page_head_bg

مەھسۇلاتلار

DNA / RNA تەرتىپى -PacBio Sequencer

DNA/RNA sequencing -PacBio Sequencer Featured Image
  • DNA/RNA sequencing -PacBio Sequencer

PacBio تەرتىپلەش سۇپىسى ئۇزۇن ئوقۇلغان تەرتىپلەش سۇپىسى بولۇپ ، ئۇ ئۈچىنچى ئەۋلاد تەرتىپ (TGS) تېخنىكىسىنىڭ بىرى دەپمۇ ئاتىلىدۇ.يادرولۇق تېخنىكا ، يەككە مولېكۇلا ھەقىقىي ۋاقىت (SMRT) ، ئۇزۇنلۇقى نەچچە ئون كىلوگراملىق ئوقۇشلۇق ئەۋلادلارغا ھوقۇق بېرىدۇ.«تەرتىپلەش ئارقىلىق بىرىكتۈرۈش» ئاساسىدا ، يەككە يادرونىڭ ئېنىقلىق دەرىجىسى نۆل ھالەتتىكى دولقۇن يېتەكچىسى (ZMW) ئارقىلىق ئەمەلگە ئاشىدۇ ، بۇ يەردە پەقەت چەكلىك مىقداردا (مولېكۇلا بىرىكتۈرۈلگەن ئورۇن) يورۇتۇلدى.بۇنىڭدىن باشقا ، SMRT تەرتىپى كۆپىنچە NGS سىستېمىسىدىكى تەرتىپكە مايىللىقتىن ساقلىنىدۇ ، چۈنكى كۇتۇپخانا قۇرۇش جەريانىدا كۆپىنچە PCR كېڭەيتىش باسقۇچلىرى تەلەپ قىلىنمايدۇ.


مۇلازىمەت تەپسىلاتلىرى

Demo Results

Features

PacBio تەرتىپلىگۈچىنىڭ ئىككى رەت تەرتىپى: ئۇدا ئۇزۇن ئوقۇش (CLR) ۋە ئايلانما ئورتاق تونۇش (CCS)

تەرتىپلەش ھالىتى كۈتۈپخانىنىڭ ئۆلچىمى نەزەرىيىۋى سانلىق مەلۇماتYield (Per Cell) يەككە ئاساسئېنىقلىق قوللىنىشچان پروگراممىلار
CLR 20Kb ، 30Kb قاتارلىقلار. 80 Gb دىن 130 Gb غىچە تەخمىنەن.85% De novo، SV چاقىرىش قاتارلىقلار.
CCS 15-20 Kb 14 دىن 40 Gb / ھۈجەيرە (CCS) تەخمىنەن.99% De novo, SNP / Indel / SV چاقىرىش ، Iso-Seq,

مۇلازىمەت ئەۋزەللىكى

ØPacBio تەرتىپلەش سۇپىسىدا 7 يىلدىن ئارتۇق ھەر خىل تۈرلەر بىلەن مىڭلىغان يېپىق تۈرلەر بار.

Øئەڭ يېڭى PacBio تەرتىپلەش سۇپىسى بىلەن تولۇق سەپلەنگەن ، Sequel II يېتەرلىك تەرتىپكە كىرىشكە كاپالەتلىك قىلىدۇ

Øتېز ئايلىنىش ۋاقتى ، تېخىمۇ يۇقىرى سانلىق مەلۇمات ئۈنۈمى ۋە تېخىمۇ توغرا سانلىق مەلۇمات.

Øيۈزلىگەن يۇقىرى ئۈنۈملۈك PacBio نەشر بۇيۇملىرىغا تۆھپە قوشقان

ئەۋرىشكە تەلەپلىرى


ئۈلگە تىپى سومما قويۇقلۇقى （Qubit®） ھەجىم ساپلىق باشقىلار
Genomic DNA سانلىق مەلۇمات تەلىپىگە باغلىق ≥20 ng / μl ≥15μl OD260 / 280 = 1.6-2.3;
OD260 / 230 = 1.5-2.5 ；
ئەڭ يۇقىرى چوققا 260 nm atبۇلغىنىش يوق		 قويۇقلۇقىنى Qubit ۋە Qubit / Nanopore = 0.8-2.0 بىلەن ئۆلچەش كېرەك
ئومۇمىي RNA .51.5μg ≥40 ng / μl ≥15μl OD260 / 280 = 1.7-2.5;
OD260 / 230 = 0.5-2.5 ；بۇلغىنىش يوق		 RIN قىممىتى .5 7.5

 

مۇلازىمەت خىزمەت ئېقىمى

logo_02

ئەۋرىشكە تەييارلاش

logo_03

كۈتۈپخانا قۇرۇلۇشى

logo_05

تەرتىپلەش

logo_06

سانلىق مەلۇمات ئانالىزى

logo_01

تۈر يەتكۈزۈش

  • ئالدىنقى:
  • كېيىنكى:

    • 1. ئۆي ئىچىدىكى سانلىق مەلۇمات يوللاش

    63 CCS ھۈجەيرىسىدىن ھاسىل قىلىنغان سانلىق مەلۇماتلار (26 خىلدىن)

    Data-Pacbio-CCS-15 Kb ئوتتۇرىچە Max مىن Median
    Yield - subreads (Gb) 421.12 544.27 221.38 426.58
    Yiled - CCS (Gb) 25.93 38.59 10.86 25.43
    Polymerase N50 145,651 175,430 118,118 144,689
    Subreads N50 17,509 23,924 12,485 17,584
    CCS N50 14,490 19,034 9,876 14,747
    ئوتتۇرىچە ئۇزۇنلۇقى-Polymerase 67,995 89,379 49,664 66,433
    ئوتتۇرىچە ئۇزۇنلۇقتىكى Subreads 15,866 21,036 11,657 16,012
    ئوتتۇرىچە ئۇزۇنلۇقى- CCS 14,489 19,074 8575 14,655

    16 CLR ھۈجەيرىسىدىن ھاسىل قىلىنغان سانلىق مەلۇماتلار (76 خىلدىن)

    DATA-Pacbio-CLR-30Kb ئوتتۇرىچە Max مىن Median
    Yield - subreads (Gb) 142.20 291.40 50.55 142.49
    Polymerase N50 39,456 121,191 15,389 35,231
    Subreads N50 28,490 41,012 14,430 29,063
    ئوتتۇرىچە ئۇزۇنلۇقى-Polymerase 22,063 48,886 8,747 21,555
    ئوتتۇرىچە ئۇزۇنلۇقتىكى Subreads 17,720 27,225 8,293 17,779

    2.Data QC - Demoسانلىق مەلۇماتنىڭ سىتاتىستىكىسى

    ئۈلگە

    ccs ساننى ئوقۇيدۇ

    ئومۇمىي ccs ئاساسى (bp)

    ccs N50 نى ئوقۇيدۇ (bp)

    ccs ئۇزۇنلۇقى (bp)

    ccs ئەڭ ئۇزۇن ئوقۇش (bp)

    subreads Bases (bp)

    ccs نىسبىتى (%)

    PB_BMKxxx

    3,444,159

    54,164,122,586

    15,728

    15,726

    36,110

    863,326,330,465

    6.27

     

    باھاغا ئېرىشىش

    ئۇچۇرىڭىزنى بۇ يەرگە يېزىڭ ۋە بىزگە ئەۋەتىڭ

    مەھسۇلاتسەھىپىلىرى

    ئۇچۇرىڭىزنى بىزگە ئەۋەتىڭ:

    ئىزدەش ئۈچۈن Enter نى بېسىڭ ياكى تاقاش ئۈچۈن ESC نى بېسىڭ