Mag-log in sa BMKCloud

Mga Produkto

Proteomics

Ang Proteomics ay nakatuon sa mga protina—ang mga tagapagpatupad ng mga aktibidad sa buhay na gumaganap ng mahalagang papel sa regulasyon ng transkripsyon ng organismo. Sinusuri nito ang komposisyon, mga antas ng ekspresyon, at mga estado ng pagbabago ng lahat ng pabago-bagong nagbabagong protina sa mga tisyu o selula, na tinutugunan ang makabuluhang epekto ng dinamika ng kasaganaan ng proteome sa iba't ibang proseso ng buhay. Malawakang ginagamit sa medisina, agrikultura, at pag-aalaga ng hayop. Ginagamit ng Qualitative Proteomics ang teknolohiya ng pagkakakilanlan ng protina ng HPLC-MS/MS upang matukoy ang mga sample kabilang ang mga gel strip, IP, at mga sample ng CO-IP/Pull down. Nakakamit ng Quantitative Proteomics ang tumpak na pagkuwantipika at pagkakakilanlan ng lahat ng protina na ipinapahayag ng isang genome o sa isang kumplikadong halo-halong sistema. Ang kasalukuyang mga teknolohiya ng quantitative proteomics ay pangunahing ikinategorya sa mga pamamaraang may label (TMT) at walang label (Label Free, DIA, PRM). Nagbibigay ang BMKGENE ng mga solusyon sa proteomics na may maraming platform at maraming teknolohiya.

Makipag-ugnayan sa Amin

Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatika

Mga Resulta ng Demo

Itinatampok na Publikasyon

Mga Tampok

●Qualitative Proteomics: Gumagamit ng LC-MS/MS upang matukoy ang komposisyon ng protina sa mga kumplikadong sample (SDS-PAGE gel strips, IP, Co-IP, Pull-down). Mga Bentahe: Walang limitasyon sa bilang ng sample, mabilis na pagtuklas, simpleng pagproseso ng sample, mataas na throughput, at kakayahang matukoy ang mga low-abundance na protina.

● Label Free Quantitative Proteomics: Teknolohiyang walang label na may indibidwal na pagtuklas ng sample. Sinusukat ang mga protina sa pamamagitan ng paghahambing ng mga intensidad ng signal ng peptide sa datos ng mass spectrometry. Mga Kalamangan: Simpleng operasyon, mataas na throughput (walang limitasyon sa bilang ng sample), at malawak na kakayahang magamit (angkop para sa paghahambing ng "presence/absence" na pagkakaiba-iba ng protina sa iba't ibang uri ng hayop).

● DIA Quantitative Proteomics: Gumagamit ng data-independent acquisition (DIA) mode, ini-scan ang lahat ng ion sa mga segmented window upang makuha ang kumpletong impormasyon ng ion. Mga Bentahe: Mas mahusay na repeatability, mas mataas na sakop ng protina, at mas tumpak na quantification kaysa sa DDA mode (TMT/Label Free), mainam para sa mga pag-aaral na may malalaking sample.

● 4D-Label Free Quantitative Proteomics/4D-DIA Quantitative Proteomics: Batay sa Bruker timsTOF mass spectrometer, na nagdaragdag ng ion mobility (collision cross-section) sa tradisyonal na 3D separation. Mga Kalamangan: Pinahusay na paggamit at katumpakan ng ion, komprehensibong pagpapahusay sa lalim ng saklaw, sensitivity at throughput; mas mataas na lalim ng pagkakakilanlan kaysa sa tradisyonal na 3D na pamamaraan.

● Astral Label Free Quantitative Proteomics/Astral DIA Quantitative Proteomics: Batay sa OrbitrapTM AstralTM high-resolution mass spectrometer. Mga Bentahe: Mas mataas na throughput (100+ sample/araw na may 8-min gradient), mas malalim na saklaw (8,000+ protina ang natukoy sa mga Hela cell sa loob ng 8 minuto), at mas mataas na sensitivity (mas kaunting sample ang kinakailangan).

● TMT Quantitative Proteomics: Gumagamit ng 18 isotope tag upang lagyan ng label ang mga peptide para sa sabay-sabay na pag-detect ng 18 sample. Mga Bentahe: Mataas na estabilidad (minimal na interference sa estabilidad ng instrumento, maliit na error sa sistema) at mataas na sensitivity (binabawasan ng fractionation ang complexity ng sample, pinapabuti ang low-abundance protein detection).

● PRM Targeted Proteomics: Teknolohiyang may mataas na resolusyon para sa piling pagtuklas ng mga target na protina/peptide. Mga Kalamangan: Nagbibigay-daan sa relatibo/ganap na pagkuwantipika at pag-verify ng mga resulta ng quantitative proteomics; walang paghihigpit sa antibody, mas malawak na aplikasyon kaysa sa Western Blot at ELISA.

Mga Kalamangan

● Mga Makabagong Kagamitan: May kasamang parehong kumbensyonal na mga plataporma ng proteomics at mga makabagong high-depth mass spectrometer (hal., 4D, Astral).

● Matatag na Pagtukoy: Tinitiyak ng mahigpit na mga sistema ng kontrol sa kalidad ang pare-pareho at matatag na mga proseso ng pagsubok.

● Maaasahang Resulta: Ang sabay-sabay na kwalitatibo at kwantitatibong pagsusuri ay naghahatid ng relatibong ekspresyon, molekular na timbang, kasaganaan at iba pang mahahalagang datos para sa bawat grupo.

● Mataas na Awtomasyon: Ang mga awtomatikong sistemang LC-MS ay nagbibigay-daan sa mabilis na pagsusuri at mahusay na pagganap sa paghihiwalay.

Mga Espesipikasyon ng Serbisyo

Pananaliksik sa Metabolomika sa Medisina-04(1)

Paghahambing ng mga Hindi-Naka-target na Teknik ng Proteomics
	Walang label	DIA		TMT
Paglalagay ng Label	NO	NO		OO
Mode ng Pag-scan ng Datos	DDA	DDA	DIA	DDA
Kakayahang kopyahin	Mas mababa	Mataas		Mataas
Sensitibo	Mas mababa	Mataas		Mataas
Pag-multipleks	NO	OO	NO	OO
Aplikasyon	Paghahambing ng presensya/kawalan ng protina	Malalaking sample	Pagsusuri ng iba't ibang batch ng mga sample	Paghahambing ng magkakaibang ekspresyon ng protina sa parehong uri at tisyu
Katumpakan	★	★★(4D/Astral DlA ★★★)		★★
Bilang ng Pagtuklas	★	★★(4D/Astral D\|A★★★)		★★

Mga Kinakailangan sa Halimbawa

Nagtataka ka ba kung natutugunan ng iyong mga sample ang aming pamantayan? Pindutin dito para makuha ang amingmga pinakabagong kinakailangan sa sample.

Daloy ng Trabaho sa Serbisyo

Koleksyon ng Halimbawa

Pagkuha ng Metabolite

Enzymatic na panunaw

Paghihiwalay

Pagkuha ng Datos

Pagsusuri ng Datos

Paghahatid ng Datos

Nakaraan: Metabolomika

Susunod:

Kwalitatibong Proteomics

1. Solusyon/gel ng protina: talahanayan ng kwalitatibong resulta
2. Mga Resulta ng Paghahanap sa Database
2.1 Listahan ng mga segment ng peptide na naitugma sa paghahanap sa database
2.2 Listahan ng mga protina na naitugma sa paghahanap sa database
2.3 Listahan ng mga pagbabagong naitugma sa paghahanap sa database (phosphorylation, ubiquitination, atbp.)
3. Hilaw na datos

Damihang Proteomics(Walang Label/DIA/TMT)

1. Paunang Pagproseso ng Datos
1.1 Paghahanap sa Database ng Protina
2. Pagsusuri ng Ekspresyon ng Protina
2.1 Pagsusuri ng Pangunahing Bahagi (PCA)
2.2 Relatibong Pamantayang Paglihis (RSD)
2.3 Distribusyon ng Trend ng K-means
2.4 Pagsusuri ng Reproduktibidad
2.5 Mapa ng Init ng Ekspresyon ng Protina
3. Anotasyong Pang-functional
3.1 Anotasyon ng Paggana ng GO
3.2 Anotasyon ng Tungkulin ng KEGG
3.3 Anotasyon ng Tungkulin ng COG
3.4 Anotasyon ng Tungkulin ng GOslim
3.5 Anotasyon ng Domain ng Istruktura ng Protina ng Pfam
4. Pagsusuri ng Pagkakaiba-iba ng Protina (mga biyolohikal na replika ≥ 3)
4.1 Mga Resulta ng Pagsusuri ng Pagkakaiba-iba ng Protina
4.2 Distribusyon ng mga Differential Protein Fold Changes (FC)
4.3 Pagsusuring Pang-estadistika ng Nagkakaibang Dami ng Protina
4.4 Plot ng Bulkang Protina na May Pagkakaiba
4.5 Heatmap ng Pagkakaiba-ibang Kumpol ng Protina
4.6 Anotasyon at Pagsusuri ng Pagpapayaman ng Differential Protein GO
4.7 Anotasyon ng Paggana at Pagsusuri ng Pagpapayaman ng Differential Protein KEGG
4.8 Anotasyon ng Paggana ng COG ng Differential Protein
4.9 Anotasyon at Pagsusuri ng Pagpapayaman ng Differential Protein GOslim
4.10 Anotasyon ng Domain ng Istruktura ng Protina na May Pagkakaiba at Pagsusuri ng Pagpapayaman
5. Pagsusuri ng Interaksyon ng Network ng Protina
6. Anotasyon ng Landas ng Reactome ng Protina
7. Hula sa Peptide ng Senyales
8. Lokalisasyon ng mga Protina sa Subselular

Damihang Proteomics(PRM)

1. Mga Resulta ng Pagsusukat ng PRM Protein
1.1 Pangkalahatang-ideya ng mga Resulta ng Pagkuwantipikasyon
1.2 Distribusyon ng mga Lugar ng Tuktok ng Fragment Ion para sa mga Segment ng Peptide

Damihang Proteomics
1.Pagsusuri ng Ekspresyon ng Protina

↑Pangunahing Pagsusuri ng Bahagi (PCA)↑Relatibong Pamantayang Paglihis (RSD)

↑K-means Distribusyon ng Trend ↑KorelasyonApagsusuri ngPprotinaEekspresyonLmga antas

↑ Mapa ng Init ng Ekspresyon ng Protina

2. Anotasyong Pang-functional

↑Anotasyon ng Paggana ng GO↑Anotasyon ng Pagganap ng KEGG

↑ Anotasyon ng Tungkulin ng COG ↑ Anotasyon ng Tungkulin ng GOslim

↑ Anotasyon ng Domain ng Istruktura ng Protina ng Pfam

3.Pagsusuri ng Interaksyon ng Network ng Protina

↑ Pagsusuri ng Interaksyon ng Network ng Protina

4.Hula sa Peptide ng Signal

↑ Hula sa Peptide ng Signal

5. Lokalisasyon ng mga Protina sa Subselular

↑Lokalisasyon ng mga Protina sa Subselular

2025	Pinapabuti ng mga Apoptotic Vesicle na Nagmula sa Mesenchymal Stem Cells ang mga Tugon sa Hypersensitivity sa pamamagitan ng Pag-udyok ng CD8+ T Cells Apoptosis na may Calcium Overload at Mitochondrial Dysfunction	Mataas na Agham
2024	Ang pinagsamang multi-omics ay nagpapakita ng pinahusay na antitumor efficacy ng Ang donafenib ay sinamahan ng pagsugpo sa FADS2 sa hepatocellular carcinoma	Oncology sa Pagsasalin
2024	Ipinapakita ng Pagsusuri ng Multi-Omics ang mga Natatanging Katangian ng mga Landas ng Metabolismo na Sumusuporta sa Laki ng Prutas at Pagkakaiba-iba ng Kulay ng Higanteng Kalabasa	Int. J. Mol. Sci.
2024	Ang Transcriptome at Metabolome Profiling ay Nagbibigay ng mga Bagong Pananaw sa Disuse Muscle Atrophy sa Manok: Ang Potensyal na Papel ng Mabilis na Pagkibot ng mga Fiber ng Kalamnan	Int. J. Mol. Sci.
2023	Ipinapakita ng pagsusuring multi-omics ang impluwensya ng tetracycline sa paglaki ng ugat ng ryegrass.	Journal ng mga mapanganib na materyales