条形 Banner-03

Mga produkto

Metagenomic Sequencing -ngs

图片 62

Ang isang metagenome ay isang koleksyon ng kabuuang genetic na materyal ng isang halo -halong pamayanan ng mga organismo, tulad ng mga metagenome sa kapaligiran at tao. Naglalaman ito ng mga genom ng parehong malilinang at hindi mapag -aalinlanganan na mga microorganism. Ang pagkakasunud -sunod ng Shotgun metagenomic na may NGS ay nagbibigay -daan sa pag -aaral ng mga masalimuot na genomic na mga landscape na naka -embed sa mga sample ng kapaligiran sa pamamagitan ng pagbibigay ng higit sa taxonomic profiling, na nagbibigay din ng butil na pananaw sa pagkakaiba -iba ng mga species, kasaganaan ng dinamika, at kumplikadong mga istruktura ng populasyon. Higit pa sa mga pag -aaral ng taxonomic, ang shotgun metagenomics ay nag -aalok din ng isang functional genomics na pananaw, na nagpapagana sa paggalugad ng mga naka -encode na gen at ang kanilang mga putative na papel sa mga proseso ng ekolohiya. Sa wakas, ang pagtatatag ng mga network ng ugnayan sa pagitan ng mga elemento ng genetic at mga kadahilanan sa kapaligiran ay nag -aambag sa isang holistic na pag -unawa sa masalimuot na interplay sa pagitan ng mga komunidad ng microbial at ang kanilang ekolohiya na background. Sa konklusyon, ang pagkakasunud -sunod ng metagenomic ay nakatayo bilang isang pivotal na instrumento para sa paglutas ng genomic intricacy ng magkakaibang mga komunidad ng microbial, na nagpapaliwanag ng mga multifaceted na relasyon sa pagitan ng genetika at ekolohiya sa loob ng mga kumplikadong ekosistema na ito.

Mga platform: Illumina Novaseq at Dnbseq-T7


Mga detalye ng serbisyo

Bioinformatics

Mga resulta ng demo

Itinatampok na mga pahayagan

Mga kalamangan sa serbisyo

Paghiwalay at pamamaraan ng paglilinang-free para sa microbial community profiling: Pagpapagana ng pagkakasunud -sunod ng genetic material mula sa hindi mapag -aalinlanganan na mga organismo.

Mataas na resolusyon: Makita ang mga species ng mababang-kasaganaan sa mga sample ng kapaligiran.

Komprehensibong pagsusuri ng bioinformatics:Nakatuon hindi lamang sa pagkakaiba -iba ng taxonomic kundi pati na rin sa pagganap na pagkakaiba -iba ng komunidad.

Malawak na karanasan:Sa pamamagitan ng isang track record ng matagumpay na pagsasara ng maraming mga proyekto ng metagenomics sa iba't ibang mga domain ng pananaliksik at pagproseso ng higit sa 200,000 mga halimbawa, ang aming koponan ay nagdadala ng isang kayamanan ng karanasan sa bawat proyekto.

Mga pagtutukoy sa serbisyo

Sequencing platform

Diskarte sa pagkakasunud -sunod

Inirerekomenda ang data

KONTROL CONTROL

Illumina Novaseq o DNBSEQ-T7

PE150

6-20GB

Q30≥85%

Mga kinakailangan sa serbisyo

Konsentrasyon (ng/µL)

Kabuuang Halaga (Ng)

Dami (µL)

≥1

≥30

≥20

● Lupa/Pludge: 2-3g
● Nilalaman ng Intestinal-Animal: 0.5-2g
● Mga nilalaman ng bituka-insekto: 0.1-0.25g
● ibabaw ng halaman (enriched sediment): 0.5-1g
● Fermentation Broth Enriched Sediment): 0.2-0.5g
● Faeces (malalaking hayop): 0.5-2g
● Faeces (mouse): 3-5Grains
● Pulmonary alveolar lavage fluid: filter paper
● Vaginal swab: 5-6 swabs
● Balat/genital swab/saliva/oral soft tissue/pharyngeal swab/rectal swab: 2-3 swabs
● Surface microorganism: 5-6 swab
● Waterbody/Air/Biofilm: Filter Paper
● Mga endophyte: 2-3g
● Dental Plaque: 0.5-1g

Daloy ng trabaho sa serbisyo

halimbawang paghahatid

Halimbawang paghahatid

Paghahanda ng Library

Konstruksyon ng Library

Pagkakasunud -sunod

Pagkakasunud -sunod

Pagtatasa ng data

Pagtatasa ng data

Pagkatapos ng mga serbisyo sa pagbebenta

Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • 流程图 贝贝第三版 -01

    May kasamang sumusunod na pagsusuri:

    ● Kontrol ng kalidad ng data ng pagkakasunud -sunod

    ● Metagenome Assembly at hula ng gene

    ● Annotation ng Gene

    ● Pagtatasa ng pagkakaiba -iba ng alpha ng taxonomic

    ● Pag -andar ng Pagsusuri ng Komunidad: Biological Function, Metabolic, Antibiotic Resistance

    ● Pagtatasa sa parehong pagkakaiba -iba at pagkakaiba -iba ng taxonomic:

    Pagsusuri ng pagkakaiba -iba ng beta

    Pagsusuri ng Inter-Group

    Pagtatasa ng Korelasyon: Sa pagitan ng mga kadahilanan sa kapaligiran at labas ng komposisyon at pagkakaiba -iba

    Pag -andar ng Pag -andar: Paglaban sa antibiotic ng card

    图片 63

    Pagkakaiba -iba ng Pagsusuri ng KEGG Metabolic Pathways: Heatmap ng mga makabuluhang landas

     

    图片 64

     Alpha pagkakaiba -iba ng pamamahagi ng taxonomic: ACE index

    图片 65

     

    Pagkakaiba -iba ng beta ng pamamahagi ng taxonomic: PCOA

    图片 66

    Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng mga serbisyo ng pagkakasunud -sunod ng metagenome ng BMKGene kasama ang Illumina sa pamamagitan ng isang curated na koleksyon ng mga publikasyon.

    Hai, Q. et al. .Mga Frontier sa Microbiology, 14, p. 1275649. Doi: 10.3389/fmicb.2023.1275649.

    Mao, C. et al. .Journal of Hazardous Materials Advances, 9, p. 100233. Doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.

    Su, M. et al. .Mga Frontier sa Microbiology, 13, p. 851567. Doi: 10.3389/fmicb.2022.851567.

    Yin, J. et al. .Ang pagbabago, 4 (5), p. 100486. Doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.

    Zhao, X. et al. .Agham ng kabuuang kapaligiran, 887, p. 164026. Doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.

    Kumuha ng isang quote

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: