توپلانغان Segregant تەھلىلى
مۇلازىمەت ئەۋزەللىكى
تاكاگى قاتارلىقلار.ئۆسۈملۈك ژۇرنىلى, 2013
Øتوغرا يەرلىكلەشتۈرۈش: توپنى 30 + 30 دىن 200 + 200 گىچە ئارىلاشتۇرۇپ تەگلىك شاۋقۇنىنى ئەڭ تۆۋەن چەككە چۈشۈرۈش.ماس قەدەمسىز ئۆزگىرىشچان كاندىدات رايون مۆلچەرى.
Øئەتراپلىق تەھلىل: چوڭقۇر كاندىدات گېن ئىقتىدار ئىزاھاتى ، NR ، SwissProt ، GO ، KEGG ، COG ، KOG قاتارلىقلار.
Øتېز ئايلىنىش ۋاقتى: 45 خىزمەت كۈنى ئىچىدە گېننى تېز يەرلىكلەشتۈرۈش.
Øكەڭ تەجرىبە: BMK مىڭلىغان ئالاھىدىلىكلەرنى يەرلىكلەشتۈرۈشكە تۆھپە قوشتى ، ئۇ زىرائەتلەر ، سۇ مەھسۇلاتلىرى ، ئورمان ، گۈل ، مېۋە قاتارلىق كۆپ خىل تۈرلەرنى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ.
مۇلازىمەت ئۆلچىمى
نوپۇسى:
ئاتا-ئانىلارنىڭ ئەۋلادلىرىنى قارشى فېنوتىپلار بىلەن ئايرىش.
مەسىلەن F2 ئەۋلادلىرى ، كەينىگە قايتىش (BC) ، قايتا ھاسىل بولغان سىزىق (RIL)
ئارىلاش كۆلچەك
سۈپەت ئالاھىدىلىكى ئۈچۈن: 30 دىن 50 كىچە شەخس (ئەڭ ئاز بولغاندا 20) / توپ
مىقدارلىق تىرناققا نىسبەتەن:% 5 تىن% 10 كىچە بولغان كىشىلەر توپىدا ئەڭ كۆپ فېنوتىپلار بار (ئەڭ تۆۋەن بولغاندا 30 + 30).
تەرتىپلىك چوڭقۇرلۇق تەۋسىيە قىلىندى
كەم دېگەندە 20X / ئاتا-ئانا ۋە 1X / ئەۋلاد شەخسلەر (مەسىلەن 30 + 30 يەككە ئەۋلاد ئارىلاش كۆلچەككە ، تەرتىپ چوڭقۇرلۇقى ھەر بىر توپتا 30X بولىدۇ)
Bioinformatics analyses
üپۈتۈن گېننىڭ ماسلىشىشى
üسانلىق مەلۇمات بىر تەرەپ قىلىش
üSNP / Indel چاقىرىش
üكاندىدات رايوننى تەكشۈرۈش
üكاندىدات گېن فۇنكسىيەسى
ئۈلگە تەلەپ ۋە يەتكۈزۈش
ئەۋرىشكە تەلەپلىرى:
| gDNA sample | توقۇلما ئەۋرىشكىسى |
| قويۇقلۇقى: ng30 ng / μl | ئۆسۈملۈكلەر: 1-2 گرام |
| مىقدارى: ≥2 μg (توم ≥15 μl) | ھايۋانلار: 0.5-1 g |
| ساپلىقى: OD260 / 280 = 1.6-2.5 | پۈتۈن قان: 1.5 مىللىلېتىر |
مۇلازىمەت خىزمىتى ئېقىمى
تەجرىبە لايىھىسى
ئۈلگە يەتكۈزۈش
كۈتۈپخانا قۇرۇلۇشى
تەرتىپلەش
سانلىق مەلۇمات ئانالىزى
سېتىشتىن كېيىنكى مۇلازىمەتلەر
1. كاندىدات رايوننى پەرقلەندۈرۈش ئۈچۈن ئېۋكلېد ئارىلىقى (ED) دىكى ئۇيۇشما ئانالىز ئاساسى.تۆۋەندىكى رەسىمدە
X ئوق: خىروموسوم نومۇرىھەر بىر چېكىت SNP نىڭ ED قىممىتىگە ۋەكىللىك قىلىدۇ.قارا سىزىق ماسلاشتۇرۇلغان ED قىممىتىگە ماس كېلىدۇ.تېخىمۇ يۇقىرى ED قىممىتى تور بېكەت بىلەن ھادىسە ئوتتۇرىسىدىكى تېخىمۇ مۇھىم باغلىنىشنى كۆرسىتىدۇ.قىزىل سىزىق سىزىقى مۇھىم بىرلەشمىنىڭ بوسۇغىسىغا ۋەكىللىك قىلىدۇ.
2. SNP- كۆرسەتكۈچىنى ئاساس قىلمىغان جەمئىيەت ئانالىزى
X ئوق: خىروموسوم نومۇرىھەر بىر چېكىت SNP- كۆرسەتكۈچ قىممىتىنى كۆرسىتىدۇ.قارا سىزىق ماسلاشتۇرۇلغان SNP- كۆرسەتكۈچ قىممىتىنى كۆرسىتىدۇ.قىممىتى قانچە چوڭ بولسا ، ئۇيۇشما شۇنچە مۇھىم بولىدۇ.
BMK دېلوسى
ئاساسلىق ئۈنۈملۈك مىقدار ئالاھىدىلىكى Fnl7.1 تەرخەمەكنىڭ مېۋىنىڭ بويۇن ئۇزۇنلۇقى بىلەن مۇناسىۋەتلىك كېچىكىپ تۆرەلمە ھاسىل قىلىدىغان مول ئاقسىلنى كودلاشتۇرىدۇ.
ئېلان قىلىنغان: ئۆسۈملۈك بىئوتېخنىكا ژۇرنىلى, 2020
تەرتىپلەش ئىستراتېگىيىسى:
ئاتا-ئانىلار (جىن 5-508 ، YN): 34 × ۋە 20 for پۈتۈن گېننىڭ ماسلىشىشى.
DNA كۆلچىكى (ئۇزۇن بويۇن ۋە 50 قىسقا بويۇن): 61 × ۋە 52 for غا ماس كېلىدۇ
ئاچقۇچلۇق نەتىجىلەر
بۇ تەتقىقاتتا نوپۇسنى ئايرىش (F2 ۋە F2: 3) ئۇزۇن بويۇن تەرخەمەك سىزىقى Jin5-508 ۋە قىسقا بويۇن YN دىن ئۆتۈش ئارقىلىق بارلىققا كەلگەن.ئىككى DNA كۆلچىكىنى 50 ھەددىدىن زىيادە ئۇزۇن بويلۇق شەخس ۋە 50 ھەددىدىن زىيادە قىسقا بويلۇق شەخس ياسىغان.ئاساسلىق ئۈنۈملۈك QTL Chr07 دا BSA تەھلىلى ۋە ئەنئەنىۋى QTL خەرىتىسى ئارقىلىق ئېنىقلاندى.ئىنچىكە خەرىتە سىزىش ، گېن ئىپادىلەش مىقدارى ۋە گېنى يۆتكەش تەجرىبىسى ئارقىلىق كاندىدات رايون تېخىمۇ تارايدى ، بۇ بويۇن ئۇزۇنلۇقى CsFnl7.1 نى كونترول قىلىشتىكى مۇھىم گېننى ئاشكارىلىدى.بۇنىڭدىن باشقا ، CsFnl7.1 تەشۋىقاتچىلار رايونىدىكى كۆپ گۈللىنىشنىڭ ماس ئىپادىلەش بىلەن مۇناسىۋەتلىك ئىكەنلىكى بايقالدى.كېيىنكى فىلوگېنتىك ئانالىزدا Fnl7.1 چېكەتكىنىڭ ھىندىستاندىن بارلىققا كېلىش ئېھتىماللىقى يۇقىرى ئىكەنلىكى ئوتتۇرىغا قويۇلغان.
 BSA تەھلىلىدىكى QTL خەرىتىسى تەرخەمەك بويۇن ئۇزۇنلۇقى بىلەن مۇناسىۋەتلىك كاندىدات رايوننى ئېنىقلايدۇ |  Chr07 دا ئېنىقلانغان تەرخەمەك بويۇن ئۇزۇنلۇقى QTL نىڭ LOD ئارخىپى |
شۈ ، X. قاتارلىقلار.«ئاساسلىق ئۈنۈملۈك مىقدار ئالاھىدىلىكى Fnl7.1 تەرخەمەكنىڭ مېۋىنىڭ بويۇن ئۇزۇنلۇقى بىلەن مۇناسىۋەتلىك كېچىكىپ تۆرەلمە ھاسىل قىلىدىغان مول ئاقسىلنى كودلاشتۇرىدۇ».ئۆسۈملۈك بىئوتېخنىكا ژورنىلى 18.7 (2020).
