●Mga Plataporma:Illumina NovaSeq 6000 at NovaSeq X Plus
●Mga mode ng pagkakasunod-sunod:PE150 at PE250
●Pagkontrol sa kalidad ng mga library bago ang sequencing
●Pagsusuri ng datos ng QC at paghahatid:paghahatid ng ulat ng QC at hilaw na datos sa format na fastq pagkatapos ng demultiplexing at pagsala ng mga nabasang Q30
●Kakayahang umangkop sa mga serbisyo ng Sequencing:maaaring pumili ang customer na mag-sequence ayon sa lane, flow cell, o ayon sa dami ng kinakailangang datos (partial lane sequencing).
●Malawak na karanasan sa platform ng Illumina sequencing:na may libu-libong saradong proyekto na may iba't ibang uri ng hayop.
●Paghahatid ng ulat ng QC sa sequencing:na may mga sukatan ng kalidad, katumpakan ng datos at pangkalahatang pagganap ng proyekto ng sequencing.
●Proseso ng pag-sequence ng mga nasa hustong gulang:na may maikling oras ng pag-ikot.
●Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: ipinapatupad namin ang mahigpit na mga kinakailangan sa QC upang matiyak ang patuloy na paghahatid ng mga resultang may mataas na kalidad.
| Plataporma | Daloy ng Selula | Paraan ng pagkakasunod-sunod | Yunit | Tinatayang output |
| NovaSeq X | 10B (8 linya) | PE150 | Isang Daan Bahagyang Daan | 375Gb / Linya |
| 25B (8 linya) | PE150 | Isang Daan Bahagyang Daan | 1000 Gb/Linya | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow cell (2 linya) | PE250 | Daloy ng Selula Isang Daan Bahagyang Daan | 325-400 M na pagbasa / Linya |
| S4 Flow cell (4 na linya) | PE150 | Daloy ng Selula Isang Daan Bahagyang Daan | ~800 Gb / Linya |
| Dami ng Datos (X) | Konsentrasyon (qPCR/nM) | Dami | |
| Bahagyang Pagkakasunod-sunod ng Lane
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 µl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 µl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 µl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 µl | |
| Pagkakasunod-sunod ng Lane | Bawat Lane | ≥ 1.5 nM / Pool ng Aklatan | ≥ 25 μl / Pool ng Aklatan |
Bukod sa konsentrasyon at kabuuang dami, kinakailangan din ang angkop na pattern ng tugatog.
Paalala: Ang lane sequencing ng mga low diversity library ay nangangailangan ng PhiX spike-in upang matiyak ang matatag na base calling.
Inirerekomenda namin ang pagsusumite ng mga pre-pooled na library bilang mga sample. Kung kailangan mo ng BMKGENE para magsagawa ng library pooling, mangyaring sumangguni sa
ang mga kinakailangan ng library para sa partial lane sequencing.
Ang pangunahing tugatog ay dapat nasa loob ng 300-450 bp.
Ang mga library ay dapat mayroong iisang pangunahing peak, walang kontaminasyon ng adapter at walang primer dimer.
Isang ulat tungkol sa kalidad ng aklatan ang ibinibigay bago ang sequencing, pagtatasa ng dami ng aklatan, at fragmentation.
Talahanayan 1. Mga estadistika sa datos ng sequencing.
| Halimbawang ID | BMKID | Mga hilaw na babasahin | Hilaw na Datos (bp) | Malinis na pagbasa (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Pigura 1. Distribusyon ng kalidad kasabay ng mga pagbasa sa bawat sample
Pigura 2. Distribusyon ng base na nilalaman
Pigura 3. Distribusyon ng mga nabasang nilalaman sa datos ng sequencing