-
خرومتىن ئىممۇنىتېتلاش تەرتىپى (ChIP-seq)
ChIP-Seq گىستوننى ئۆزگەرتىش ، ترانسكرىپسىيە ئامىلى ۋە باشقا DNA غا مۇناسىۋەتلىك ئاقسىللارنىڭ DNA نىشانىنىڭ گېن گۇرۇپپىسىنى ئارخىپ بىلەن تەمىنلەيدۇ.ئۇ خرومتىن ئىممۇنىتېتنىڭ يېغىشى (ChIP) نىڭ تاللاشچانلىقىنى بىرلەشتۈرۈپ ، ئالاھىدە ئاقسىل- DNA مۇرەككەپ ماددىلىرىنى ئەسلىگە كەلتۈرىدۇ ، ئەسلىگە كەلتۈرۈلگەن DNA نىڭ يۇقىرى ئۈنۈملۈك رەت تەرتىپى ئۈچۈن كېيىنكى ئەۋلاد تەرتىپ (NGS) نىڭ كۈچى.بۇنىڭدىن باشقا ، ئاقسىل- DNA مۇرەككەپ جانلىقلار ھۈجەيرىسىدىن ئەسلىگە كەلتۈرۈلگەنلىكى ئۈچۈن ، باغلىنىشلىق ئورۇنلارنى ئوخشىمىغان ھۈجەيرە تىپى ۋە توقۇلمىلاردا ياكى ئوخشىمىغان شارائىتتا سېلىشتۇرۇشقا بولىدۇ.قوللىنىشچان پروگراممىلار ترانسكرىپسىيەنى تەڭشەشتىن تەرەققىيات يولىغىچە ، كېسەللىك مىخانىزىمى ۋە ئۇنىڭدىن باشقا.
سۇپا: Illumina NovaSeq 6000
-
پۈتۈن گېن گۇرۇپپىسى bisul fi te تەرتىپى
سىتوسىننىڭ (5-mC) بەشىنچى ئورۇندا تۇرىدىغان DNA مېتىللىنىشى گېننىڭ ئىپادىلىنىشى ۋە ھۈجەيرە پائالىيىتىگە تۈپتىن تەسىر كۆرسىتىدۇ.بىنورمال مېتىللاشتۇرۇش ئەندىزىسى راكقا ئوخشاش بىر قانچە شارائىت ۋە كېسەللىكلەر بىلەن مۇناسىۋەتلىك.WGBS يەككە ئاساسىي ئېنىقلىقتىكى گېن گۇرۇپپىسىدىكى مېتىللىنىشنى تەتقىق قىلىدىغان ئالتۇن ئۆلچەمگە ئايلاندى.
سۇپا: Illumina NovaSeq6000
-
Transposase-Accessable Chromatin for High Transputing (ATAC-seq)
ATAC-seq بولسا گېننىڭ كەڭ دائىرىدىكى خرومومىننىڭ زىيارەت قىلىنىشچانلىقىنى ئانالىز قىلىشتىكى يۇقىرى ئۈنۈملۈك تەرتىپلەش ئۇسۇلى بولۇپ ، گېن ئىپادىلەشنىڭ يەر شارىنى كونترول قىلىشىدا ئىنتايىن مۇھىم.تەرتىپلىك ماسلاشتۇرغۇچلار يۇقىرى دەرىجىدىكى Tn5 تىرانسپورتى ئارقىلىق ئوچۇق خرومتىن رايونىغا قىستۇرۇلىدۇ.PCR كۈچەيتىلگەندىن كېيىن ، تەرتىپلىك كۇتۇپخانا قۇرۇلدى.بارلىق ئوچۇق خرومتىن رايونلىرىنى مەلۇم بوشلۇق-ۋاقىت شارائىتىدا ئېرىشكىلى بولىدۇ ، پەقەت ترانسكرىپسىيە ئامىلىنىڭ باغلىنىشلىق ئورنى ياكى مەلۇم گىستون ئۆزگەرتىلگەن رايون بىلەنلا چەكلىنىپ قالمايدۇ.
-
قىسقارتىلغان ۋەكىللىك Bisulfite تەرتىپى (RRBS)
DNA مېتىللاشتۇرۇش تەتقىقاتى ئەزەلدىن كېسەللىك تەتقىقاتىدىكى قىزىق تېما بولۇپ ، گېننىڭ ئىپادىلىنىشى ۋە فېنو تىپىك ئالاھىدىلىكى بىلەن زىچ مۇناسىۋەتلىك.RRBS DNA مېتىل تەتقىقاتىنىڭ توغرا ، ئۈنۈملۈك ۋە تېجەشلىك ئۇسۇلى.تەشۋىق قىلغۇچى ۋە CpG ئارال رايونلىرىنى فېرمېنتلىق ئايرىش (Msp I) ئارقىلىق بېسۇلفىت تەرتىپى بىلەن بىرلەشتۈرۈپ ، يۇقىرى ئېنىقلىقتىكى DNA مېتىل بايقاش بىلەن تەمىنلەيدۇ.
سۇپا: Illumina NovaSeq 6000
