BMKCloud Log in
条形banner-03

Mga produkto

BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome

Ang spatial na organisasyon ng mga cell ay gumaganap ng mahalagang papel sa iba't ibang biological na proseso, tulad ng immune infiltration, embryo development, atbp. Ang spatial transcriptome sequencing, na nagpapahiwatig ng gene expression profiling habang pinapanatili ang impormasyon ng spatial na posisyon, ay nagbibigay ng mahusay na mga insight sa transcriptome-level tissue architecture.Sa pag-unlad ng teknolohiya, ang ultra-clear na morpolohiya ng tissue at ang tunay na pagkakaiba-iba ng istruktura ng spatial molecular expression ay kailangang pag-aralan nang may mas mataas na resolusyon.Nagbibigay ang BMKGENE ng komprehensibo, one-stop na spatial transcriptome sequencing na serbisyo mula sa mga sample hanggang sa mga biological na insight.

Ang mga teknolohiyang spatial transcriptomics ay nagbigay ng kapangyarihan sa mga nobelang pananaw sa magkakaibang arena ng pananaliksik sa pamamagitan ng paglutas ng profile ng expression ng gene na may spatial na nilalaman sa mga heterogenous na sample.

Spatial transcriptome chip: BMKMANU S1000

Platform: Plataporma ng Illumina NovaSeq


Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta ng Demo

BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technical Scheme

S1000.

Mga kalamangan ng BMKMANU S1000

1) Sub-cellular resolution: Ang bawat capture area ay naglalaman ng >2 million spatial Barcoded Spots na may diameter na 2.5 µm at isang spacing na 5 µm sa pagitan ng mga spot center, na nagpapagana ng spatial transcriptome analysis na may sub-cellular resolution (5 µm).

s1000 (1)

2) Multi-level resolution analysis: Flexible multi-level analysis mula 100 μm hanggang 5 μm para malutas ang magkakaibang feature ng tissue sa pinakamainam na resolution.

s1000 (2)

3) Comprehensive transcriptome profiling: Maaaring masuri ang mga transcript na nakuha mula sa buong tissue slide, nang walang paghihigpit sa bilang ng mga target na gene at target na lugar.

s1000 (3)

Mga Detalye ng Serbisyo

Aklatan

Diskarte sa pagkakasunud-sunod

Inirerekomenda ang Output ng Data

S1000 cDNA library

BMKMANU S1000-Illumina PE150

60Gb/sample

Mga Sample na Kinakailangan

Sample

Numero

Sukat

Kalidad ng RNA

OCT na naka-embed na tissue block

2-3 bloke/ sample

Tinatayang6.8x6.8x6.8 mm3

RIN≥7

Para sa higit pang mga detalye sa gabay sa paghahanda ng sample at daloy ng trabaho sa serbisyo, mangyaring huwag mag-atubiling makipag-usap sa a

Daloy ng Trabaho ng Serbisyo

Sample QC

Eksperimento na disenyo

paghahatid ng sample

Paghahatid ng sample

Eksperimento ng piloto

Paunang eksperimento

Spatial barcoding

Spatial barcoding

Paghahanda sa Aklatan

Paggawa ng aklatan

Pagsusunod-sunod

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri sa datos

Pagsusuri sa datos

Mga Serbisyo pagkatapos ng pagbebenta

Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • 10x (9)

    Ang data na nabuo ng BMKMANU S1000 ay sinusuri gamit ang software na "BSTMatrix", na independiyenteng idinisenyo ng BMKGENE, kabilang ang:

    1) Gene expression matrix generation
    2) HE image processing
    3) Tugma sa downstream na third-party na software para sa pagsusuri
    4) Ang online na "BSTViewer" ay tumutulong upang makakuha ng mga resulta ng visualization sa iba't ibang mga resolusyon.

    1.Spot clustering

    s1000 (4)

    2.Spatial na pamamahagi

    s1000 (5)s1000 (6)

    Note: Resolusyonantas=13 (100 µm, umalis); 7 (50 µm, tama)

    3.Heatmap ng clustering ng clustering ng kasaganaan ng expression ng marker

    s1000 (7)

    4. Inter-sample na pagsusuri ng data

    s1000 (8)

     

    kumuha ka ng kota

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: