● Ang pag -ubos ng rRNA na sinusundan ng direksyon ng paghahanda ng library ng mRNA.
● Sequencing sa Illumina Novaseq.
●Pag -aralan ang mga pagbabago ng mga kumplikadong komunidad ng microbial:Nangyayari ito sa antas ng transkripsyon at galugarin ang mga potensyal na bagong gen.
●Nagpapaliwanag ng mga pakikipag -ugnay sa komunidad ng microbial sa host o kapaligiran.
●Komprehensibong pagsusuri ng bioinformatic: Nagbibigay ito ng mga pananaw sa mga komposisyon ng taxonomic at functional na komposisyon, pati na rin ang pagsusuri ng expression ng expression ng gene.
●Malawak na annotation ng gene:Gamit ang napapanahon na mga database ng pag-andar ng gene para sa impormasyon na impormasyon ng expression ng gene ng mga komunidad ng microbial.
●Suporta sa Post-Sales:Ang aming pangako ay lampas sa pagkumpleto ng proyekto na may isang 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-aayos, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na may kaugnayan sa mga resulta.
Sequencing platform | Diskarte sa pagkakasunud -sunod | Inirerekomenda ang data | Kontrol ng kalidad ng data |
Illumina Novaseq | PE150 | 12GB | Q30≥85% |
Konsentrasyon (ng/µL) | Kabuuang halaga (µg) | Dami (µL) | OD260/280 | OD260/230 | Rin |
≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
May kasamang sumusunod na pagsusuri:
● Kontrol ng kalidad ng data ng pagkakasunud -sunod
● Transcript Assembly
● Taxonomic annotation at kasaganaan
● Functional annotation at kasaganaan
● Expression quantification at pagkakaiba -iba ng pagsusuri
Ang pamamahagi ng taxonomic ng bawat sample:
Pagsusuri ng pagkakaiba -iba ng beta: UPGMA
Functional Annotation - Pumunta kasaganaan
Pagkakaiba -iba ng Taxonomy ABUNDANCE - Lefse
Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng mga serbisyo ng pagkakasunud -sunod ng meta transcriptomics ng BMKGENE sa pamamagitan ng isang curated na koleksyon ng mga publikasyon.
Lu, Z. et al. .Nutrisyon ng hayop, 14, p. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Kanta, Z. et al. .Mga Frontier sa Microbiology, 8 (Jul). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/buo.
Wang, W. et al. .Mga Virus, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et al. (2022) 'Ang kahanay na pagsusuri ng metatranscriptomMolekular Ecology, 31 (15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.