page_head_bg

مەھسۇلاتلار

Metagenomic Sequencing-Nanopore

مېتاگېنومىكا مۇھىت ئەۋرىشكىسىدىن ئېلىنغان ئارىلاشما گېن ماتېرىياللىرىنى ئانالىز قىلىشتا ئىشلىتىلىدىغان مولېكۇلا قورالى بولۇپ ، ئۇ جانلىقلارنىڭ كۆپ خىللىقى ۋە موللىقى ، نوپۇس قۇرۇلمىسى ، فىلوگېنتىك مۇناسىۋەت ، فۇنكسىيە گېنى ۋە مۇھىت ئامىلى بىلەن باغلىنىش تورى قاتارلىق تەپسىلاتلارنى تەمىنلەيدۇ. to metagenomic studies.ئۇنىڭ ئوقۇش ئۇزۇنلۇقىدىكى كۆرۈنەرلىك ئىپادىسى تۆۋەن ئېقىندىكى مېتاگېنومىيىلىك ئانالىزنى كۈچەيتتى ، بولۇپمۇ مېتاگېنوم قۇراشتۇرۇش.ئوقۇش ۋاقتىدىكى ئەۋزەللىكلەردىن پايدىلىنىپ ، نانوپورنى ئاساس قىلغان مېتاگېنومىيىلىك تەتقىقات مىلتىق مېتاگېنومىكىسىغا سېلىشتۇرغاندا تېخىمۇ ئۇدا قۇراشتۇرۇشنى ئەمەلگە ئاشۇرالايدۇ.نانوپورنى ئاساس قىلغان مېتاگېنومىيىلىكنىڭ مىكروبومدىن مۇۋەپپەقىيەتلىك ۋە يېپىق باكتېرىيە گېنلىرىنى مۇۋەپپەقىيەتلىك ھاسىل قىلغانلىقى ئېلان قىلىندى (موس ، EL قاتارلىقلار.Nature Biotech, 2020)

سۇپا :Nanopore PromethION P48


مۇلازىمەت تەپسىلاتلىرى

Demo Results

BMK دېلوسى

مۇلازىمەت ئەۋزەللىكى

Øئەلا سۈپەتلىك قۇراشتۇرۇش - جانلىقلارنى پەرقلەندۈرۈش ۋە فۇنكسىيەلىك گېننىڭ توغرىلىقىنى ئاشۇرۇش

Øيېپىق باكتېرىيە گېنلىرىنى ئايرىۋېتىش

Øكۆپ خىل رايونلاردا تېخىمۇ كۈچلۈك ۋە ئىشەنچلىك قوللىنىش ، مەسىلەن كېسەللىك قوزغاتقۇچى مىكرو ئورگانىزملارنى ياكى ئانتىبىئوتىكلارغا قارشى تۇرۇش گېنىنى بايقاش

Øسېلىشتۇرما مېتاگېنوم ئانالىزى

مۇلازىمەت ئۆلچىمى

تەرتىپلەشسۇپا

كۈتۈپخانا

تەۋسىيە قىلىنغان سانلىق مەلۇمات

مۆلچەرلەنگەن بۇرۇلۇش ۋاقتى

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50K / 100K / 300K خەتكۈچ

30 كۈن

Bioinformatics analyses

üخام ماتېرىيال سۈپىتىنى كونترول قىلىش

üMetagenome assembly

üئارتۇقچە گېن گۇرۇپپىسى ۋە ئىزاھاتى

üتۈرلەرنىڭ كۆپ خىللىقىنى تەھلىل قىلىش

üئىرسىيەت ئىقتىدارىنىڭ كۆپ خىللىقىنى تەھلىل قىلىش

üگۇرۇپپىلار ئارا تەھلىل

üتەجرىبە ئامىللىرىغا قارشى جەمئىيەت ئانالىزى

2

ئۈلگە تەلەپ ۋە يەتكۈزۈش

ئۈلگە تەلەپ ۋە يەتكۈزۈش

ئەۋرىشكە تەلەپلىرى:   

ForDNA جەۋھىرى:

ئۈلگە تىپى

سومما

مەركەزلىشىش

ساپلىق

DNA جەۋھىرى

> 30 ng

> 1 ng / μl

OD260 / 280 = 1.6-2.5

مۇھىت ئەۋرىشكىسى ئۈچۈن:

ئۈلگە تىپى

ئەۋرىشكە ئېلىش تەرتىپىنى تەۋسىيە قىلىمىز

تۇپراق

ئەۋرىشكە ئېلىش مىقدارى: تەخمىنەن.5 g;قالدۇق ماددىلارنى يەر يۈزىدىن چىقىرىۋېتىش كېرەك.چوڭ پارچىلارنى ئېزىپ 2 مىللىمېتىر سۈزگۈچتىن ئۆتۈڭزاكاس قىلىش ئۈچۈن ستېرېئولۇق EP-tube ياكى cyrotube دىكى Aliquot ئەۋرىشكىسى.

چوڭ تەرەت

ئەۋرىشكە ئېلىش مىقدارى: تەخمىنەن.5 g;زاكاس قىلىش ئۈچۈن ستېرېئولۇق EP- تۇرۇبا ياكى كرىستالدىن ئەۋرىشكە يىغىش ۋە تەقلىد قىلىش.

ئۈچەيدىكى مەزمۇنلار

ئەۋرىشكەلەرنى ئاسېپتىك ھالەتتە بىر تەرەپ قىلىش كېرەك.يىغىلغان توقۇلمىلارنى PBS بىلەن يۇيۇش.PBS نى مەركەزلەشتۈرۈپ EP تۇرۇبىسىدىكى چۆكمىلەرنى يىغىڭ.

Sludge

ئەۋرىشكە ئېلىش مىقدارى: تەخمىنەن.5 g;زاكاس قىلىش ئۈچۈن ستېرېئولۇق EP- تۇرۇبا ياكى كىرئالغۇدا لاي ئەۋرىشكىسىنى يىغىش ۋە يىغىش

Waterbody

تۇرۇبا سۈيى ، قۇدۇق سۈيى قاتارلىق چەكلىك مىقداردا مىكروب بار ئەۋرىشكە ئۈچۈن كەم دېگەندە 1 L سۇ يىغىپ ، 0.22 مىللىمېتىر سۈزگۈچتىن ئۆتۈپ ، پەردىدىكى مىكروبلارنى موللاشتۇرۇڭ.پەردىسىنى تۇراقسىز تۇرۇبىدا ساقلاڭ.

تېرە

تېرە يۈزىنى ئېھتىياتسىزلىقتىن پاختا پاختا ياكى ئوپېراتسىيىلىك تىغ بىلەن سۈرتۈپ ، ئۇنى تۇراقسىز تۇرۇبىغا قويۇڭ.

تەۋسىيە قىلىنغان ئەۋرىشكە يەتكۈزۈش

ئەۋرىشكەلەرنى سۇيۇق ئازوتتىكى 3-4 سائەت توڭلىتىڭ ھەمدە سۇيۇق ئازوت ياكى -80 گرادۇسلۇق ساقلاش كېرەك.قۇرۇق مۇز بىلەن ئەۋرىشكە توشۇش تەلەپ قىلىنىدۇ.

مۇلازىمەت خىزمىتى ئېقىمى

logo_02

ئۈلگە يەتكۈزۈش

logo_04

كۈتۈپخانا قۇرۇلۇشى

logo_05

تەرتىپلەش

logo_06

سانلىق مەلۇمات ئانالىزى

logo_07

سېتىشتىن كېيىنكى مۇلازىمەتلەر


  • ئالدىنقى:
  • كېيىنكى:

  • 1. ئىسسىقلىق خەرىتىسى: بايلارنىڭ توپلىنىشى32. ئىقتىدار گېنى KEGG مېتابولىزم يولىغا ئىزاھلانغان43. ئالاھىدە باغلىنىش تورى54. CARD ئانتىبىئوتىكقا قارشى تۇرۇش گېنىنىڭ سېرىكلىرى
    6

    BMK دېلوسى

    نانوپور مېتاگېنومىيەسى باكتېرىيەنىڭ تۆۋەن نەپەس يولى يۇقۇملىنىشىنى تېز كلىنىكىلىق دىئاگنوز قويالايدۇ

    ئېلان قىلىنغان:تەبىئەت بىئوتېخنىكا ، 2019-يىل

    تېخنىكىلىق يارقىن نۇقتىلار
    رەت تەرتىپى: Nanopore MinION
    كلىنىكىلىق مېتاگېنومىيىلىك بىئولوگىيىلىك ئۇچۇر: ساھىبجامال DNA نىڭ خورىشى ، WIMP ۋە ARMA ئانالىزى
    تېز بايقاش: 6 سائەت
    يۇقىرى سەزگۈرلۈك:% 96.6

    ئاچقۇچلۇق نەتىجىلەر

    2006-يىلى ، تۆۋەن نەپەس يولى يۇقۇملىنىش (LR) دۇنيا مىقياسىدا 3 مىليون ئادەمنىڭ ئۆلۈشىنى كەلتۈرۈپ چىقاردى.LR1 كېسەللىك قوزغاتقۇچنى بايقاشنىڭ تىپىك ئۇسۇلى تېرىقچىلىق بولۇپ ، سەزگۈرلۈكى ناچار ، ئۇزۇن ۋاقىت بۇرۇلۇش ۋە بالدۇر ئانتىبىئوتىك داۋالاشتا يېتەكلەش كەمچىل.تېز ۋە توغرا مىكروبقا دىئاگنوز قويۇش ئۇزۇندىن بۇيان جىددىي ئېھتىياج بولۇپ كەلدى.شەرقىي ئانگلىيا ئۇنۋېرسىتىتىدىكى دوكتور جاستىن ۋە ئۇنىڭ شېرىكلىرى كېسەللىك قوزغاتقۇچنى بايقاشتا نانوپورنى ئاساس قىلغان مېتاگېنومىيىلىك ئۇسۇلنى مۇۋەپپەقىيەتلىك تەتقىق قىلدى.ئۇلارنىڭ خىزمەت تەرتىپىگە ئاساسلانغاندا ،% 99.99 ساھىبجامال DNA نى خورىتىۋېتىدۇ.كېسەللىك قوزغاتقۇچى ۋە ئانتىبىئوتىكقا چىداملىق گېننى بايقاشنى 6 سائەت ئىچىدە تاماملىغىلى بولىدۇ.

    پايدىلانما
    Charalampous, T., Kay, GL, Richardson, H., Aydin, A., & O'Grady, J.(2019).نانوپور مېتاگېنومىيىسى باكتېرىيە تۆۋەن نەپەس يولى يۇقۇملىنىشىنى تېز كلىنىكىلىق دىئاگنوز قويالايدۇ.تەبىئەت بىئوتېخنىكا ، 37 (7) ، 1.

    باھاغا ئېرىشىش

    ئۇچۇرىڭىزنى بۇ يەرگە يېزىڭ ۋە بىزگە ئەۋەتىڭ

    ئۇچۇرىڭىزنى بىزگە ئەۋەتىڭ: