mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA dizileme, belirli koşullar altında hücrelerdeki tüm mRNA transkriptlerinin profillenmesine olanak tanıyan ve çeşitli araştırma alanlarında yaygın olarak kullanılan bir teknolojidir. BMKCloud De novo mRNA-seq işlem hattı, referans genomu bulunmadığında poli-A ile zenginleştirilmiş dizileme kütüphanelerini analiz etmek üzere tasarlanmıştır. İşlem hattı, kalite kontrolü ile başlar ve ardından...yeniTranskript derlemesi ve unigen kümesi seçimi. Unigen yapı analizi, kodlama dizisini (CDS) ve basit dizi tekrarlarını (SSR) tahmin eder. Ardından, diferansiyel ifade analizi, test edilen koşullar arasında farklı ifade edilen genleri (DEG'ler) bulur; bunu takiben, biyolojik bilgiler elde etmek için DEG'lerin fonksiyonel açıklaması ve zenginleştirilmesi yapılır.