条形banner-03

Mga Produkto

Mga paunang-gawa na aklatan ng DNBSEQ

Ang DNBSEQ, na binuo ng MGI, ay isang makabagong teknolohiya ng NGS na nakapagpababa pa ng mga gastos sa sequencing at nakapagpataas ng throughput. Ang paghahanda ng mga DNBSEQ libraries ay kinabibilangan ng DNA fragmentation, paghahanda ng ssDNA, at rolling circle amplification upang makuha ang mga DNA nanoball (DNB). Ang mga ito ay ikinakarga sa isang solidong ibabaw at kasunod na ini-sequence sa pamamagitan ng combinatorial Probe-Anchor Synthesis (cPAS). Pinagsasama ng teknolohiya ng DNBSEQ ang mga bentahe ng pagkakaroon ng mababang amplification error rate sa paggamit ng mga high density error pattern sa mga nanoball, na nagreresulta sa sequencing na may mas mataas na throughput at katumpakan.

Ang aming paunang-gawa na serbisyo sa pag-sequence ng library ay nagbibigay-daan sa mga customer na maghanda ng mga Illumina sequencing library mula sa iba't ibang pinagmulan (mRNA, whole genome, amplicon, 10x libraries, bukod sa iba pa), na kino-convert sa mga MGI libraries sa aming mga laboratoryo upang ma-sequence sa DNBSEQ-T7, na nagbibigay-daan sa mataas na dami ng datos sa mas mababang gastos.


Mga Detalye ng Serbisyo

Resulta ng Demo

Mga Tampok

Plataporma:MGI-DNBSEQ-T7

Mga mode ng pagkakasunod-sunod:PE150

Paglilipat ng mga aklatan ng Illumina saMGI:pagpapagana ng pagkakasunod-sunod ng malalaking dami ng datos sa mababang gastos.

Pagkontrol sa kalidad ng mga library bago ang sequencing.

Pagsusuri ng datos ng QC at paghahatid:paghahatid ng ulat ng QC at hilaw na datos sa format na fastq pagkatapos ng demultiplexing at filtering ng mga nabasang Q30.

 

Mga Kalamangan

Kakayahang umangkop sa mga serbisyo ng Sequencing:maaaring pumili ang customer na mag-sequence ayon sa lane o dami ng data.

Mataas na output ng datos:1500 Gb/linya

Paghahatid ng ulat ng QC ng sequencing:na may mga sukatan ng kalidad, katumpakan ng datos at pangkalahatang pagganap ng proyekto ng sequencing.

Proseso ng pag-sequence ng mga nasa hustong gulang:na may maikling oras ng pag-ikot.

Mahigpit na Kontrol sa Kalidad: ipinapatupad namin ang mahigpit na mga kinakailangan sa QC upang matiyak ang patuloy na paghahatid ng mga resultang may mataas na kalidad.

 

Mga Kinakailangan sa Halimbawa

 

Dami ng Datos (X)

Konsentrasyon (qPCR/nM)

Dami

Bahagyang Daan

   

X ≤ 10 Gb

≥ 1nM

≥ 25 µl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 µl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 µl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

 

Isang Daan

Bawat Lane

≥ 1.5 nM / Pool ng Aklatan

≥ 25 μl / Pool ng Aklatan

Bukod sa konsentrasyon at kabuuang dami, kinakailangan din ang angkop na pattern ng tugatog.

Paalala: Ang lane sequencing ng mga low diversity library ay nangangailangan ng PhiX spike-in upang matiyak ang matatag na base calling.

Inirerekomenda namin ang pagsusumite ng mga pre-pooled na library bilang mga sample. Kung kailangan mo ng BMKGENE para magsagawa ng library pooling, mangyaring sumangguni sa

mga kinakailangan ng aklatan para sa bahagyang pagkakasunud-sunod ng lane.

Laki ng Aklatan (Mapa ng Pinakamataas na Lugar)

Ang pangunahing tugatog ay dapat nasa loob ng 300-450 bp.

Ang mga library ay dapat mayroong iisang pangunahing peak, walang kontaminasyon ng adapter at walang primer dimer.

Daloy ng Trabaho sa Serbisyo

paghahanda ng sample
Pagsunod-sunod
Pagsusuri ng datos
Sample-QC

  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • Ulat ng QC ng Aklatan

    Isang ulat tungkol sa kalidad ng aklatan ang ibinibigay bago ang sequencing, pagtatasa ng dami ng aklatan, at fragmentation.

     

    Ulat sa QC ng pagkakasunod-sunod

     

    Talahanayan 1. Mga estadistika sa datos ng sequencing.

    Halimbawang ID

    BMKID

    Mga hilaw na babasahin

    Hilaw na Datos (bp)

    Malinis na pagbasa (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22,870,120

    6,861,036,000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14,717,867

    4,415,360,100

    96.00

    98.95

    93.89

    37.08

    Pigura 1. Distribusyon ng kalidad kasabay ng mga pagbasa sa bawat sample

    A9

    Pigura 2. Distribusyon ng base na nilalaman

    A10

    Pigura 3. Distribusyon ng mga nabasang nilalaman sa datos ng sequencing

    A11

    kumuha ng presyo

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: