การวิเคราะห์ลำดับจีโนมทั้งหมด – อิลลูมินา
คุณสมบัติ
● การสร้างไลบรารีแบบคู่เพื่อจัดลำดับจีโนมทั้งหมด: ไลบรารีที่กำจัด rRNA และการเตรียมไลบรารี RNA ขนาดเล็ก
● การวิเคราะห์ข้อมูลชีวสารสนเทศอย่างครบถ้วนของ mRNA, lncRNA, circRNA และ miRNA ในรายงานข้อมูลชีวสารสนเทศแยกต่างหาก รวมถึงการวิเคราะห์ร่วมกันของการแสดงออกของ RNA ทั้งหมด ซึ่งรวมถึงการวิเคราะห์เครือข่าย ceRNA ด้วย
ข้อดีของการบริการ
●ความเชี่ยวชาญที่กว้างขวางเราได้ดำเนินการโครงการวิเคราะห์จีโนมทั้งหมดกว่า 2,100 โครงการ ครอบคลุมตัวอย่างหลากหลายประเภท เรานำความเชี่ยวชาญมากมายมาใช้ในทุกโครงการ
●การควบคุมคุณภาพอย่างเข้มงวดเราใช้มาตรการควบคุมหลักในทุกขั้นตอน ตั้งแต่การเตรียมตัวอย่าง การเตรียมไลบรารี การจัดลำดับดีเอ็นเอ และชีวสารสนเทศ การตรวจสอบอย่างพิถีพิถันของเราช่วยให้มั่นใจได้ว่าผลลัพธ์ที่ได้มีคุณภาพสูงอย่างสม่ำเสมอ
●คำอธิบายประกอบที่ครอบคลุมเราใช้ฐานข้อมูลหลายแห่งเพื่อระบุหน้าที่การทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (DEGs) และทำการวิเคราะห์การเสริมคุณค่าที่เกี่ยวข้อง วิธีการที่ครอบคลุมนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกระบวนการระดับเซลล์และโมเลกุลที่อยู่เบื้องหลังการตอบสนองของทรานสคริปโตม ทำให้มั่นใจได้ว่าคุณจะได้รับข้อมูลทั้งหมดที่เป็นไปได้เกี่ยวกับข้อมูลการทดลองของคุณ
●การวิเคราะห์เชิงลึกของเครือข่ายการกำกับดูแลการวิเคราะห์เครือข่าย ceRNA เกิดขึ้นได้จากการจัดลำดับ mRNA, lncRNA, circRNA และ miRNA ร่วมกัน และจากกระบวนการทำงานทางชีวสารสนเทศที่ครอบคลุม
●บริการหลังการขายเราเข้าใจดีว่าการอยู่เคียงข้างลูกค้ามีความสำคัญเพียงใด นั่นคือเหตุผลที่ความมุ่งมั่นของเราไม่ได้จำกัดอยู่แค่เพียงการเสร็จสิ้นโครงการ แต่ยังรวมถึงบริการหลังการขายอีก 3 เดือน ในช่วงเวลานี้ เราจะติดตามโครงการ ให้ความช่วยเหลือในการแก้ไขปัญหา และจัดช่วงถามตอบเพื่อตอบข้อสงสัยใด ๆ ที่เกี่ยวข้องกับผลลัพธ์
ข้อกำหนดและวิธีการจัดส่งตัวอย่าง
| ห้องสมุด | กลยุทธ์การจัดลำดับ | ข้อมูลที่แนะนำ | การควบคุมคุณภาพ |
| rRNA หมดไป | อิลลูมินา พีอี150 | 16 กิกะไบต์ | Q30≥85% |
| ขนาดที่เลือก | อิลลูมิน่า SE50 | ยอดอ่าน 10-20 ล้านครั้ง |
ตัวอย่างข้อกำหนด:
นิวคลีโอไทด์:
| ความเข้มข้น (นาโนกรัม/ไมโครลิตร) | ปริมาณ (ไมโครกรัม) | ความบริสุทธิ์ | ความซื่อสัตย์ |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ไม่พบการปนเปื้อนของโปรตีนหรือดีเอ็นเอในเจล หรือพบเพียงเล็กน้อย | RIN≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; ระดับความสูงพื้นฐานจำกัดหรือไม่มีเลย |
คำแนะนำในการจัดส่งตัวอย่าง
ภาชนะ: หลอดเหวี่ยงขนาด 2 มล. (ไม่แนะนำให้ใช้ฟอยล์อลูมิเนียม)
การติดฉลากตัวอย่าง: กลุ่ม + ตัวอย่างซ้ำ เช่น A1, A2, A3; B1, B2, B3
การจัดส่ง:
1. น้ำแข็งแห้ง: ตัวอย่างต้องบรรจุในถุงและฝังไว้ในน้ำแข็งแห้ง
2. หลอดเก็บรักษา RNA: สามารถนำตัวอย่าง RNA ไปอบแห้งในหลอดเก็บรักษา RNA (เช่น RNAstable®) และจัดส่งที่อุณหภูมิห้องได้
ขั้นตอนการให้บริการ
การออกแบบการทดลอง
การจัดส่งตัวอย่าง
การสกัด RNA
การก่อสร้างห้องสมุด
การจัดลำดับ
การวิเคราะห์ข้อมูล
บริการหลังการขาย
ชีวสารสนเทศ
นอกเหนือจากการวิเคราะห์แต่ละประเภทอย่างละเอียดแล้ว เรายังได้นำ RNA ทั้ง 4 ประเภทมารวมกันในการวิเคราะห์แบบรวม:
- การวิเคราะห์การแสดงออกร่วมกันระหว่างข้อมูล RNA ประเภทต่างๆ
- ภาพรวมการแสดงออกของ RNA
- ภาพรวมการแสดงออกที่แตกต่างกัน
- เครือข่าย CeRNA
- ยีนสำคัญที่รวมอยู่ในวิถีการทำงาน
- การวิเคราะห์การอนุรักษ์
- ความสัมพันธ์เป้าหมาย
ภาพรวมการแสดงออกของ RNA
ยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน
การวิเคราะห์ ceRNA
ไมโครอาร์เอ็นเอและอาร์เอ็นเอที่เกี่ยวข้องที่มีการแสดงออกแตกต่างกัน
สำรวจความก้าวหน้าทางการวิจัยที่เกิดขึ้นจากบริการการจัดลำดับจีโนมทั้งหมดของ BMKGene ผ่านชุดบทความตีพิมพ์ที่คัดสรรมาอย่างดี
Dai, Y. และคณะ (2022) 'โปรไฟล์การแสดงออกที่ครอบคลุมของ mRNA, lncRNA และ miRNA ในโรค Kashin-Beck ที่ระบุโดยการจัดลำดับ RNA'โอมิกส์ระดับโมเลกุล, 18(2), หน้า 154–166. ดอย: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al. (2022) 'การวิเคราะห์ทรานสคริปโตมแบบเต็มความยาวของความต้านทานความหนาวเย็นของผึ้ง Apis cerana ในภูเขาฉางไป่ในช่วงฤดูหนาว'ยีน, 830, หน้า 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ และคณะ (2022) 'การจัดลำดับความสำคัญของเครือข่ายการควบคุม RNA ภายในเซลล์ที่แข่งขันกันในมะเร็งปอดชนิดเซลล์เล็กโดยอาศัยการบูรณาการมัลติโอมิกส์: ลักษณะทางโมเลกุลและตัวยาที่อาจเป็นไปได้'แนวหน้าในด้านมะเร็งวิทยา, 12, น. 904865. ดอย: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. และคณะ (2022) 'การวิเคราะห์แบบบูรณาการของโปรไฟล์การแสดงออกของ lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA เผยให้เห็นข้อมูลเชิงลึกใหม่เกี่ยวกับกลไกที่เป็นไปได้ในการตอบสนองต่อไส้เดือนฝอยรากปมในถั่วลิสง'บีเอ็มซี จีโนมิกส์, 23(1), หน้า 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. และคณะ (2022) 'การจัดลำดับ RNA ของทรานสคริปต์ทั้งหมดเน้นกลไกโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับการรักษาคุณภาพหลังการเก็บเกี่ยวในบรอกโคลีด้วยการฉายแสง LED สีแดง'ชีววิทยาและเทคโนโลยีหลังการเก็บเกี่ยว, 188, หน้า 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
