条形 Banner-03

Ürünler

Hi-C tabanlı genom düzeneği

图片 40

HI-C, problama yakınlık tabanlı etkileşimleri ve yüksek verimli sekanslamayı birleştirerek kromozom konfigürasyonunu yakalamak için tasarlanmış bir yöntemdir. Bu etkileşimlerin yoğunluğunun, kromozomlar üzerindeki fiziksel mesafe ile negatif korelasyon gösterdiğine inanılmaktadır. Bu nedenle, HI-C verileri, birleştirilmiş sekansların bir taslak genomda kümelenmesi, sıralanması ve yönlendirilmesini yönlendirmek ve bunları belirli sayıda kromozom üzerine tutturmak için kullanılır. Bu teknoloji, popülasyon bazlı bir genetik haritanın yokluğunda kromozom düzeyinde bir genom düzeneğini güçlendirir. Her bir genomun bir hi-c'ye ihtiyacı vardır.


Hizmet Ayrıntıları

Biyoinformatik

Demo sonuçları

Öne çıkan yayınlar

Hizmet Özellikleri

● PE150 ile Illumina novaseq üzerinde sıralama.

● Servis, ekstrakte edilen nükleik asitler yerine doku örneklerinin formaldehit ile çapraz bağlanmasını ve DNA-protein etkileşimlerini korumasını gerektirir.

● HI-C deney, yapışkan uçların biyotin ile kısıtlanmasını ve bitişini ve ardından etkileşimleri korurken ortaya çıkan künt uçların daireselleştirilmesini içerir. DNA daha sonra streptavid boncukları ile aşağı çekilir ve sonraki kütüphane hazırlığı için saflaştırılır.

Hizmet Avantajları

1-Hi-C Ezici

Hi-c'ye genel bakış
(Lieberman-Atan E ve ark.,Bilim, 2009)

Genetik popülasyon verilerine olan ihtiyacı ortadan kaldırma:Hi-C, kontig ankrajı için gerekli bilgileri değiştirir.

Yüksek marker yoğunluğu:%90'ın üzerinde yüksek bir kontrat ankraj oranına yol açar.

Kapsamlı uzmanlık ve yayın kayıtları:BMKGene, 1000 farklı türden ve çeşitli patentlerden 2000'den fazla Hi-C genom montajı vakası ile geniş bir deneyime sahiptir. Yayınlanmış 200'den fazla vakanın 2000'in üzerinde biriken etki faktörü vardır.

Son derece yetenekli biyoinformatik ekibi:Şirket içi patentler ve HI-C deneyleri ve veri analizi için yazılım telif hakları ile, kendi geliştirilen görselleştirme veri yazılımı manuel blok taşıma, tersine çevirme, iptal ve yeniden yapmayı sağlar.

Satış Sonrası Desteği:Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet dönemi ile projenin tamamlanmasının ötesine uzanmaktadır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili soruları ele almak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.

Kapsamlı ek açıklama: Genleri tanımlanmış varyasyonlarla işlevsel olarak açıklamak ve ilgili zenginleştirme analizini gerçekleştirmek için birden fazla veritabanı kullanıyoruz ve birden fazla araştırma projesi hakkında bilgi veriyoruz.

Hizmet Özellikleri

Kütüphane Hazırlığı

Sıralama stratejisi

Önerilen Veri Çıkışı

Kalite kontrolü

Hi-C Kütüphanesi

Illumina novaseq PE150

100x

S30 ≥% 85

Örnek gereksinimleri

Doku

Gerekli Tutar

Hayvan içkisi

≥ 2 g

Hayvan kası

Memeli kan

≥ 2 ml

Kümes hayvanları/balık kanı

Bitki- Taze Yaprak

≥ 3 g

Kültürlü Hücreler

≥ 1x107

Böcek

≥ 2 g

Servis İş Akışı

Örnek QC

Deney tasarımı

Örnek Teslimat

Örnek Teslimat

Kütüphane Hazırlığı

Kütüphane İnşaatı

Sıralama

Sıralama

Veri analizi

Veri analizi

Satış Sonrası Hizmetler

Satış Sonrası Hizmetler


  • Öncesi:
  • Sonraki:

  • 流程图 羽莹 -01

    1) Ham Veri QC

    2) HI-C Kütüphane QC: Geçerli HI-C etkileşimlerinin tahmini

    3) Hi-Con Montaj: Contig'lerin gruplar halinde kümelenmesi, ardından her grup içinde contig siparişi ve contig oryantasyon atama

    4) HI-C değerlendirmesi

    Hi-C Kütüphane QC-Hi-C geçerli etkileşim çiftlerinin tahmini

     

    图片 41

     

    Hi-C Montaj-İstatistikler

     

    图片 42

    Montaj Sonrası Değerlendirme-Kutular arasındaki sinyal yoğunluğunun ısı haritası

     

    图片 43

    BMKGene'nin Hi-Conbly Hizmetleri tarafından yapılan gelişmeleri, küratörlü bir yayın koleksiyonu aracılığıyla keşfedin.

    Tian, ​​T. ve ark. (2023) 'Önde gelen kuraklığa dirençli bir mısır germplazmının genom düzeneği ve genetik diseksiyonu', Nature Genetics 2023 55: 3, 55 (3), s. 496-506. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.

    Wang, Zl ve ark. (2020) 'Asya bal arısı apis cerana genomunun kromozom ölçeği montajı', Genetikte Frontiers, 11, s. 524140. Doi: 10.3389/fgene.2020.00279/bibtex.

    Zhang, F. ve ark. (2023) 'Solanaceae ailesindeki iki genomu analiz ederek tropan alkaloid biyosentezinin evrimini ortaya çıkarmak', Nature Communications 2023 14: 1, 14 (1), s. 1-18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.

    Zhang, X. ve ark. (2020) 'Banyan ağacının genomları ve tozlayıcı yaban arısı, incir-wasp Coevolution hakkında bilgiler sağlar', Cell, 183 (4), s. 875-889.e17. doi: 10.1016/j.cell.2020.09.043

    Teklif Alın

    Mesajınızı buraya yazın ve bize gönderin

    Mesajınızı bize gönderin: