Ürünler

Tek çekirdekli RNA Sıralaması

Tek Çekirdekli RNA Dizileme Öne Çıkan Görüntü

Tek hücre yakalama ve bireysel kütüphane oluşturma tekniğindeki ilerleme, yüksek verimli sıralamayla birleşerek hücre bazında gen ekspresyonu çalışmalarına olanak tanır.Tüm hücrelerin ortalamasını alarak heterojenliklerinin maskelenmesini büyük ölçüde önleyen karmaşık hücre popülasyonları üzerinde daha derin ve eksiksiz bir sistem analizi sağlar.

Bununla birlikte, bazı hücreler tek hücreli süspansiyon haline getirilmeye uygun değildir, bu nedenle diğer örnek hazırlama yöntemlerine (dokulardan çekirdek ekstraksiyonu) ihtiyaç vardır, yani çekirdek doğrudan dokulardan veya hücreden ekstrakte edilir ve tek hücreli hücre süspansiyonu halinde hazırlanır. hücre dizilimi.

BMK, 10x Genomics ChromiumTM tabanlı tek hücreli RNA dizileme hizmeti sağlar.Bu hizmet, bağışıklık hücresi farklılaşması, tümör heterojenliği, doku gelişimi vb. gibi hastalıkla ilgili çalışmalar üzerine yapılan çalışmalarda yaygın olarak kullanılmaktadır.

Uzamsal transkriptom çipi: 10× Genomik

Platform: Illumina NovaSeq Platformu

Bize Ulaşın

Hizmet Detayları

Biyoenformatik

Demo Sonuçları

Teknik prensip

Çekirdeklerin izolasyonu, çift geçişli sekiz kanallı mikroakışkan sisteminden oluşan 10x Genomics ChromiumTM ile sağlanır.Bu sistemde barkodlu ve primerli bir jel boncuk, enzimler ve tek bir çekirdek nanolitre büyüklüğündeki yağ damlası içinde kapsüllenerek Emülsiyon İçinde Jel Boncuk (GEM) üretilir.GEM oluşturulduktan sonra, her GEM'de hücre lizizi ve barkodların serbest bırakılması gerçekleştirilir.mRNA, 10x barkod ve UMI ile cDNA moleküllerine ters kopyalanır ve bunlar ayrıca standart sıralama kütüphanesi yapısına tabidir.

Tek hücre süspansiyonu hazırlığı için uygun olmayan doku

Hücre / Doku	Sebep
Taze donmuş dokuyu tazeleyin	Yeni veya uzun süredir kaydedilmiş organizasyonlar alınamıyor
Kas hücresi, Megakaryosit, Yağ…	Hücre çapı cihaza girilemeyecek kadar büyük
Karaciğer…	Kırılamayacak kadar kırılgan, tek hücreleri ayırt edemiyoruz
Nöron hücresi, Beyin…	Daha hassas, vurgulanması kolay, sıralama sonuçlarını değiştirecek
Pankreas, Tiroid…	Tek hücre süspansiyonunun üretimini etkileyen endojen enzimler açısından zengin

Tek çekirdekli ve Tek hücreli

Tek çekirdekli	Tek hücreli
Sınırsız hücre çapı	Hücre çapı: 10-40 μm
Malzeme donmuş doku olabilir	Malzeme taze doku olmalıdır
Dondurulmuş hücrelerin düşük stresi	Enzim tedavisi hücre stres reaksiyonuna neden olabilir
Kırmızı kan hücrelerinin çıkarılmasına gerek yoktur	Kırmızı kan hücrelerinin çıkarılması gerekiyor
Nükleer biyobilgiyi ifade eder	Tüm hücre biyobilgiyi ifade eder