การจัดลำดับจีโนมทั้งพืช/สัตว์
1.ข้อดีการบริการ
มีประสบการณ์กว้างขวางในการจัดลำดับจีโนมมากกว่า 1,000 สปีชีส์
คดีที่ได้รับการตีพิมพ์มากกว่า 800 คดี โดยมีปัจจัยผลกระทบสะสมมากกว่า 4,000 คดี
การวิเคราะห์ชีวสารสนเทศที่ครอบคลุมเกี่ยวกับการเรียกการเปลี่ยนแปลงและการวิเคราะห์ฟังก์ชัน
2. ข้อมูลจำเพาะของบริการ
| แพลตฟอร์ม | ห้องสมุด | ความลึกของลำดับที่แนะนำ | |
| อิลลูมินา | พีอี 150 | สำหรับ SNP การเรียก InDel ≥ 10x สำหรับ SV การโทร CNY ≥ 30x
| |
| นาโนพอร์
| 8 กิโลไบต์ | สำหรับ SV การโทร CNY ≥ 20x | |
| ปาคบิโอ | ซีซีเอส | 15 กิโลไบต์ | สำหรับการโทร SNP, InDel, SV, CNY ≥ 10x |
3. ข้อกำหนดตัวอย่าง
| แพลตฟอร์ม | คอนแทค(ng/μL)
| จำนวนเงิน (ng)
| ความบริสุทธิ์
| อะกาโรสเจล
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. เคลียร์วงหลักโดยไม่มีหรือจำกัดการเสื่อมสภาพที่สังเกตได้บนเจล 2. ไม่มีหรือจำกัดการปนเปื้อนของ RNA หรือโปรตีน
| ||||
| อิลลูมินา | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| นาโนพอร์
| ≥30 | ขึ้นอยู่กับผลผลิตของข้อมูล 10ไมโครกรัม/เซลล์ | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| ปาคบิโอ | ซีซีเอส | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. การวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวภาพ
5. กระบวนการทำงานบริการ
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัดดีเอ็นเอ
การก่อสร้างห้องสมุด
การเรียงลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
การส่งข้อมูล
1) สถิติการทำแผนที่จีโนม
ตารางที่ 1 สถิติผลการทำแผนที่
รูปที่ 1 การกระจายขนาดเม็ดมีดและความครอบคลุมในการอ่าน
2) การตรวจจับการเปลี่ยนแปลง
รูปที่ 2 สถิติและคำอธิบายประกอบของ SNP/INDEL/SV ในกลุ่มตัวอย่าง
รูปที่ 3 การกระจายการเปลี่ยนแปลงทั่วทั้งจีโนม
3) คำอธิบายประกอบการทำงานของรูปแบบต่างๆ
| 2019 | การสื่อสารทางธรรมชาติ | การหาลำดับจีโนมทั้งหมดเผยให้เห็นต้นกำเนิดของ Brassica napus และตำแหน่งทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับการปรับปรุง |
| 2020 | พนส | วิวัฒนาการต้นกำเนิดและประวัติการเลี้ยงของปลาทอง (Carassius auratus) |
| 2021 | วารสารเทคโนโลยีชีวภาพพืช | จีโนมอ้างอิงของปอกระเจาทั้งสองสายพันธุ์ที่ปลูก |
| 2021 | วารสารเทคโนโลยีชีวภาพพืช | ลายเซ็นต์จีโนมของผักและเมล็ดพืชน้ำมัน allopolyploid Brassicajuncea และตำแหน่งทางพันธุกรรมที่ควบคุมการสะสมของกลูโคซิโนเลต |
| 2019 | พืชโมเลกุล | การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของการสะสมเรพซีดทั่วโลกเผยให้เห็นพื้นฐานทางพันธุกรรมของความแตกต่างทางนิเวศวิทยา |
| 2022 | การวิจัยพืชสวน | การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมให้ข้อมูลเชิงลึกระดับโมเลกุลเกี่ยวกับการแปรผันตามธรรมชาติของขนาดเมล็ดแตงโม |
| 2021 | วารสารพฤกษศาสตร์ทดลอง | การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมระบุสายพันธุ์ของ GhSAD1 ที่ให้ความทนทานต่อความหนาวเย็นในฝ้าย |
| 2021 | วารสารพฤกษศาสตร์ทดลอง | การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนมและการเปรียบเทียบการถอดเสียงเผยให้เห็น QTL และยีนผู้สมัครที่ควบคุมขนาดกลีบดอกในเรพซีด |
