circRNA dizilimi-Illumina
Özellikler
● rRNA tükenmesi ve ardından yönlü kitaplık hazırlığı, iplikçiklere özgü verilerin sekanslanmasına olanak sağlar.
● Biyoinformatik iş akışı, circRNA tahminini ve ifade miktarını belirlemeyi mümkün kılar
Hizmet Avantajları
●Daha kapsamlı RNA kütüphaneleri:kütüphane öncesi hazırlığımızda doğrusal RNA tükenmesi yerine rRNA tükenmesini kullanıyoruz, sıralama verilerinin yalnızca circRNA'yı değil aynı zamanda mRNA ve lncRNA'yı da içermesini sağlıyoruz ve bu veri kümeleri üzerinde ortak analize olanak sağlıyoruz
●Rekabetçi endojen RNA (ceRNA) ağlarının isteğe bağlı analizi: Hücresel düzenleyici mekanizmalara ilişkin daha derin bilgiler sağlamak
●Kapsamlı Uzmanlık: BMK'da 20.000'den fazla numuneyi işleme, çeşitli numune türlerini ve lncRNA projelerini kapsayan bir geçmiş performansına sahip olan ekibimiz, her projeye zengin bir deneyim katıyor.
●Titiz Kalite Kontrolü: Numune ve kütüphane hazırlığından sıralama ve biyoinformatiğe kadar tüm aşamalarda temel kontrol noktalarını uyguluyoruz.Bu titiz izleme, sürekli olarak yüksek kaliteli sonuçların elde edilmesini sağlar.
● Satış Sonrası Destek: Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet süresiyle projenin tamamlanmasının ötesine uzanır.Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili her türlü soruyu yanıtlamak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.
Numune Gereksinimleri ve Teslimat
| Kütüphane | platformu | Önerilen veriler | Veri Kalite Kontrolü |
| Poli A zenginleştirilmiş | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Örnek Gereksinimler:
Nükleotidler:
| Kons.(ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Jel üzerinde sınırlı miktarda protein veya DNA kontaminasyonu gösteriliyor veya hiç gösterilmiyor. | Bitkiler için: RIN≥6,5; Hayvanlar için: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
● Bitkiler:
Kök, Kök veya Yaprak: 450 mg
Yaprak veya Tohum: 300 mg
Meyve: 1,2 gr
● Hayvan:
Kalp veya Bağırsak: 450 mg
İç Organ veya Beyin: 240 mg
Kas: 600 mg
Kemikler, Saç veya Cilt: 1,5 g
● Eklembacaklılar:
Böcekler: 9g
Kabuklular: 450 mg
● Tam kan:2 tüp
● Hücreler: 106 hücreler
● Serum ve Plazma: 6 ml
Önerilen Numune Teslimatı
Kap: 2 ml santrifüj tüpü (Kalay folyo tavsiye edilmez)
Örnek etiketleme: Grup+kopya örneğin A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Gönderi:
1. Kuru buz: Numunelerin torbalara konulması ve kuru buza gömülmesi gerekir.
2. RNAstabil tüpler: RNA numuneleri, RNA stabilizasyon tüpünde (örn. RNAstable®) kurutulabilir ve oda sıcaklığında gönderilebilir.
Hizmet İş Akışı
Deney tasarımı
Numune teslimatı
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
Biyoenformatik
circRNA tahmini: kromozomal dağılım
Diferansiyel Olarak İfade Edilen circRNA'lar - Volkan grafiği
Diferansiyel Olarak İfade Edilen circRNA'lar - hiyerarşik kümeleme
circRNA'nın konakçı genlerinin fonksiyonel zenginleşmesi
BMKGene'nin circRNA sıralama hizmetlerinin kolaylaştırdığı araştırma gelişmelerini, seçilmiş bir yayın koleksiyonu aracılığıyla keşfedin.
Wang, X. ve ark.(2021) 'CPSF4, hepatoselüler karsinomda circRNA oluşumunu ve mikroRNA aracılı gen susturmayı düzenler', Oncogene 2021 40:25, 40(25), s. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. ve diğerleri.(2023) 'X oo-duyarlı transkriptom, pirinçte OsARAB'ın ekspresyonunu düzenleyerek dairesel RNA133'ün hastalık direncindeki rolünü ortaya koyuyor', Phytopathology Research, 5(1), s. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/ŞEKİLLER/6.
Y, H. ve ark.(2023) 'CPSF3, hepatoselüler karsinomda dairesel ve doğrusal transkriptlerin dengesini modüle eder'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. ve ark.(2023) 'Karaciğer nakli öncesi ve sonrası sirotik kardiyomiyopatide circRNA'ların kapsamlı değerlendirmesi', International Immunopharmacology, 114, s.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
