-
PacBio-Tam-uzunluk Transkriptomu (Referanssız)
Amplicon (16S/18S/ITS) platformu, standartlaştırılmış temel analiz ve kişiselleştirilmiş analiz içeren mikrobiyal çeşitlilik proje analizinde yılların deneyimiyle geliştirilmiştir: temel analiz, mevcut mikrobiyal araştırmaların ana analiz içeriğini kapsar, analiz içeriği zengin ve kapsamlıdır, ve analiz sonuçları proje raporları şeklinde sunulur;Kişiselleştirilmiş analizin içeriği çeşitlidir.Kişiselleştirilmiş gereksinimleri gerçekleştirmek için numuneler seçilebilir ve parametreler temel analiz raporuna ve araştırma amacına göre esnek bir şekilde ayarlanabilir.Windows işletim sistemi, basit ve hızlı.
-
PacBio-Tam-uzunluk Transkriptomu (Referanssız)
Pacific Biosciences (PacBio) Isoform sıralama verilerini girdi olarak alan bu Uygulama, tam uzunluktaki transkript dizilerini (montaj olmadan) tanımlayabilir.Tam uzunluktaki dizileri referans genomla eşleyerek, kopyalar bilinen genler, kopyalar, kodlama bölgeleri vb. tarafından optimize edilebilir. Bu durumda, alternatif ekleme vb. gibi mRNA yapılarının daha doğru tanımlanması sağlanabilir.NGS transkriptom dizileme verileriyle ortak analiz, transkript düzeyinde ifadede daha kapsamlı açıklama ve daha doğru niceleme sağlar, bu da aşağı yönde diferansiyel ifade ve fonksiyonel analizden büyük ölçüde yararlanır.
-
Araç takımları
BMKCloud, tıbbi, tarım, çevre vb. dahil olmak üzere çeşitli alanlardaki araştırmacılar tarafından yaygın olarak güvenilen, genomik programlar için tek noktadan çözüm sağlayan lider bir biyoinformatik platformdur. BMKCloud, biyoinformatik analiz platformları ve araçları dahil olmak üzere entegre, güvenilir ve verimli hizmetler sağlamayı taahhüt eder. , bilgi işlem kaynakları, genel veri tabanı, biyoinformtik çevrimiçi kurslar, vb. BMKCloud, gen açıklamaları, evrimsel genetik araçlar, ncRNA, veri kalitesi kontrolü, birleştirme, hizalama, veri çıkarma, mutasyonlar, istatistikler, şekil oluşturucu, dizi dahil olmak üzere sık kullanılan çeşitli biyoinformatik araçlara sahiptir. analiz, vb.
-
küçük RNA
Küçük RNA'lar, miRNA, siRNA ve piRNA dahil olmak üzere ortalama uzunluğu 18-30 nt olan kısa kodlayıcı olmayan RNA türüdür.Bu küçük RNA'ların, mRNA bozunması, translasyon inhibisyonu, heterokromatin oluşumu, vb. gibi çeşitli biyolojik süreçlerde yer aldığı toplu olarak rapor edilmiştir. SmallRNA dizileme analizi, hayvan/bitki gelişimi, hastalık, virüs vb. üzerine yapılan çalışmalarda yaygın olarak uygulanmıştır. Küçük RNA sıralama analiz platformu, standart analiz ve gelişmiş veri madenciliğinden oluşur.RNA-seq verileri temelinde, standart analiz miRNA tanımlama ve tahminini, miRNA hedef gen tahminini, açıklama ve ifade analizini gerçekleştirebilir.Gelişmiş analiz, özelleştirilmiş miRNA arama ve çıkarma, Venn şeması oluşturma, miRNA ve hedef gen ağı oluşturma sağlar.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS, Biomarker Technologies'deki zengin deneyime dayalı olarak geliştirilmiş bir bütün genom yeniden dizileme analiz platformudur.Bu kullanımı kolay platform, hem Illumina platformundan hem de BGI dizileme platformundan oluşturulan DNA dizileme verilerine uyan birkaç temel parametreyi ayarlayarak entegre bir analiz iş akışının hızlı bir şekilde sunulmasına olanak tanır.Bu platform, çok sınırlı bir sürede yüksek verimli veri analizine olanak sağlayan yüksek performanslı bilgi işlem sunucusunda konuşlandırılmıştır.Kişiselleştirilmiş veri madenciliği, mutasyona uğramış gen sorgusu, PCR primer tasarımı vb. dahil olmak üzere standart analiz temelinde mevcuttur.
-
mRNA(Referans)
Transkriptom, genomik genetik bilgi ile biyolojik fonksiyonun proteomu arasındaki bağlantıdır.Transkripsiyonel seviye düzenleme, organizmaların en önemli ve en çok çalışılan düzenleme modudur.Transkriptom dizilimi, herhangi bir zamanda veya herhangi bir koşulda, tek bir nükleotide doğru bir çözünürlükle transkriptomu sıralayabilir. özel transkript örnekleri.
Şu anda, transkriptome dizileme teknolojisi tarım, tıp ve hayvan ve bitki geliştirme düzenlemesi, çevresel adaptasyon, bağışıklık etkileşimi, gen lokalizasyonu, tür genetik evrimi ve tümör ve genetik hastalık tespiti dahil olmak üzere diğer araştırma alanlarında yaygın olarak kullanılmaktadır.
-
Metagenomik (NGS)
Bu analiz platformu, yılların deneyimine dayalı olarak av tüfeği metagenomik veri analizi için tasarlanmıştır.Veri işleme, tür düzeyinde çalışmalar, gen fonksiyon düzeyinde çalışmalar, metagenom gruplama vb. dahil olmak üzere yaygın olarak ihtiyaç duyulan çeşitli metagenomik analizleri içeren entegre iş akışından oluşur. Ayrıca, gen ve tür sorgusu dahil olmak üzere standart analiz iş akışında özelleştirilmiş veri madenciliği araçları mevcuttur. , parametre ayarı, kişiselleştirilmiş şekil oluşturma vb.
-
LncRNA
Uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA), proteinleri kodlayamayan, uzunluğu 200 nt'den uzun olan bir transkript türüdür.Biriken kanıtlar, lncRNA'ların çoğunun işlevsel olma olasılığının çok yüksek olduğunu göstermektedir.Yüksek verimli sıralama teknolojileri ve biyoinformatik analiz araçları, lncRNA dizilerini ortaya çıkarmamızı ve bilgileri daha verimli bir şekilde konumlandırmamızı sağlar ve önemli düzenleyici işlevlere sahip lncRNA'ları keşfetmemize yol açar.BMKCloud, müşterilerimize hızlı, güvenilir ve esnek lncRNA analizi elde etmeleri için lncRNA dizileme analiz platformunu sunmaktan gurur duyar.
-
GWAS
Genom çapında ilişkilendirme çalışması (GWAS), belirli özelliklerle (fenotip) ilişkili genetik varyantları (genotip) tanımlamayı amaçlar.GWA çalışmaları, çok sayıda bireyin tüm genomunu çaprazlayan genetik belirteçleri araştırır ve popülasyon düzeyinde istatistiksel analiz yoluyla genotip-fenotip ilişkilerini tahmin eder.Tüm genom yeniden dizileme, potansiyel olarak tüm genetik varyantları keşfedebilir.Fenotipik verilerle birlikte GWAS, modern hayvan/bitki ıslahını güçlü bir şekilde destekleyen fenotiple ilgili SNP'leri, QTL'leri ve aday genleri tanımlamak için işlenebilir.SLAF, genom çapında dağıtılmış belirteçler olan SNP'yi keşfeden, kendi geliştirdiği basitleştirilmiş bir genom dizileme stratejisidir.Moleküler genetik belirteçler olarak bu SNP'ler, hedeflenen özelliklerle ilişkilendirme çalışmaları için işlenebilir.Genetik varyasyonlarla ilişkili karmaşık özellikleri belirlemede uygun maliyetli bir stratejidir.
-
Nanopore Tam uzunlukta transkriptomik
Organizmalardaki karmaşık ve değişken alternatif izoformlar, gen ekspresyonunu ve protein çeşitliliğini düzenlemek için önemli genetik mekanizmalardır.Transkript yapılarının doğru tanımlanması, gen ekspresyonu düzenleme modellerinin derinlemesine incelenmesinin temelidir.Nanopore sıralama platformu, transkriptomik çalışmayı izoform seviyesine başarıyla getirdi.Bu analiz platformu, hem gen seviyesinde hem de transkript seviyesinde kalitatif ve kantitatif analizler sağlayan referans genom bazında Nanopore platformunda oluşturulan RNA-Seq verilerini analiz etmek için tasarlanmıştır.
