Mag-log in sa BMKCloud

Mga produkto

Metatranscriptome Sequencing

Ang paggamit ng teknolohiya sa pagkakasunud-sunod ng Illumina, ang metatranscriptome sequencing service ng BMKGENE ay nagpapakita ng dynamic na gene expression ng isang magkakaibang hanay ng mga mikrobyo, na sumasaklaw sa mga eukaryote hanggang sa mga prokaryote at mga virus, sa loob ng mga natural na kapaligiran tulad ng lupa, tubig, dagat, dumi, at bituka. Ang aming komprehensibong serbisyo ay nagbibigay ng kapangyarihan sa mga mananaliksik na suriin ang kumpletong mga profile ng gene expression ng mga kumplikadong microbial na komunidad. Higit pa sa pagsusuri ng taxonomic, pinapadali ng aming serbisyo ng metatranscriptome na pagkakasunud-sunod ang paggalugad sa functional enrichment, na nagbibigay-liwanag sa mga gene na naiibang ipinahayag at ang kanilang mga tungkulin. Tumuklas ng napakaraming biological na insight habang nagna-navigate ka sa mga kumplikadong landscape ng gene expression, taxonomic diversity, at functional dynamics sa loob ng magkakaibang environmental niche na ito.

Makipag-ugnayan sa Amin

Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta ng Demo

Itinatampok na mga publikasyon

Mga Tampok ng Serbisyo

● pagkaubos ng rRNA na sinusundan ng itinuro na paghahanda sa library ng mRNA.

● Sequencing sa Illumina NovaSeq.

Mga Kalamangan sa Serbisyo

●Pag-aralan ang Mga Pagbabago ng Kumplikadong Microbial Communities:Nangyayari ito sa antas ng transkripsyon at tuklasin ang mga potensyal na bagong gene.

●Pagpapaliwanag ng mga Pakikipag-ugnayan ng Microbial Community sa Host o Environment.

●Comprehensive Bioinformatic Analysis: Nagbibigay ito ng mga insight sa taxonomic at functional na komposisyon ng komunidad, pati na rin ang differential gene expression analysis.

●Malawak na Gene Annotation:Paggamit ng napapanahon na mga database ng function ng gene para sa impormasyong impormasyon sa pagpapahayag ng gene ng mga microbial na komunidad.

●Suporta sa Post-Sales:Ang aming pangako ay umaabot nang higit pa sa pagkumpleto ng proyekto sa isang 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-troubleshoot, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na nauugnay sa mga resulta.

Mga Detalye ng Serbisyo

Sequencing platform	Diskarte sa Pagsunod-sunod	Inirerekomenda ang data	Kontrol sa Kalidad ng Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Mga Sample na Kinakailangan

Konsentrasyon (ng/µL)	Kabuuang halaga (µg)	Dami (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Daloy ng Trabaho ng Serbisyo

Paghahatid ng sample

Paggawa ng aklatan

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri ng datos

Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta

Nakaraan: De novo Fungal Genome Assembly

Susunod: Prokaryotic RNA Sequencing

Kasama ang sumusunod na pagsusuri:

● Sequencing Data Quality Control

● Transcript Assembly

● Taxonomic Annotation at Abundance

● Functional Annotation at Abundance

● Quantification ng Expression at Differential Analysis

Pamamahagi ng taxonomic ng bawat sample:

Beta diversity analysis: UPGMA

Functional na anotasyon – GO kasaganaan

Differential taxonomy abundance – LEFSE

Galugarin ang mga pagsulong na pinadali ng mga serbisyo ng meta transcriptomics sequencing ng BMKGene sa pamamagitan ng isang na-curate na koleksyon ng mga publikasyon.

Lu, Z. et al. (2023) 'Ang acid tolerance ng lactate-utilizing bacteria ng order Bacteroidales ay nag-aambag sa pag-iwas sa ruminal acidosis sa mga kambing na inangkop sa isang high-concentrate na diyeta',Nutrisyon ng Hayop, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Awit, Z. et al. (2017) 'Pag-unrave ng core functional microbiota sa tradisyonal na solid-state fermentation sa pamamagitan ng high-throughput amplicons at metatranscriptomics sequencing',Mga Hangganan sa Microbiology, 8(HUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Novel Mycoviruses Discovered from a Metatranscriptomics Survey of the Phytopathogenic Alternaria Fungus',Mga virus, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Ang parallel metatranscriptome analysis ay nagpapakita ng pagkasira ng mga pangalawang metabolite ng halaman ng mga beetle at ang kanilang mga gat symbionts',Molekular Ekolohiya, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.