Ebolusyonaryong Henetika

Nilalayon ng mga pag-aaral sa ebolusyonaryong henetiko na maunawaan ang tilapon ng ebolusyon ng mga populasyon gamit ang impormasyon ng polymorphism sa mga genomic sequence. Ang pipeline ng BMKCloud Evolutionary Genetics ay idinisenyo upang suriin ang datos ng WGS o Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) mula sa malalaking populasyon. Pagkatapos ng kontrol sa kalidad ng hilaw na datos, ang mga pagbasa ay inihahanay sa reference genome at tinatawag ang mga variant. Kasama sa pipeline ang konstruksyon ng phylogenetic tree, principal component analysis (PCA), population structure analysis, linkage disequilibrium (LD), selective sweep analysis, at candidate gene analysis.