดยแอมพลิคอนที่มีทรูพุตสูงและการจัดลำดับเมตาทรานสคริปโตมิกส์'พรมแดนทางจุลชีววิทยา, 8(ก.ค.) ดอย: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.
วัง ดับบลิว และคณะ (2022) 'นวนิยาย Mycoviruses ที่ค้นพบจากการสำรวจ Metatranscriptomics ของเชื้อรา Alternaria จากพืช',ไวรัส, 14(11), น. 2552. ดอย: 10.3390/V14112552/S1.
เหว่ย เจ และคณะ (2022) 'การวิเคราะห์ metatranscriptome แบบคู่ขนานเผยให้เห็นการย่อยสลายของสารทุติยภูมิของพืชโดยแมลงเต่าทองและ symbionts ในลำไส้ของพวกมัน'โมเลกุล นิเวศวิทยา, 31(15), หน้า 3999–4016. ดอย: 10.1111/MEC.16557.