Просторовий транскриптом BMKMANU S1000
Технічна схема просторового транскриптому BMKMANU S1000
Переваги BMKMANU S1000
1) Субклітинна роздільна здатність: кожна область захоплення містила >2 мільйонів просторових штрих-кодованих плям діаметром 2,5 мкм і відстанню 5 мкм між центрами плям, що дає змогу аналізувати просторовий транскриптом із субклітинною роздільною здатністю (5 мкм).
2) Багаторівневий аналіз роздільної здатності: гнучкий багаторівневий аналіз у діапазоні від 100 мкм до 5 мкм для визначення різноманітних особливостей тканини з оптимальною роздільною здатністю.
3) Комплексне профілювання транскриптомів: можна аналізувати транскрипти, отримані з цілого слайда тканини, без обмежень щодо кількості цільових генів і цільової області.
Специфікації послуги
| Бібліотека | Стратегія секвенування | Рекомендований вихід даних |
| Бібліотека кДНК S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Гб/зразок |
Зразок вимог
| Зразок | Номер | Розмір | Якість РНК |
| ОКТ вбудований тканинний блок | 2-3 блоки/зразок | прибл.6,8x6,8x6,8 мм3 | RIN≥7 |
Щоб отримати докладніші відомості про інструкції з підготовки зразків і робочий процес обслуговування, будь ласка, не соромтеся поговорити з aЕксперт BMKGENE
Потік роботи служби
Дизайн експерименту
Доставка зразків
Попередній експеримент
Просторове штрихове кодування
Будівництво бібліотеки
Секвенування
Аналіз даних
Післяпродажне обслуговування
Дані, згенеровані BMKMANU S1000, аналізуються за допомогою програмного забезпечення «BSTMatrix», яке було незалежно розроблено BMKGENE, включаючи:
1) Генерація матриці експресії генів
2) HE обробка зображень
3) Сумісний із подальшим стороннім програмним забезпеченням для аналізу
4) Онлайн «BSTViewer» допомагає отримати результати візуалізації в різних дозволах.
1. Точкове кластеризування
2.Просторовий розподіл
Nпримітка: резолюціярівень=13 (100 мкм, ліворуч); 7 (50 мкм, правильно)
3. Теплова карта кластеризації достатку виразу маркера
4. Міжвибірковий аналіз даних
