Uzun Kodlamayan Sıralama-Illumina
Hizmet Avantajları
●mRNA ve lncRNA'nın ortak analizi: mRNA transkriptlerinin miktarının lncRNA ve hedefleri çalışmasıyla birleştirilmesiyle, hücresel tepkinin altında yatan düzenleyici mekanizmaya derinlemesine bir genel bakış elde etmek mümkündür.
●Kapsamlı Uzmanlık: Ekibimiz, çeşitli örnek türlerini ve lncRNA projelerini kapsayan BMK'da 23.000'den fazla örneği işleme geçmişiyle her projeye zengin bir deneyim katıyor.
●Titiz Kalite Kontrolü: Numune ve kütüphane hazırlığından sıralama ve biyoinformatiğe kadar tüm aşamalarda temel kontrol noktalarını uyguluyoruz. Bu titiz izleme, sürekli olarak yüksek kaliteli sonuçların elde edilmesini sağlar.
●Satış Sonrası Destek: Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet süresiyle projenin tamamlanmasının ötesine uzanır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili her türlü soruyu yanıtlamak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.
Numune Gereksinimleri ve Teslimat
| Kütüphane | platformu | Önerilen veriler | Veri Kalite Kontrolü |
| rRNA tükenmiş yön kitaplığı | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nükleotidler:
| Kons.(ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Jel üzerinde sınırlı miktarda protein veya DNA kontaminasyonu gösteriliyor veya hiç gösterilmiyor. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
● Bitkiler:
Kök, Kök veya Yaprak: 450 mg
Yaprak veya Tohum: 300 mg
Meyve: 1,2 gr
● Hayvan:
Kalp veya Bağırsak: 450 mg
İç Organ veya Beyin: 240 mg
Kas: 600 mg
Kemikler, Saç veya Cilt: 1,5 g
● Eklembacaklılar:
Böcekler: 9g
Kabuklular: 450 mg
● Tam kan:2 tüp
● Hücreler: 106 hücreler
● Serum ve Plazma: 6 ml
Önerilen Numune Teslimatı
Kap: 2 ml santrifüj tüpü (Teneke folyo tavsiye edilmez)
Örnek etiketleme: Grup+kopya örneğin A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Gönderim:
1. Kuru buz: Numunelerin torbalara konulması ve kuru buza gömülmesi gerekir.
2. RNAstabil tüpler: RNA örnekleri, RNA stabilizasyon tüpünde (örn. RNAstable®) kurutulabilir ve oda sıcaklığında gönderilebilir.
Hizmet İş Akışı
Deney tasarımı
Numune teslimatı
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış sonrası hizmetler
Biyoenformatik
Diferansiyel Gen İfadesi (DEG'ler) analizi
LncRNA ifadesinin nicelendirilmesi – kümeleme
LncRNA hedef genlerinin zenginleştirilmesi
Ortak mRNA ve lncRNA konum analizi - Circos grafiği (orta daire mRNA'dır ve iç halka lncRNA'dır)
BMKGene'nin lncRNA sıralama hizmetlerinin sağladığı ilerlemeleri, seçilmiş bir yayın koleksiyonu aracılığıyla keşfedin.
Ji, H. ve diğerleri. (2020) 'Sıçan karaciğerinde soğuk stresiyle ilişkili lncRNA'ların tanımlanması, fonksiyonel tahmini ve anahtar lncRNA doğrulaması', Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), s. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. ve diğerleri. (2021) 'Bütünleştirici Transkriptomik Analiz, CyHV-3'e Dirençli Sazan Türünün Bağışıklık Mekanizmasını Ortaya Çıkarıyor', Frontiers in Immunology, 12, s. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ ve diğerleri. (2022) 'Küçük Hücreli Akciğer Kanserinde Rekabet Eden Endojen RNA Düzenleme Ağlarının Çoklu Omik Entegrasyonu Tabanlı Önceliklendirilmesi: Moleküler Özellikler ve İlaç Adayları', Onkolojide Sınırlar, 12, s. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. ve diğerleri. (2020) 'Populus'ta fotosentezin altında yatan gen ortak ekspresyon ağının genetik diseksiyonu', Plant Bioteknoloji Dergisi, 18(4), s. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. ve diğerleri. (2022) 'Graves Hastalığı ve Hashimoto Tiroiditinin Mikro Ortamındaki Bağışıklık Hücrelerinde Düzensiz Gen Ekspresyonu ve Anormal Metabolik Sinyalleme için Küresel Düzenleyici Ağ', Frontiers in Immunology, 13, s. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
