-
Хроматин иммунопрекипитация эзлеклелеге (ChIP-seq)
ChIP-Seq гистон модификациясе, транскрипция факторлары һәм башка ДНК белән бәйле протеиннар өчен ДНК максатларының геном киң профилен тәэмин итә.Бу хроматин иммуно-явым-төшемнең (ChIP) протеин-ДНК комплексларын торгызу өчен, киләсе буын эзләү көче (NGS) белән торгызылган ДНКның югары үткәрү эзлеклелеген берләштерә.Моннан тыш, протеин-ДНК комплекслары тере күзәнәкләрдән торгызылганга, бәйләүче урыннарны төрле күзәнәк төрләрендә һәм тукымаларда яки төрле шартларда чагыштырырга мөмкин.Кушымталар транскрипцияле көйләүдән үсеш юлларына кадәр, авыру механизмнарына кадәр.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Бөтен геном бисул эзлеклелеге
Osитосиндагы бишенче урында ДНК метиляциясе ген экспрессиясенә һәм кәрәзле эшчәнлеккә төп йогынты ясый.Аномаль метиляция үрнәкләре рак кебек берничә шарт һәм авырулар белән бәйле.WGBS бер база резолюциясендә геном киң метиляцияне өйрәнү өчен алтын стандартка әйләнде.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Transгары үткәрү эзлеклелеге белән транспозаза-хроматин өчен анализ (ATAC-seq)
ATAC-seq - ген экспрессиясен глобаль эпигенетик контрольдә тоту өчен мөһим булган геном киң хроматиның мөмкинлеген анализлау өчен югары үткәргеч эзләү ысулы.Эзләү адаптерлары гиперактив Tn5 транспозазасы белән ачык хроматин өлкәләренә кертелә.PCR көчәйтүдән соң эзлекле китапханә төзелә.Барлык ачык хроматин регионнары транскрипция факторының бәйләүче урыннары белән генә чикләнми, билгеле бер гистон үзгәртелгән өлкә белән билгеле бер вакыт-вакыт шартларында алына ала.
-
Бисульфит эзлеклелеген киметү (RRBS)
ДНК метилизациясен тикшерү авыруларны тикшерүдә һәрвакыт кайнар тема булып тора, һәм ген экспрессиясе һәм фено-типик үзенчәлекләр белән тыгыз бәйләнгән.RRBS - ДНК метиляциясен тикшерү өчен төгәл, эффектив һәм экономияле ысул.Промоутер һәм CpG утрау өлкәләрен ферментик ярылу (Msp I) белән баету, Бисульфит эзлеклелеге белән берлектә, югары резолюцияле ДНК метилизациясен ачыклый.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
