Mag-log in sa BMKCloud

Mga Produkto

Pagkakasunod-sunod ng Metatranscriptome

Gamit ang teknolohiya ng Illumina sequencing, inilalantad ng serbisyo ng metatranscriptome sequencing ng BMKGENE ang dinamikong ekspresyon ng gene ng magkakaibang hanay ng mga mikrobyo, mula sa mga eukaryote hanggang sa mga prokaryote at mga virus, sa loob ng mga natural na kapaligiran tulad ng lupa, tubig, dagat, dumi, at bituka. Binibigyang-kakayahan ng aming komprehensibong serbisyo ang mga mananaliksik na suriin ang kumpletong profile ng ekspresyon ng gene ng mga kumplikadong komunidad ng microbial. Higit pa sa taxonomic analysis, pinapadali ng aming serbisyo ng metatranscriptome sequencing ang paggalugad sa functional enrichment, na nagbibigay-liwanag sa mga gene na may magkakaibang ekspresyon at ang kanilang mga tungkulin. Tuklasin ang maraming biological insight habang ninalakbay mo ang mga kumplikadong tanawin ng ekspresyon ng gene, pagkakaiba-iba ng taxonomic, at functional dynamics sa loob ng magkakaibang environmental niches na ito.

Makipag-ugnayan sa Amin

Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatika

Mga Resulta ng Demo

Mga itinatampok na publikasyon

Mga Tampok ng Serbisyo

● pagkaubos ng rRNA na sinusundan ng direktang paghahanda ng mRNA library.

● Pagsunod-sunod sa Illumina NovaSeq.

Mga Kalamangan sa Serbisyo

●Pag-aralan ang mga Pagbabago ng mga Komplikadong Komunidad ng Mikrobyo:Nangyayari ito sa antas ng transkripsyon at ginalugad ang mga potensyal na bagong gene.

●Pagpapaliwanag ng mga Interaksyon ng Komunidad ng Mikrobyo sa Host o Kapaligiran.

●Komprehensibong Pagsusuri ng BioinformatikoNagbibigay ito ng mga pananaw sa mga komposisyong taksonomiya at tungkulin ng komunidad, pati na rin ang pagsusuri ng magkakaibang ekspresyon ng gene.

●Malawakang Anotasyon ng Gene:Paggamit ng mga napapanahong database ng tungkulin ng gene para sa nakapagbibigay-kaalamang impormasyon tungkol sa ekspresyon ng gene ng mga komunidad ng mikrobyo.

●Suporta Pagkatapos ng Pagbebenta:Ang aming pangako ay higit pa sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwang panahon ng serbisyo pagkatapos ng benta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-troubleshoot, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga katanungan na may kaugnayan sa mga resulta.

Mga Espesipikasyon ng Serbisyo

Plataporma ng pagkakasunod-sunod	Istratehiya sa Pagsunod-sunod	Inirerekomendang datos	Kontrol sa Kalidad ng Datos
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Mga Kinakailangan sa Halimbawa

Konsentrasyon (ng/µL)	Kabuuang dami (µg)	Dami (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Daloy ng Trabaho sa Serbisyo

Paghahatid ng halimbawa

Pagtatayo ng aklatan

Pagsunod-sunod

Pagsusuri ng datos

Mga serbisyo pagkatapos ng benta

Nakaraan: De novo Fungal Genome Assembly

Susunod: Pagsunod-sunod ng Prokaryotic RNA

Kabilang dito ang sumusunod na pagsusuri:

● Pagkontrol sa Kalidad ng Data ng Pagkakasunod-sunod

● Pagsasama-sama ng Transcript

● Anotasyon at Kasaganaan ng Taksonomiya

● Anotasyon at Kasaganaan ng Pagganap

● Pagsusuring may Kalkulasyon ng Ekspresyon at Pagkakaiba-iba

Distribusyon ng taksonomiya ng bawat sample:

Pagsusuri ng pagkakaiba-iba ng Beta: UPGMA

Anotasyon ng tungkulin – kasaganaan ng GO

Kasaganaan ng magkakaibang taksonomiya – LEFSE

Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng mga serbisyo ng meta transcriptomics sequencing ng BMKGene sa pamamagitan ng isang napiling koleksyon ng mga publikasyon.

Lu, Z. et al. (2023) 'Ang acid tolerance ng lactate-utilizing bacteria ng order na Bacteroidales ay nakakatulong sa pag-iwas sa ruminal acidosis sa mga kambing na inangkop sa isang high-concentrate diet',Nutrisyon ng Hayop, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Song, Z. et al. (2017) 'Pagbubunyag ng mga pangunahing functional microbiota sa tradisyonal na solid-state fermentation sa pamamagitan ng mga high-throughput amplicon at metatranscriptomics sequencing',Mga Hangganan sa Mikrobiyolohiya, 8(HUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Mga Bagong Mycovirus na Natuklasan mula sa isang Survey ng Metatranscriptomics ng Phytopathogenic Alternaria Fungus',Mga virus, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Ipinapakita ng parallel metatranscriptome analysis ang degradasyon ng mga secondary metabolite ng halaman ng mga beetle at ng kanilang mga gut symbiont',Molekular Ekolohiya, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.