mRNA-seq (NGS) – De novo

การหาลำดับเบส mRNA ช่วยให้สามารถจัดทำโปรไฟล์ของทรานสคริปต์ mRNA ทั้งหมดในเซลล์ภายใต้สภาวะเฉพาะ และเป็นเทคโนโลยีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในสาขาการวิจัยต่างๆ กระบวนการ BMKCloud De novo mRNA-seq ได้รับการออกแบบมาเพื่อวิเคราะห์ไลบรารีการหาลำดับเบสที่เสริมด้วยโพลีเอ เมื่อไม่มีจีโนมอ้างอิง กระบวนการนี้เริ่มต้นด้วยการควบคุมคุณภาพ ตามด้วยเดอโนโวการประกอบทรานสคริปต์และการคัดเลือกชุดยีนเดี่ยว การวิเคราะห์โครงสร้างยีนเดี่ยวจะทำนายลำดับการเข้ารหัส (CDS) และการทำซ้ำของลำดับอย่างง่าย (SSR) จากนั้น การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างจะค้นหายีนที่มีการแสดงออกที่แตกต่าง (DEG) ในสภาวะที่ทดสอบ ตามด้วยคำอธิบายประกอบเชิงฟังก์ชันและการเพิ่ม DEG เพื่อดึงข้อมูลเชิงลึกทางชีววิทยา