条形banner-03

Mga Produkto

Mga paunang-gawa na aklatan ng Illumina

Ang teknolohiyang Illumina sequencing, batay sa Sequencing by Synthesis (SBS), ay isang pandaigdigang inobasyon ng NGS, na responsable sa pagbuo ng mahigit 90% ng datos ng sequencing sa mundo. Ang prinsipyo ng SBS ay kinabibilangan ng pag-imaging ng mga fluorescently labeled reversible terminator habang ang bawat dNTP ay idinaragdag, at kasunod na pinuputol upang payagan ang pagsasama ng susunod na base. Dahil ang lahat ng apat na reversible terminator-bound dNTP ay nasa bawat sequencing cycle, binabawasan ng natural na kompetisyon ang incorporation bias. Sinusuportahan ng maraming gamit na teknolohiyang ito ang parehong single-read at paired-end libraries, na nagsisilbi sa iba't ibang genomic application. Ang mga high-throughput na kakayahan at katumpakan ng Illumina sequencing ay nagpoposisyon dito bilang isang pundasyon sa pananaliksik sa genomics, na nagbibigay-kapangyarihan sa mga siyentipiko na lutasin ang mga masalimuot na detalye ng mga genome nang may walang kapantay na detalye at kahusayan.

Ang aming paunang-gawa na serbisyo sa pag-sequence ng library ay nagbibigay-daan sa mga customer na maghanda ng mga sequencing library mula sa iba't ibang pinagmulan (mRNA, whole genome, amplicon, 10x libraries, at iba pa). Kasunod nito, ang mga library na ito ay maaaring ipadala sa aming mga sequencing center para sa quality control at sequencing sa mga platform ng Illumina.


Mga Detalye ng Serbisyo

Resulta ng Demo

Mga Tampok

Mga Plataporma:Illumina NovaSeq 6000 at NovaSeq X Plus

Mga mode ng pagkakasunod-sunod:PE150 at PE250

Pagkontrol sa kalidad ng mga library bago ang sequencing

Pagsusuri ng datos ng QC at paghahatid:paghahatid ng ulat ng QC at hilaw na datos sa format na fastq pagkatapos ng demultiplexing at pagsala ng mga nabasang Q30

 

 

Mga Kalamangan sa Serbisyo

Kakayahang umangkop sa mga serbisyo ng Sequencing:maaaring pumili ang customer na mag-sequence ayon sa lane, flow cell, o ayon sa dami ng kinakailangang datos (partial lane sequencing).

Malawak na karanasan sa platform ng Illumina sequencing:na may libu-libong saradong proyekto na may iba't ibang uri ng hayop. 

Paghahatid ng ulat ng QC sa sequencing:na may mga sukatan ng kalidad, katumpakan ng datos at pangkalahatang pagganap ng proyekto ng sequencing.

Proseso ng pag-sequence ng mga nasa hustong gulang:na may maikling oras ng pag-ikot.

Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: ipinapatupad namin ang mahigpit na mga kinakailangan sa QC upang matiyak ang patuloy na paghahatid ng mga resultang may mataas na kalidad.

 

 

Mga Halimbawang Plataporma

Plataporma

Daloy ng Selula

Paraan ng pagkakasunod-sunod

Yunit

Tinatayang output

NovaSeq X

10B (8 linya)

PE150

Isang Daan

Bahagyang Daan

375Gb / Linya

25B (8 linya)

PE150

Isang Daan

Bahagyang Daan

1000 Gb/Linya

NovaSeq 6000

SP Flow cell (2 linya)

PE250

Daloy ng Selula

Isang Daan

Bahagyang Daan

325-400 M na pagbasa / Linya

S4 Flow cell (4 na linya)

PE150

Daloy ng Selula

Isang Daan

Bahagyang Daan

~800 Gb / Linya

Mga Kinakailangan sa Halimbawa

 

Dami ng Datos (X)

Konsentrasyon (qPCR/nM)

Dami

Bahagyang Pagkakasunod-sunod ng Lane

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 µl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 µl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 µl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 25 µl

Pagkakasunod-sunod ng Lane

Bawat Lane

≥ 1.5 nM / Pool ng Aklatan

≥ 25 μl / Pool ng Aklatan

Bukod sa konsentrasyon at kabuuang dami, kinakailangan din ang angkop na pattern ng tugatog.

Paalala: Ang lane sequencing ng mga low diversity library ay nangangailangan ng PhiX spike-in upang matiyak ang matatag na base calling.

Inirerekomenda namin ang pagsusumite ng mga pre-pooled na library bilang mga sample. Kung kailangan mo ng BMKGENE para magsagawa ng library pooling, mangyaring sumangguni sa

ang mga kinakailangan ng library para sa partial lane sequencing.

Laki ng Aklatan (Mapa ng Pinakamataas na Lugar)

Ang pangunahing tugatog ay dapat nasa loob ng 300-450 bp.
Ang mga library ay dapat mayroong iisang pangunahing peak, walang kontaminasyon ng adapter at walang primer dimer.

Mangyaring makipag-ugnayan sa amin kung ang iyong mga sample ay hindi nakakatugon sa mga kinakailangan sa panimulang materyal.

Daloy ng Trabaho sa Serbisyo

paghahanda ng sample

Kontrol sa kalidad ng aklatan

Pagsunod-sunod

Pagsunod-sunod

Pagsusuri ng datos

Kontrol sa kalidad ng datos

Halimbawang QC

Paghahatid ng proyekto


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • Ulat ng QC ng Aklatan

    Isang ulat tungkol sa kalidad ng aklatan ang ibinibigay bago ang sequencing, pagtatasa ng dami ng aklatan, at fragmentation.

     

    Ulat sa QC ng pagkakasunod-sunod

     

    Talahanayan 1. Mga estadistika sa datos ng sequencing.

    Halimbawang ID

    BMKID

    Mga hilaw na babasahin

    Hilaw na Datos (bp)

    Malinis na pagbasa (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Pigura 1. Distribusyon ng kalidad kasabay ng mga pagbasa sa bawat sample

    A9

    Pigura 2. Distribusyon ng base na nilalaman

    A10

    Pigura 3. Distribusyon ng mga nabasang nilalaman sa datos ng sequencing

    A11

     

    kumuha ng presyo

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: