lncrna

Ang mga long non-coding RNA (lncRNA) ay mga RNA na mas mahaba sa 200 nucleotide na may mababang potensyal sa pag-coding ngunit may mga kritikal na tungkulin sa regulasyon. Ang pipeline ng BMKCloud lncRNA ay idinisenyo upang suriin ang mga library na kulang sa rRNA na may mataas na kalidad, mahusay na na-annotate na reference genome, sa pamamagitan ng pagsusuri ng lncRNA at mRNA expression nang magkasama. Pagkatapos ng read trimming at quality control, ang mga read ay inihahanay sa reference genome upang tipunin ang mga transcript, at ang kasunod na pagsusuri ng istruktura ng gene ay nagpapakita ng alternatibong splicing at mga nobelang gene. Ang mga transcript ay kinikilala bilang mga mRNA o lncRNA, at ang differential expression analysis ay tumutukoy sa mga differentially expressed lncRNA, ang kanilang mga target at differentially expressed genes (DEGS). Ang parehong mga DEG at differentially expressed lncRNA target ay may functionally annotation upang mahanap ang mga enriched functional category.