Bmkcloud oturum açın

Ürünler

Metatranscriptom Dizileme

Illumina sekanslama teknolojisinden yararlanan BMKGene'nin metatranscriptom sekanslama hizmeti, toprak, su, deniz, dışkı ve bağırsak gibi doğal ortamlarda ökaryotları prokaryotlara ve virüslere yayan çeşitli mikropların dinamik gen ekspresyonunu ortaya çıkarır. Kapsamlı hizmetimiz, araştırmacılara karmaşık mikrobiyal toplulukların tam gen ekspresyon profillerini araştırmalarını sağlar. Taksonomik analizin ötesinde, Metatranscriptome sekanslama hizmetimiz, farklı şekilde ifade edilen genlere ve rollerine ışık tutarak, fonksiyonel zenginleşmeye araştırmayı kolaylaştırır. Bu farklı çevresel nişlerde gen ekspresyonunun, taksonomik çeşitliliğin ve fonksiyonel dinamiklerin karmaşık manzaralarında gezinirken çok sayıda biyolojik içgörü ortaya çıkarın.

Bize Ulaşın

Hizmet Ayrıntıları

Biyoinformatik

Demo sonuçları

Öne çıkan yayınlar

Hizmet Özellikleri

● RRNA tükenmesi ve ardından yönlü mRNA kütüphanesi hazırlığı.

● Illumina novaseq üzerinde sıralama.

Hizmet Avantajları

●Karmaşık mikrobiyal toplulukların değişikliklerini inceleyin:Bu transkripsiyon seviyesinde olur ve potansiyel yeni genleri keşfeder.

●Mikrobiyal topluluk etkileşimlerini konakçı veya çevre ile açıklamak.

●Kapsamlı biyoinformatik analiz: Bu, toplum taksonomik ve fonksiyonel bileşimleri ve diferansiyel gen ekspresyon analizi hakkında bilgiler sağlar.

●Geniş gen ek açıklama:Mikrobiyal toplulukların bilgilendirici gen ekspresyonu bilgileri için güncel gen fonksiyon veritabanlarının kullanılması.

●Satış Sonrası Desteği:Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet dönemi ile projenin tamamlanmasının ötesine uzanmaktadır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili soruları ele almak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.

Hizmet Özellikleri

Sıralama platformu	Sıralama stratejisi	Veriler önerilir	Veri Kalitesi Kontrolü
Illumina novaseq	PE150	12GB	S30% 85

Örnek gereksinimleri

Konsantrasyon (ng/µL)	Toplam miktar (µg)	Hacim (µl)	OD260/280	OD260/230	Rin
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Servis İş Akışı

Örnek Teslimat

Kütüphane İnşaatı

Sıralama

Veri analizi

Satış Sonrası Hizmetler

Öncesi: De novo mantar genom montajı

Sonraki: Prokaryotik RNA dizilimi

Aşağıdaki analizi içerir:

● Sıralama Veri Kalitesi Kontrolü

● Transkript montajı

● Taksonomik ek açıklama ve bolluk

● Fonksiyonel ek açıklama ve bolluk

● İfade niceliği ve diferansiyel analizi

Her örneğin taksonomik dağılımı:

Beta Çeşitlilik Analizi: UPGMA

Fonksiyonel Ek Açıklama - Bolluğa Git

Diferansiyel Taksonomi Bolluğu - Lefse

Küratörlü bir yayın koleksiyonu aracılığıyla BMKGene'nin Meta Transkriptomik Sekanslama Hizmetleri tarafından kolaylaştırılan gelişmeleri keşfedin.

Lu, Z. ve ark. (2023) 'Bacteroidales siparişinin laktat kullanan bakterilerin asit toleransı, yüksek konsantre bir diyete uyarlanmış keçilerde ruminal asidozun önlenmesine katkıda bulunur',Hayvan beslenmesi, 14, s. 130-140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.

Song, Z. ve ark. (2017) 'Yüksek verimli amplikonlar ve Metatranscriptomics dizilimi ile geleneksel katı hal fermantasyonunda çekirdek fonksiyonel mikrobiyotayı çözmek',Mikrobiyolojide Sınırlar, 8 (Tem). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/tam.

Wang, W. ve ark. (2022) 'Fitopatojenik Alternaria mantarının Metatranscriptomics araştırmasından keşfedilen roman mikovirüsleri',Virüsler, 14 (11), s. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.

Wei, J. ve ark. (2022) 'Paralel Metatranscriptomom Analizi, bitki ikincil metabolitlerinin böcekler ve bağırsak simbiyonları tarafından bozulmasını ortaya çıkarır',Moleküler Ekoloji, 31 (15), s. 3999-4016. doi: 10.1111/mec.16557.