การจัดลำดับ RNA ขนาดเล็ก-Illumina
คุณสมบัติ
● การจัดเตรียมห้องสมุดเลือกขนาด
● การวิเคราะห์ชีวสารสนเทศที่เน้นไปที่การคาดการณ์และเป้าหมายของ miRNA
ข้อดีของการบริการ
ความเชี่ยวชาญอย่างกว้างขวาง:เราได้ประมวลผลตัวอย่างมากกว่า 300 ตัวอย่าง ครอบคลุมประเภทตัวอย่างที่หลากหลาย เรานำความเชี่ยวชาญอันล้ำค่ามาสู่ทุกโครงการ
การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวด:เราใช้จุดควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่าง การเตรียมห้องสมุด การจัดลำดับเบส และชีวสารสนเทศศาสตร์ การตรวจสอบอย่างละเอียดของเราช่วยให้มั่นใจได้ว่าผลลัพธ์จะมีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
การวิเคราะห์ชีวสารสนเทศอย่างครอบคลุม:ช่วยให้สามารถระบุไมโครอาร์เอ็นเอที่รู้จักและใหม่ ระบุเป้าหมายของไมโครอาร์เอ็นเอ และสร้างคำอธิบายประกอบฟังก์ชันที่เกี่ยวข้องและเสริมด้วยฐานข้อมูลหลายฐาน (KEGG, GO)
การสนับสนุนหลังการขายเราเข้าใจดีว่าการเข้าร่วมโครงการนั้นสำคัญเพียงใด เราจึงมุ่งมั่นทุ่มเทบริการหลังการขายตลอดระยะเวลา 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เรามีบริการติดตามผลโครงการ ช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และช่วงถาม-ตอบ เพื่อตอบข้อสงสัยต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ความต้องการตัวอย่างและการจัดส่ง
| ห้องสมุด | แพลตฟอร์ม | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพข้อมูล |
| ขนาดที่เลือก | อิลลูมิน่า SE50 | อ่าน 10-20 ล้านครั้ง | Q30≥85% |
ข้อกำหนดตัวอย่าง:
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น(นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณ (μg) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 มีการปนเปื้อนของโปรตีนหรือ DNA ในเจลอย่างจำกัดหรือไม่มีเลย | RIN≥6.0; 5.0≥28วินาที/18วินาที≥1.0; ระดับความสูงฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
● พืช:
ราก ลำต้น หรือกลีบดอก: 450 มก.
ใบหรือเมล็ด: 300 มก.
ผล: 1.2 กรัม
● สัตว์:
หัวใจหรือลำไส้: 450 มก.
อวัยวะภายในหรือสมอง: 240 มก.
กล้ามเนื้อ: 600 มก.
กระดูก เส้นผม หรือผิวหนัง: 1.5 กรัม
● สัตว์ขาปล้อง:
แมลง: 9 กรัม
ครัสเตเชีย: 450 มก.
● เลือดทั้งหมด: 2 หลอด
● เซลล์: 106 เซลล์
● ซีรั่มและพลาสมา:6 มล.
การจัดส่งตัวอย่างที่แนะนำ
ภาชนะ: หลอดเซนตริฟิวจ์ 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้กระดาษฟอยล์)
ตัวอย่างการติดฉลาก: กลุ่ม+การจำลอง เช่น A1, A2, A3; B1, B2, B3
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างจะต้องบรรจุลงในถุงและฝังไว้ในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอด RNAstable: ตัวอย่าง RNA สามารถทำให้แห้งในหลอด RNA stabilize (เช่น RNAstable®) และจัดส่งในอุณหภูมิห้อง
กระบวนการทำงานของบริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัด RNA
การก่อสร้างห้องสมุด
การจัดลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศศาสตร์
● การควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบ
● การจำแนกประเภท RNA ขนาดเล็ก
● การวิเคราะห์การแสดงออกของ miRNA และการแสดงออกที่แตกต่างกัน
● คำอธิบายยีนเป้าหมาย miRNA และยีนเป้าหมาย miRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
● คำอธิบายยีนเป้าหมายและการเพิ่มประสิทธิภาพการทำงานของยีน miRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
การระบุไมโครอาร์เอ็นเอ: โครงสร้างและความลึก
การแสดงออกที่แตกต่างกันของ miRNA – การจัดกลุ่มตามลำดับชั้น
คำอธิบายเชิงฟังก์ชันของเป้าหมายของไมโครอาร์เอ็นเอที่แสดงออกแตกต่างกัน
สำรวจความก้าวหน้าทางการวิจัยที่ได้รับการสนับสนุนโดยบริการการจัดลำดับ sRNA ของ BMKGene ผ่านทางคอลเลกชันสิ่งพิมพ์ที่คัดสรรมาอย่างดี
Chen, H. et al. (2023) 'การติดเชื้อไวรัสยับยั้งการสังเคราะห์ซาโปนินและการสังเคราะห์แสงใน Panax notoginseng'สรีรวิทยาและชีวเคมีของพืช, 203, หน้า 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'โปรตีน FREE1 ที่มีโดเมน FYVE ของพืชเชื่อมโยงกับส่วนประกอบของไมโครโปรเซสเซอร์เพื่อยับยั้งการสร้างไมโครอาร์เอ็นเอ'รายงาน EMBO, 24(1). ดอย: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'ไมโครอาร์เอ็นเอ Ame-Bantam-3p ควบคุมการพัฒนาดักแด้ตัวอ่อนโดยกำหนดเป้าหมายยีน 8 (megf8) ที่คล้ายกับโดเมนการเจริญเติบโตของเอพิเดอร์มัลหลายตัวในผึ้ง Apis mellifera'วารสารวิทยาศาสตร์โมเลกุลนานาชาติ, 24(6), หน้า 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'การวิเคราะห์แบบบูรณาการของ MiRNA และยีนที่เกี่ยวข้องกับคุณภาพเนื้อสัตว์เผยให้เห็นว่า Gga-MiR-140-5p ส่งผลต่อการสะสมไขมันในกล้ามเนื้อไก่'สรีรวิทยาของเซลล์และชีวเคมี, 46(6), หน้า 2421–2433. ดอย: 10.1159/000489649.
