circRNA эзлеклелеге-Иллумина
Хезмәтнең өстенлекләре
ØCircRNA mRNA экспрессиясен көйләү белән бик нык бәйләнгән
ØCircRNA - miRNA - mRNA көйләү системасында катнаштылар
ØБилгеле circRNA һәм роман circRNA фаразлау буенча статистика
ØBMKCloud нигезендә нәтиҗәләр китерү: платформада махсуслаштырылган мәгълүмат казу.
ØСатудан соң хезмәтләр проект тәмамланганнан соң 3 ай дәвам итә
Requрнәк таләпләр һәм тапшыру
Requirрнәк таләпләр:
Нуклеотидлар:
| Чисталык | Сафлык | Пычрату | Күләм |
| OD260 / 280≥1.7-2.5;OD260 / 230≥0.5-2.5; | Plantsсемлекләр өчен: RIN≥6.5;Хайваннар өчен: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;чикләнгән яки төп биеклек юк | Гелдә протеин яки ДНК пычрануы чикләнгән яки юк. | Конц.≥100ng / μl;Том ≥ 10 μл;Барлыгы ≥2μg |
Кисем: Авырлык (коры): ≥1 г.
* 5 мг-дан кечерәк тукымалар өчен без флэш туңдырылган (сыек азотта) тукымалар үрнәген җибәрергә киңәш итәбез.
Күзәнәкне туктату: Күзәнәкләр саны = 3 × 107
* Без туңдырылган күзәнәк лизатын җибәрергә киңәш итәбез.Бу күзәнәк 5 × 10 дан кечерәк саналган очракта5, сыек азотта туңдырылган флэш тәкъдим ителә.
Кан үрнәкләре:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol һәм 2mL кан (TRIzol:Кан= 3: 1)
Тәкъдим ителгән үрнәк китерү
Контейнер: 2 мл центрифуга трубасы (Калай фольгасы тәкъдим ителми)
Labрнәк маркировкасы: Төркем + кабатлау, мәсәлән, A1, A2, A3;В1, В2, В3 ... ...
Җибәрү:
Коры боз: plesрнәкләрне капчыкларга тутырырга һәм коры бозга күмергә кирәк.
РНК тотрыклы трубалар: РНК үрнәкләре РНКны тотрыклыландыру трубасында киптерелергә мөмкин (мәсәлән, RNAstable®) һәм бүлмә температурасында җибәрелергә мөмкин.
Хезмәт эше
Эксперимент дизайны
Ampleрнәк китерү
РНК чыгару
Китапханә төзелеше
Эзләү
Мәгълүмат анализы
Сатудан соң хезмәтләр
Биоинформатика
 |
1.CircRNA хуҗалары
Мәгълүм булганча, циркРНАларның күпчелеге интрон яки интергения өлкәләреннән түгел, ә экзоннардан килеп чыккан.Моннан тыш, хромосомалар арасында circRNA бүленеше сизелерлек үзгәрә.Шуңа күрә, төрле үрнәкләр арасында, шул исәптән төрле ген өлкәләрендә һәм төрле хромосомаларда таратуны да кертеп, circRNA хуҗаларының төрле бүленешләрен бәяләү бик мөһим.
CircRNA хостын тарату
2. DE-circRNA буенча кластер анализы
Дифференциаль рәвештә күрсәтелгән циркРНАларның иерархик кластеры
3. DE-circRNA Хост Геннарында аннотация
DE-circRNA хуҗа геннарның классификациясе
BMK Case
CPSF4 циркРНА формалашуын һәм гепатоселяр карсиномасында микроРНА арадашлы ген сүндерүне көйли
Басылган: Онкоген, 2021
Төп нәтиҗәләр
1.CPSF4 экспрессиясе HCCда көйләнгән һәм CPSF4нең югары чагылышы HCC пациентларында начар прогноз белән бәйле.
2. CPSF4 полиадениляция сигнал эзлеклелегенә ия булган циркРНА дәрәҗәсен киметә һәм циркРНАларның кимүе miRNA туплануны киметә һәм HCCда miRNA-арадашлы ген тавышын боза.
3. Күзәнәк культурасы һәм ксенографт тычкан модельләрендәге экспериментлар күрсәткәнчә, CPSF4 HCC күзәнәкләренең таралуына ярдәм итә һәм туморигенлыкны көчәйтә.Алай гына да түгел, CPSF4 HCC-ның түбән агымындагы циркРНАның шешне басучы эффектына каршы тора
 miRNA дәрәҗәсе һәм протеин дәрәҗәсе |
Ванг X, Донг Дж, Ли Х һ.б.CPSF4 циркРНА формалашуын һәм гепатоселяр карсиномасында микроРНА арадашлы ген сүндерүне көйли [J].Онкоген.DOI ： 10.1038 / s41388-021-01867-6
