-
Hromatin immunopripsitasiýa yzygiderliligi (ChIP-seq)
ChIP-Seq, gistonyň üýtgemegi, transkripsiýa faktorlary we beýleki DNK bilen baglanyşykly beloklar üçin DNK nyşanlarynyň genom taýdan giňişleýin profilini üpjün edýär.Belli bir belok-DNK toplumlaryny dikeltmek üçin hromatin immun-ygalyň (ChIP) saýlanyşyny, dikeldilen DNK-nyň ýokary geçiş yzygiderliligi üçin indiki nesil yzygiderliligi (NGS) güýji bilen birleşdirýär.Mundan başga-da, belok-DNK toplumlary janly öýjüklerden dikeldilendigi sebäpli, baglanyşyk ýerlerini dürli öýjük görnüşlerinde we dokumalarynda ýa-da dürli şertlerde deňeşdirip bolýar.Goýmalar transkripsiýa düzgünleşdirmekden ösüş ýollaryna, kesel mehanizmlerine we başga ýerlere çenli.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Bütin genom bisul fi yzygiderliligi
Sitosiniň (5-mC) bäşinji orunda DNK metilizasiýasy geniň aňladylyşyna we öýjükli işjeňlige düýpli täsir edýär.Anormal metilizasiýa nagyşlary, düwnük ýaly birnäçe şertler we keseller bilen baglanyşyklydyr.WGBS ýeke-täk esasy ölçegde genom giň metilizasiýany öwrenmek üçin altyn standart boldy.
Platforma: Illumina NovaSeq6000
-
Transokary geçiş yzygiderliligi bilen transpozaza elýeterli hromatin üçin analiz (ATAC-seq)
ATAC-seq, geniň aňladylyşyna global epigenetiki gözegçilik üçin möhüm bolan genom giň hromatin elýeterliligini derňemek üçin ýokary geçiş yzygiderliligi usulydyr.Yzygiderli adapterler giperaktiw Tn5 transposaza arkaly açyk hromatin sebitlerine girizilýär.PCR güýçlendirilenden soň yzygiderli kitaphana gurulýar.Openhli açyk hromatin sebitlerini diňe bir transkripsiýa faktorynyň hökmany ýerleri ýa-da belli bir giston üýtgedilen sebiti bilen çäklenmän, belli bir wagt şertinde alyp bolýar.
-
Wekilçiligiň azalmagy Bisulfit yzygiderliligi (RRBS)
DNK metilizasiýa gözlegleri kesel gözleglerinde elmydama gyzgyn tema bolup, gen aňlatmasy we feno-tipiki aýratynlyklar bilen ýakyndan baglanyşyklydyr.RRBS DNK metilizasiýa gözlegleri üçin takyk, täsirli we tygşytly usul.Öndürijiniň we CpG adalarynyň sebitlerini ferment bölünişi bilen baýlaşdyrmak, Bisulfit yzygiderliligi bilen bilelikde ýokary çözgütli DNK metilizasiýasyny kesgitleýär.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
