پۈتۈن ترانسكرىپسىيە تەرتىپى - ئىللۇمىنا
مۇلازىمەت ئەۋزەللىكى
Øھېسابلاش ، ئىپادىلەش ۋە خروموسومنى ئاساس قىلغان نىسپىي ئىپادىلەش جەھەتتە ھەر خىل RNA لارنى مۆلچەرلەش
Øئوخشىمىغان ئىپادىلەنگەن RNA لارنى پەرقلەندۈرۈش ۋە ماس ئىپادىلەش
Øگېن ئورتاق ئىپادىلەش ئانالىزى
ØceRNA تورىنى تەھلىل قىلىش
Øئاچقۇچلۇق گېن يولنى تەھلىل قىلىشقا چېتىلىدۇ
ØBMKCloud نى ئاساس قىلغان نەتىجىنى يەتكۈزۈش: سۇپادا خاسلاشتۇرۇلغان سانلىق مەلۇمات قېزىش.
Øسېتىلغاندىن كېيىنكى مۇلازىمەت تۈر تاماملانغاندىن كېيىن 3 ئاي كۈچكە ئىگە
ئۈلگە تەلەپ ۋە يەتكۈزۈش
ئەۋرىشكە تەلەپلىرى:
Nucleotides:
| ساپلىق | سەمىمىيەت | بۇلغىنىش | سومما |
| OD260 / 280≥1.7-2.5 ； OD260 / 230≥0.5-2.5 ； | ئۆسۈملۈكلەر ئۈچۈن: RIN≥6.5;ھايۋانلار ئۈچۈن: RIN≥7;28S / 18S≥1.0;ئاساسىي ئېگىزلىكى چەكلىك ياكى يوق | گېلىدا كۆرسىتىلگەن ئاقسىل ياكى DNA نىڭ بۇلغىنىشى چەكلىك ياكى يوق. | Conc.≥100 ng / μl;توم ≥ 10 μl;ئومۇمىي ≥ 2 μg |
توقۇلما: ئېغىرلىقى (قۇرۇق): ≥1 g
* 5 مىللىگىرامدىن كىچىك توقۇلمىلارغا چاقماق توڭلىتىلغان (سۇيۇق ئازوتتا) توقۇلما ئەۋرىشكىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.
كاتەكچە توختىتىش: ھۈجەيرە سانى = 3 × 107
* توڭلىتىلغان ھۈجەيرە لەيلىسىنى ئەۋەتىشنى تەۋسىيە قىلىمىز.ھۈجەيرە سانى 5 × 105 دىن كىچىك بولسا ، سۇيۇق ئازوتتا توڭلىتىلغان چاقماق تەۋسىيە قىلىنىدۇ.
قان ئەۋرىشكىسى:
PA × geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ۋە 2mL قان (TRIzol: قان = 3: 1)
تەۋسىيە قىلىنغان ئەۋرىشكە يەتكۈزۈش
كونتېينېر:
2 مىللىلېتىر سېنترىفۇگ تۇرۇبىسى (قەلەي ياپقۇچ تەۋسىيە قىلىنمايدۇ)
ئۈلگە بەلگە: گۇرۇپپا + كۆپەيتىش مەسىلەن A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
مال ئەۋەتىش:
1. قۇرغاق مۇز: ئەۋرىشكەلەرنى خالتىغا قاچىلاش ۋە قۇرۇق مۇزغا كۆتۈرۈش كېرەك.
2. RNA تۇراقلىق تۇرۇبا: RNA ئەۋرىشكىسىنى RNA تۇراقلاشتۇرۇش تۇرۇبىسىدا قۇرۇتقىلى بولىدۇ (مەسىلەن RNAstable®) ھەمدە ئۆي تېمپېراتۇرىسىدا توشۇشقا بولىدۇ.
مۇلازىمەت خىزمىتى ئېقىمى
تەجرىبە لايىھىسى
ئۈلگە يەتكۈزۈش
RNA ئېلىش
كۈتۈپخانا قۇرۇلۇشى
تەرتىپلەش
سانلىق مەلۇمات ئانالىزى
سېتىشتىن كېيىنكى مۇلازىمەتلەر
Bioinformatics
 |
1. نىسپىي ئىپادىلەشنى ئاساس قىلغان ھەر خىل RNA لارنى باھالاش
RNA ئىپادىسىدىكى ئوخشىماسلىقنىڭ ئەھمىيىتى توغرىسىدىكى سېركلار
2. بىر گەۋدىلەشتۈرۈلگەن KEGG يولى تورى
توپلاشتۇرۇلغان KEGG يولى تورى
3.ceRNA تور ئانالىزى
ceRNA تورىنى ئاساس قىلغان DE-circRNA-miRNA-mRNA ئۆز-ئارا تەسىر
BMK دېلوسى
CircRNA ئىپادىلەش ئەندىزىسى ۋە ceRNA ۋە miRNA - mRNA تورلىرى Brassica لاگېرىنىڭ CMS لىنىيىسىدىكى باشقا تەرەققىياتقا قاتناشقان
ئېلان قىلىنغان:خەلقئارالىق مولېكۇلا ئىلمى Journal ，2019
NONMMUT015812-knockdown KP (shRNA-2) ھۈجەيرىلىرى ۋە سەلبىي كونترول (sh-Scr) ھۈجەيرىلىرى 6-كۈنى مەلۇم ۋىرۇس بىلەن يۇقۇملانغان.
ئاچقۇچلۇق نەتىجىلەر
بۇ تەتقىقات پولىسما سىپوپلازما ئەرلەرنىڭ تۇغماسلىق (CMS) لىنىيىسىنى «Bcpol97-05A» ۋە مۇنبەت سىزىق «Bcajh97-01B» قىلىپ قۇرۇپ چىقتى.chinensis Makino, syn.B. rapa ssp.chinensis ، ھەمدە RNA ئىپادىلەش ئارقىلىق ستېرېئولۇق سىزىقنىڭ گۈل بىخلىرى ۋە مۇنبەت سىزىقنىڭ پۈتۈن خاتىرىلەش تەرتىپى بويىچە سېلىشتۇرۇپ سېلىشتۇردى.
1. جەمئىي 31 ئوخشىمىغان ئىپادىلەنگەن (DE) ئايلانما RNA ، 47 DE miRNA ۋە 4779 DE mRNA ئېنىقلاندى.
2. گېن ئونتولوگىيەسى (GO) ئانالىزىدا DE گېنىنىڭ كۆپىنچىسى گۈل چېڭىنىڭ تەرەققىياتىغا قاتناشقانلىقى كۆرسىتىلدى
3. DE mRNAs نىڭ KEGG يولىنى بېيىتىش ئانالىزى (مۇنبەت لىنىيىگە سېلىشتۇرغاندا ستېرېئول لىنىيىسىدىكى تەڭشەلگەن ۋە كونترول قىلىنىدىغان MRNA نى ئۆز ئىچىگە ئالىدۇ) نىڭ كۆرسىتىشىچە ، «كراخمال ۋە ساكروسېمېتابولىزم» ، «فېنىلپروپانوئىد بىئوسىنتېز» ۋە «پېنتوزا ۋە گلۇكورونات ئۆز-ئارا تەسىر». »ئەڭ مول بولغان مېتابولىزم يولى.
 ئوخشىمىغان ئىپادىلەنگەن mRNA لارنى KEGG يولىنى بېيىتىش ئانالىزى |  ئوخشىمىغان ئىپادىلەنگەن mRNA لارنىڭ گېن ئونتولوگىيەسى (GO) تۈرگە ئايرىلىشى |  DEcircRNA - DEmiRNA - DEmRNA ئۈچ تورنىڭ كۆرۈنۈشى |
پايدىلانما
لياڭ ي ، جاڭ ي ، شۈ ل قاتارلىقلار.CircRNA ئىپادىلەش ئەندىزىسى ۋە ceRNA ۋە miRNA - mRNA تورلىرى Brassica لاگېرىنىڭ CMS لىنىيىسىدىكى باشقا تەرەققىياتقا قاتناشقان.خەلقئارالىق مولېكۇلا ئىلمى ژورنىلى ، 2019 ، 20 (19): 4808-.DOI ： 10.3390 / ijms20194808
