WGS (Nanopore)

Ang whole genome re-sequencing gamit ang Nanopore ay isang popular na pamamaraan para sa pagtukoy ng mga genomic variant, partikular na ang mga structural variant (SV), na mas tumpak na tinatawag sa pamamagitan ng long-read sequencing kaysa sa short-read sequencing. Ang BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) pipeline ay idinisenyo upang suriin ang data mula sa mga proyekto ng WGS gamit ang Nanopore gamit ang isang mataas na kalidad, mahusay na na-annotate na reference genome. Ang pagsusuri ay nagsisimula sa read trimming at quality control, na sinusundan ng pag-align sa reference genome, SV calling at sa pamamagitan ng functional annotation ng mga SV-associated gene gamit ang maraming database.