การจัดลำดับ RNA ขนาดเล็ก - อิลลูมินา
คุณสมบัติ
● การเตรียมคลังข้อมูลสำหรับการเลือกขนาด
● การวิเคราะห์ทางชีวสารสนเทศที่มุ่งเน้นการทำนายและการค้นหาเป้าหมายของ miRNA
ข้อดีของการบริการ
●ความเชี่ยวชาญที่กว้างขวางเราได้ดำเนินการวิเคราะห์ตัวอย่างไปแล้วกว่า 300 ตัวอย่าง ครอบคลุมตัวอย่างหลากหลายประเภท เรานำความเชี่ยวชาญมากมายมาใช้ในทุกโครงการ
●การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวดเราใช้มาตรการควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่าง การเตรียมไลบรารี การจัดลำดับดีเอ็นเอ และชีวสารสนเทศ การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันของเราช่วยให้มั่นใจได้ว่าผลลัพธ์ที่ได้มีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
●การวิเคราะห์ข้อมูลชีวสารสนเทศอย่างครอบคลุม:วิธีนี้ช่วยให้สามารถระบุ miRNA ทั้งที่รู้จักและที่ค้นพบใหม่ ระบุเป้าหมายของ miRNA และทำการระบุหน้าที่การทำงานที่เกี่ยวข้อง รวมถึงการเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลหลายแห่ง (KEGG, GO)
●บริการหลังการขายเราเข้าใจดีว่าการอยู่เคียงข้างลูกค้ามีความสำคัญเพียงใด นั่นคือเหตุผลที่ความมุ่งมั่นของเราไม่ได้จำกัดอยู่แค่เพียงการเสร็จสิ้นโครงการ แต่ยังรวมถึงบริการหลังการขายอีก 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราจะติดตามโครงการ ให้ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และจัดช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ข้อกำหนดและวิธีการจัดส่งตัวอย่าง
| ห้องสมุด | แพลตฟอร์ม | ข้อมูลที่แนะนำ | การตรวจสอบคุณภาพข้อมูล |
| ขนาดที่เลือก | อิลลูมิน่า SE50 | ยอดอ่าน 10 ล้านถึง 20 ล้านครั้ง | Q30≥85% |
ตัวอย่างข้อกำหนด:
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น (นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณ (ไมโครกรัม) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ไม่พบการปนเปื้อนของโปรตีนหรือดีเอ็นเอในเจล หรือพบเพียงเล็กน้อย | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
● พืช:
ราก ลำต้น หรือกลีบดอก: 450 มก.
ใบหรือเมล็ด: 300 มก.
ผลไม้: 1.2 กรัม
● สัตว์:
หัวใจหรือลำไส้: 450 มก.
อวัยวะภายในหรือสมอง: 240 มก.
กล้ามเนื้อ: 600 มก.
กระดูก เส้นผม หรือผิวหนัง: 1.5 กรัม
● สัตว์ขาปล้อง:
แมลง: 9 กรัม
กุ้งและปู: 450 มก.
● เลือดครบส่วน: 2 หลอด
● เซลล์: 106 เซลล์
● เซรั่มและพลาสมา:6 มล.
คำแนะนำในการจัดส่งตัวอย่าง
ภาชนะ: หลอดเหวี่ยงขนาด 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้ฟอยล์อลูมิเนียม)
การติดฉลากตัวอย่าง: กลุ่ม + ตัวอย่างซ้ำ เช่น A1, A2, A3; B1, B2, B3
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างต้องบรรจุในถุงและฝังไว้ในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอดเก็บรักษา RNA: สามารถนำตัวอย่าง RNA ไปอบแห้งในหลอดเก็บรักษา RNA (เช่น RNAstable®) และจัดส่งที่อุณหภูมิห้องได้
ขั้นตอนการให้บริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัด RNA
การก่อสร้างห้องสมุด
การจัดลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศ
● การควบคุมคุณภาพข้อมูลดิบ
● การจำแนกประเภท RNA ขนาดเล็ก
● การแสดงออกของ miRNA และการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างกัน
● ยีนเป้าหมายของ miRNA และคำอธิบายประกอบยีนเป้าหมายของ miRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
● การระบุคำอธิบายยีนเป้าหมายและการเสริมคุณค่าหน้าที่ของยีน miRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
การระบุ miRNA: โครงสร้างและรายละเอียดเชิงลึก
การแสดงออกที่แตกต่างกันของ miRNA – การจัดกลุ่มแบบลำดับชั้น
การระบุหน้าที่การทำงานของเป้าหมายของ miRNA ที่แสดงออกแตกต่างกัน
สำรวจความก้าวหน้าทางการวิจัยที่เกิดขึ้นจากบริการจัดลำดับ sRNA ของ BMKGene ผ่านชุดบทความตีพิมพ์ที่คัดสรรมาอย่างดี
Chen, H. et al. (2023) 'การติดเชื้อไวรัสยับยั้งการสังเคราะห์ซาโปนินและการสังเคราะห์แสงใน Panax notoginseng'สรีรวิทยาและชีวเคมีของพืช, 203, หน้า 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. และคณะ (2023) 'โปรตีน FREE1 ที่มีโดเมน FYVE ในพืชจะเชื่อมโยงกับส่วนประกอบของไมโครโปรเซสเซอร์เพื่อยับยั้งการสร้าง miRNA'รายงานของ EMBO, 24(1). ดอย: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. และคณะ (2023) 'ไมโครอาร์เอ็นเอ Ame-Bantam-3p ควบคุมการพัฒนาของตัวอ่อนและดักแด้โดยการกำหนดเป้าหมายยีน Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 (megf8) ในผึ้ง Apis mellifera'วารสารวิทยาศาสตร์โมเลกุลนานาชาติ, 24(6), หน้า 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. และคณะ (2018) 'การวิเคราะห์แบบบูรณาการของ miRNA และยีนที่เกี่ยวข้องกับคุณภาพเนื้อสัตว์เผยให้เห็นว่า Gga-MiR-140-5p มีผลต่อการสะสมไขมันในกล้ามเนื้อของไก่'สรีรวิทยาและชีวเคมีของเซลล์, 46(6), หน้า 2421–2433. ดอย: 10.1159/000489649.
